CRISPR мен CRISPR Cas9 арасындағы негізгі айырмашылық мынада: CRISPR (кластерленген тұрақты интервалды қысқа палиндромды қайталау) табиғи түрде пайда болатын прокариоттық иммундық қорғаныс механизмі, ал CRISPR cas9 - CRISPR адаптивті бөлігі болып табылатын РНҚ басқаратын Cas9 нуклеазасы. иммундық жүйе.
CRISPR – бактериялар мен архейлерде кездесетін вирусқа қарсы қорғаныс иммундық жүйе. Бұл бактерия геномында кездесетін ДНҚ тізбегінің отбасы. Ол бұрын жұқтырған бактериофагтардың ДНҚ фрагменттерінен алынған аралық тізбектерден тұрады. Кейінгі вирустық инфекцияларда бактериялар вирустық ДНҚ-ны жою үшін осы тізбектерді пайдаланады. CRISPR тізбегінде қысқа палиндромдық қайталаулар мен аралық тізбегі бар. Сонымен қатар, CRISPR қайталанатын аралық тізбегінде көбінесе Cas протеиндерін кодтайтын байланысты гендер болады. Cas9 - бұл РНҚ басқарылатын эндонуклеаза. CRISPR тізбектерімен бірге Cas9 протеині бактерияларда бактериофагтарға қарсы бейімделгіш иммундық жүйе ретінде әрекет етеді.
CRISPR дегеніміз не?
CRISPR – Кластерленген тұрақты аралық қысқа палиндромдық қайталауларды білдіреді. Бұл бактерия геномында табылған ДНҚ тізбектерінің кластері. Ол бактерияларда табиғи қорғаныс механизмі ретінде жұмыс істейді және ол алғаш рет E. coli-де анықталған. Бактерияларда, әсіресе бактериофагтардан адаптивті иммундық қорғаныс қызметін атқарады. Демек, бұл жүйелілікке тән механизм.
01-сурет: CRISPR
CRISPR жүйесінде бірнеше қысқа сегменттелген ДНҚ қайталау тізбегі бар. Бұл қайталаулар 5'-тен 3'-ге дейін оқу кезінде бірдей негізгі реттілікке ие, ал екіншісі 3'-ден 5'-ке дейін оқу кезінде бірдей реттілік береді. Оның үстіне қайталаулар бірдей. Олар бірдей емес қысқа «аралық» ДНҚ тізбектерінің арасында орналасқан. Бірақ бұл аралық ДНҚ тізбегі бөтен бактериофаг ДНҚ-ға ұқсас немесе сәйкес келеді. CRISPR байланысты гендер CRISPR байланысты гендер немесе Cas гендері ретінде белгілі. Cas гендері геликаз немесе нуклеаза болып табылатын Cas ақуыздарын кодтайды. Геликазалар ДНҚ-ны босатады, ал нуклеазалар ДНҚ-ны кеседі. Жалпы, CRISPR қарастырғанда, бұл бактериофагтарға (вирустарды жұқтыратын бактериялар) қарсы жұмыс істейтін бактериялардың иммундық жүйесі.
CRISPR Cas9 дегеніміз не?
Cas9 немесе CRISPR байланысты протеин 9 бактериялық РНҚ басқаратын эндонуклеаза болып табылады. Демек, бұл бағыттаушы РНҚ-ға қосымша нысаналы ДНҚ-ны (әсіресе бактериофагтық ДНҚ) танитын және кесетін фермент. Ол жіпке тән ыдырауды жүзеге асырады. Cas9 протеині CRISPR байланысты генімен кодталған. CRISPR cas9 – геномды өңдеу, транскрипциялық бұзылу, эпигенетикалық модуляция және геномды бейнелеу үшін РНҚ-бағдарламаланатын ДНҚ мақсатты және өңдеу платформасы ретінде пайдаланылуы мүмкін РНҚ басқаратын CRISPR-Cas9 нуклеаза жүйесі. Бұл CRISPR cas9 жүйесі қазіргі геномды өңдеу жүйелерінде өте танымал.
02-сурет: CRISPR Cas9
Қазіргі уақытта CRISPR/Cas9 жүйесі транскрипциялық репрессия немесе белсендіру арқылы сүтқоректілердің геномын өзгерту немесе өзгерту үшін пайдаланылады. Сүтқоректілердің жасушалары қалпына келтіру механизмін қабылдау арқылы CRISPR/Cas9 делдалдық ДНҚ бұзылыстарына жауап бере алады. Оны гомологты емес ұшты біріктіру әдісі (NHEJ) немесе гомологияға бағытталған жөндеу (HDR) арқылы жасауға болады. Бұл жөндеу механизмінің екеуі де қос тізбекті үзілістерді енгізу арқылы орын алады. Бұл сүтқоректілердің генін редакциялауға әкеледі. NHEJ гендік мутациялардың абляциясына әкелуі мүмкін және функция әсерлерінің жоғалуын жасау үшін қолданылуы мүмкін. HDR белгілі бір нүктелік мутацияларды енгізу немесе әртүрлі ұзындықтағы ДНҚ сегменттерін енгізу үшін пайдаланылуы мүмкін. Қазіргі уақытта CRISPR/ Cas жүйесі терапевтік, биомедициналық, ауылшаруашылық және зерттеу қолданбалары салаларында қолданылады.
CRISPR және CRISPR Cas9 арасындағы қандай ұқсастықтар бар?
- Cas9 - CRISPR Cas жүйесінің бөлігі.
- Crisper ca9 жүйесі - табиғи түрде бактерияларда кездесетін иммундық жүйе.
CRISPR мен CRISPR Cas9 арасындағы айырмашылық неде?
CRISPR - бактериофагтарға қарсы табиғи қорғаныс жүйесі ретінде жұмыс істейтін бактерия геномында табылған ДНҚ тізбектерінің кластері. Ол тұрақты интервалды қысқа палиндромдық қайталаулардан, аралықтардан және байланысты гендерден тұрады. Керісінше, cas9 - бұл РНҚ-мен басқарылатын эндонуклеаза ферменті болып табылатын CRISPR байланысты 9 протеин. Ол вирустардың ДНҚ-ның қос тізбектерін танып, ажыратады. Шын мәнінде, бұл CRISPR қорғаныс жүйесінің бөлігі. Демек, бұл CRISPR мен CRISPR cas9 арасындағы негізгі айырмашылық.
Қорытынды – CRISPR және CRISPR Cas9
CRISPR Cas жүйесі микробқа қарсы қорғаныс жүйесі болып табылады. CRISPR - палиндромдық қысқа қайталанулардан, аралық тізбектерден және байланысты гендерден тұратын ДНҚ тізбектерінің кластері. Cas9 - бір Cas протеині, ол РНҚ басқарылатын эндонуклеаза. CRISPR және Cas9 протеині бактериялардағы бактериофаг инфекцияларына қарсы жұмыс істейтін иммундық жүйені құрайды. Cas9 протеині бөгде вирустық ДНҚ-ны ыдыратуға және оларды бұзуға қабілетті. CrRNA вирустық ДНҚ-ны тануға ca9-ды бағыттайды. Сондықтан CRISPR cas9 жүйесі - бұл вирустарға қарсы бактерияларда кездесетін табиғи иммундық жүйе. Осылайша, бұл CRISPR және CRISPR cas9 арасындағы айырмашылықтың қысқаша мазмұны.
