Синтения мен коллинеарлықтың негізгі айырмашылығы мынада: синтения - бұл түрлердегі бір хромосомадағы генетикалық локустардың физикалық колокализациясы, ал коллинеарлылық - әртүрлі түрлердегі бір хромосомадағы генетикалық локустардың физикалық колокализациясы. бірдей тапсырыс.
Синтения және коллинеарлық геномикада бірінің орнына қолданылатын екі термин. Екі термин де әртүрлі түрлердегі хромосомалардағы гендердің локализациясының үлгілерін сипаттайды. Таксондар арасындағы бұл байланысты гендік орналасулар гендердің ортақ ата-тегі туралы қорытынды жасау кезінде құнды ақпарат болып табылады. Синтения түрлердегі бір хромосомадағы генетикалық локустардың физикалық колокализациясын білдіреді. Коллинеарлылық бір ретті сақтай отырып, әртүрлі түрлердегі бір хромосомадағы генетикалық локустардың физикалық колокализациясын білдіреді. Сондықтан бұл синтенияның бір түрі.
Синтения дегеніміз не?
Әртүрлі түрлерде бір хромосомада орналасқан гендер жиынтығы болады. Әртүрлі түрлердегі бір хромосомадағы гендердің физикалық колокализациясы синтения деп аталады. Сондай-ақ, бұл гендер бір хромосомада бір-біріне өте жақын орналасқан. Гендердің реті міндетті түрде бірдей болмауы мүмкін. Бірақ бір хромосомадағы гендердің бір-біріне жақын орналасуы синтенияда жүреді. Сондықтан синтения негізінен хромосомадағы гендердің таралу заңдылығын сипаттайды. Гендердің колокализациясының бұл үлгілері әртүрлі түрлер мен олардың эволюциясы арасындағы қарым-қатынасты көрсетеді. Дегенмен, транслокациялар, инверсия және хромосомалардың бірігуі және т.б. қайталанулар, жоғалту және тең емес гомологтық рекомбинация сияқты хромосомалық қайта құруларға байланысты синтения бұзылуы мүмкін.
01-сурет: Synteny
Барлық байланысқан гендер синтеникалық деп саналады. Дегенмен, барлық синтендік гендер міндетті түрде байланысты емес. Олардың жалпы хромосома тізбегі бар. Адамдарда басқа сүтқоректілермен көптеген синтендік гендер бар. Оның үстіне көптеген дәнді дақылдарда синтендік гендер бар.
Коллинеарлық дегеніміз не?
Коллинеарлылық – гендердің жиынтығы әртүрлі түрлердің бір хромосомасында тектік түрдегідей ретпен орналасатын синтенияның ерекше түрі. Демек, коллинеарлықтан ауытқу болса, ол сенімдірек филогенетикалық сипатқа ие болады, өйткені коллинеарлық гендердің ортақ шығу тегін түсіндіреді.
02-сурет: коллинеарлық
Көпжақты коллинеарлық талдау туыс түрлер мен олардың филогенезі туралы әлдеқайда сенімді ақпарат береді.
Синтения мен коллинеарлықтың қандай ұқсастықтары бар?
- Синтенияда да, коллинеарлықта да екі түрлі түрдегі локустар жиынтығы бір хромосомада орналасады.
- Бұл терминдер бір хромосомадағы генетикалық локустардың физикалық колокализациясын сипаттайды.
- Коллинеарлылық - синтенияның ерекше түрі.
- Кейде екі термин де геномикада бірінің орнына қолданылады.
- Екі аймақ коллинеарлы болса, олар синтенус екені анық.
- Олар филогенезді анықтауда пайдалы.
Синтения мен коллинеарлықтың айырмашылығы неде?
Синтения және коллинеарлық геномикада бірінің орнына қолданылатын екі термин. Синтения әр түрдегі бір хромосомадағы гендер жиынтығының физикалық колокализациясын білдіреді. Коллинеарлылық - гендердің жиынтығы әртүрлі түрлер арасында бір ретпен бірге орналасатын синтенияның түрі. Сондықтан бұл синтения мен коллинеарлықтың негізгі айырмашылығы.
Қорытынды – Synteny және Collinearity
Синтения және коллинеарлылық терминдері әртүрлі түрлерде бір хромосомада орналасқан гендер жиынтығын білдіреді. Шын мәнінде, бұл гендер әртүрлі түрлерде бір хромосомада бірге орналасады. Синтения әртүрлі түрлердегі бір хромосомадағы жиынтық гендердің физикалық колокализациясын сипаттайды, ал коллинеарлылық - гендердің жиынтығы бір ретпен бірге локализацияланатын синтенияның ерекше түрі. Осылайша, бұл синтения мен коллинеарлық арасындағы айырмашылықты қорытындылайды.
