Цис пен транс сплайсинг арасындағы негізгі айырмашылық мынада: цис сплайсинг интрондарды жояды және бір РНҚ транскриптіндегі экзондарды біріктіретін молекулаішілік механизм, ал транс-сплайсинг интрондарды немесе аутрондарды жоятын молекулааралық механизм және бір РНҚ транскрипциясына кірмейтін экзондарға қосылады.
РНҚ сплайсинг - ақуыз синтезіне дейін РНҚ өңдеу түрі. Бұл процесте жаңадан жасалған алдын ала хабаршы РНҚ транскрипті жетілген хабаршы РНҚ-ға айналады. Жетілген хабаршы РНҚ ақуыз молекуласын жасауға көмектеседі. РНҚ қосылуы кезінде интрондар (кодаланбайтын аймақтар) жойылады, ал экзондар (кодтау аймақтары) жетілген мРНҚ жасау үшін біріктіріледі. Cis және trans splicing - бұл РНҚ сплайсинг механизмдерінің екі түрі.
Cis Splicing дегеніміз не?
Cis сплайсинг – интрондарды алып тастайтын және бір РНҚ транскриптіндегі экзондарды қосатын молекулаішілік механизм. Қалыпты цис сплайсинг бір РНҚ молекуласын өңдейді. Cis сплайсинг - бұл сплайсосомалар жүзеге асыратын премРНҚ-ның әдеттегі сплайсинг процесі. Интронда донорлық учаске (интронның 5' соңы), тармақтық учаске (интронның 3' соңына жақын) және акцепторлық учаске (интронның 3' соңы) сплайсинг үшін өте маңызды. Сплайс донорлық учаскесі интронның 5' соңындағы инвариантты GU тізбегін қамтиды. Интронның 3' соңындағы сплайс қабылдаушы учаскесінде инвариантты AG тізбегі бар. AG тізбегінен жоғары қарай пиримидиндік аймақ (полипиримидиндік жол) деп аталатын аймақ бар. Полипиримидин жолынан әрі қарай жоғары қарай аденозин нуклеотидін қамтитын тармақтық нүкте бар. Бұл нуклеотид лариат түзуге қатысады.
01-сурет: Cis және Trans Splicing
Негізгі спликеосомалар - U1, U2, U4, U5 және U6. Олардың ішінде U1 және U2 өте маңызды. Цис сплайсингінде U1 5' қосылатын жермен, ал U2 3' қосылатын жердің жанындағы тармақтық нүктемен байланысады. U5/U4/U6 экзондарды 5' орнында, U6 U2-мен байланыстырады. Кейінірек U1 шығарылады. U5 экзоннан интронға ауысады, ал U6 5' қосылыс орнында байланысады. Сонымен қатар, U4 шығарылды. U6/U2 интрон лигатының 5' ұшын интрондағы А нуклеотидіне айналдырып, трансэтерификацияны катализдейді. Бұл лариат түзілуін тудырады. Лариаттың пайда болуында U5 экзонды 3' қосылыс орнында байланыстырады, ал 5' учаскесі үзіледі. Сплайстың соңғы фазасында U2/U5/U6 лариатпен байланысып қалады, ал 3' учаскесі үзіледі. Бұған қоса, осы фазада АТФ гидролизі арқылы экзондар байланыстырылады.
Транс Сплайсинг дегеніміз не?
Транссплайсинг – интрондарды немесе аутрондарды алып тастайтын және бір РНҚ транскрипциясына кірмейтін экзондарды қосатын молекулааралық механизм. Трансплайсингте U1 протеинінің байланысуы үшін премРНҚ молекуласында 5' сплайс орны жоқ. Оның орнына тығындалған сплайс көшбасшысы (SL) РНҚ аутрондағы реттілікке трансплантацияланады.
02-сурет: трансплайсинг
Оутрон - 5' қақпақ пен транспланс аймағы арасындағы премРНҚ аймағы. Дегенмен, U2 протеині әдетте 3' қосылатын жермен байланысады. Аутронды алып тастағаннан кейін сплайс көшбасшысы (SL) экзоны премРНҚ-дағы бірінші экзонға қосылады. Сонымен қатар, транс-сплайсинг гендерді экспрессиялау үшін Kinetoplastae класының протистері сияқты кейбір микроорганизмдерде байқалатын механизм болып табылады.
Cis және Trans Splicing арасындағы қандай ұқсастықтар бар?
- Cis және транс сплайсинг - РНҚ сплайсинг механизмдерінің екі түрі.
- Екі механизмде де интрондар жойылады.
- Сонымен қатар екі механизмде де экзондар біріктіріліп, жетілген мРНҚ түзіледі.
- Екі механизм де эукариоттарда кездеседі.
- Бұл механизмдер прокариоттарда жоқ.
Cis және Trans Splicing арасындағы айырмашылық неде?
Cis сплайсинг – интрондарды алып тастайтын және бір РНҚ транскриптіндегі экзондарды қосатын молекулаішілік механизм, ал транс-сплайсинг – интрондарды немесе аутрондарды алып тастайтын және бір РНҚ ішінде емес экзондарды қосатын молекулааралық механизм. транскрипт. Сонымен, бұл cis және trans splicing арасындағы негізгі айырмашылық. Сонымен қатар, цис сплайсингінде жетілген мРНҚ қалыптастыру үшін интрондар жойылады. Екінші жағынан, транспласингте интрондар немесе аутрондар жетілген мРНҚ түзу үшін жойылады.
Келесі инфографикада cis және trans splicing арасындағы айырмашылықтар қатар салыстыру үшін кесте түрінде берілген.
Қорытынды – Cis және Trans Splicing
РНҚ сплайсингі – ақуыз синтезі процесіне дейін РНҚ өңдеу түрі. Cis және транс сплайсинг - эукариоттарда кездесетін РНҚ-ны біріктіру механизмдерінің екі түрі. Цис сплайсинг – интрондарды алып тастайтын және бір РНҚ транскриптінде орналасқан экзондарды біріктіретін молекулаішілік механизм, ал транс-сплайсинг – интрондарды немесе аутрондарды алып тастайтын және бір РНҚ транскриптінде жоқ экзондарды қосатын молекула аралық механизм. Осылайша, бұл cis және trans splicing арасындағы айырмашылықты талқылауды аяқтайды.
