Негізгі айырмашылық – жоғары және төмен ағын ДНҚ
Жоғарғы және төменгі ағындағы ДНҚ арасындағы айырмашылықты түсіну үшін ДНҚ құрамы мен құрылымы туралы жалпы білімнің болуы маңызды. ДНҚ полинуклеотидтік тізбектерден тұрады. Нуклеотидтер полинуклеотидтік тізбектерді жасайтын құрылыс блоктары болып табылады және әрбір нуклеотид үш компоненттен тұрады: бес көміртекті қант, азотты негіз және фосфат тобы. Нуклеотидтегі қант молекуласының 5' позициясындағы көміртегі мен OH тобы сәйкесінше фосфат тобы және OH тобы бекітіледі. Нуклеотидтер бір нуклеотидтің 5' фосфат тобы мен көрші нуклеотидтің 3' ОН тобы арасында түзілген фосфодиэфирлік байланыстар арқылы қосылады. Егер полинуклеотидтік тізбекте бос 5' фосфат тобы болса, ол 5' соңы ретінде тағайындалады; егер оның бос 3' OH тобы болса, ол 3' соңы ретінде тағайындалады. Сондықтан ДНҚ жіптерінің әдетте полинуклеотидтік тізбектердің соңғы орындарына сәйкес 5' және 3' ұштары болады. ДНҚ қос тізбекті түрінде де бар. Екі жіп бір-біріне қарсы параллель. Демек, ДНҚ-да 5'-ден 3'-ге дейін және 3'-ден 5'-ке дейін жүретін екі жіп бар. Жоғары және төменгі ағындағы ДНҚ 5' - 3' мРНҚ тізбегінің транскрипциясы мен синтезіне сілтеме жасайды. Егер ДНҚ транскрипцияны бастау орнынан кодтау тізбегінің 5 ұшына қарай қарастырылса, ол жоғары ағын ДНҚ деп аталады. Егер ДНҚ транскрипцияның басталу орнынан кодтау тізбегінің 3' ұшына қарай қарастырылса, төменгі ағын ДНҚ деп аталады. Бұл жоғары және төменгі ДНҚ арасындағы негізгі айырмашылық.
Жоғарғы ДНҚ дегеніміз не?
Ген – ағзаның ДНҚ-сында орналасқан құрылымдық және функционалдық бірлік тұқым қуалаушылық. Ол ақуызды құрастыру нұсқауларымен бірге сақталады. Геннің ДНҚ молекуласының белгілі бір аймағы бар. Қажет болған жағдайда ол транскрипциялайды және мРНҚ тізбегінің синтезі арқылы ақуызға айналады. Әдетте геннің кодтау тізбегі 5'-ден 3' бағытқа дейін созылады. Ол транскрипцияланған кезде 5'-ден 3'-ге дейін бірдей бағытта мРНҚ тізбегін жасайды. Транскрипция кезінде 3'-ден 5'-ге дейінгі антисенс тізбегі шаблондық тізбек ретінде қызмет етеді және мРНҚ синтезін бастайды. Генде транскрипцияның басталу орны бар. Транскрипцияның басталу орнына сілтеме жасай отырып, кодтау тізбегінің 5' соңына қарай ДНҚ аймағы жоғары ағын ДНҚ деп аталады. Геннің промоторы әдетте ДНҚ-ның жоғары ағынында орналасқан. Эукариоттық гендерде генге дейінгі аймақта TATA қораптары, промоторлардың проксимальды элементтері және күшейткіштер бар. Геннің жоғарғы ағыны теріс сандармен белгіленеді. Транскрипция үшін геннің жоғарғы ДНҚ-сы өте маңызды.
Төменгі ДНҚ дегеніміз не?
Транскрипцияны бастау орны геннің +1 нүктесі ретінде белгілі. +1 нүктеден кодтау тізбегінің 3' соңына дейінгі ДНҚ аймағы төменгі ағын ДНҚ деп аталады. Басқаша айтқанда, геннің төменгі ағыны транскрипцияның басталу орнынан шаблон тізбегінің 5' соңына қарай болады. Демек, ген аймағының төменгі ағынындағы ДНҚ транскрипциялық бірлік пен терминатор тізбегі сияқты басқа тізбектерді қамтиды. Промотор геннің төменгі ағынына әсер ете алады. Геннің төменгі бөлігі оң сандармен белгіленеді. Геннің төменгі ДНҚ – ақуыз өнімін беретін нақты аймақ.
01-сурет: жоғары және төмен ағын ДНҚ
Жоғары және төменгі ағын ДНҚ-ның айырмашылығы неде?
Жоғары ағын және Төменгі ДНҚ |
|
| Транскрипцияны бастау орнынан кодтау тізбегінің 5' соңына қарай ДНҚ аймағы жоғарғы ағын ДНҚ деп аталады. | Транскрипцияның басталу аймағынан кодтау тізбегінің 3' соңына қарай ДНҚ аймағы төменгі ағын ДНҚ деп аталады. |
| Элементтер | |
| Промоторлар мен күшейткіштер жоғарғы ағын ДНҚ-да орналасқан | Транскрипция бірлігі және терминатор тізбегі төменгі ағындағы ДНҚ-да орналасқан. |
| Нөмірлеу | |
| Жоғарғы ағын аймағындағы нуклеотидтер теріс сандармен аталады | Нуклеотидтер оң сандармен белгіленеді. |
| Функция | |
| Бұл аймақта транскрипцияны реттеуге және бастауға қажетті элементтер бар | Бұл аймақта ақуыз өндіру және транскрипцияны тоқтату нұсқауы бар |
Қорытынды – Жоғары және Төменгі ДНҚ
РНҚ тізбегінің жоғары және төменгі ағынын анықтау оңай. Анықтамалық сайтқа келетін болсақ, РНҚ тізбегінің 5' соңына қарай аймақ жоғары ағындағы РНҚ деп аталады, ал 3' соңына қарай аймақ төменгі ағын РНҚ деп аталады. Дегенмен, ДНҚ-да 5'-тен 3'-ке дейін және 3'-ден 5'-ке дейін екі бағытта өтетін екі жіп бар. Демек, жоғары және төменгі ДНҚ арасындағы айырмашылық күрделі. Сондықтан ол геннің транскрипциясына байланысты сараланады. Транскрипцияның басталу орнынан сезім тізбегінің 5 соңына қарай ДНҚ аймағы жоғары ағын ДНҚ деп аталады, ал транскрипцияның басталу орнынан сезім тізбегінің 3' соңына қарай төменгі ағын ДНҚ деп аталады. Бұл ДНҚ-ның жоғары және төменгі ағынының арасындағы айырмашылық.
