1D және 2D гельдік электрофорездің негізгі айырмашылығы гельдік электрофорезде белоктарды бөлу үшін қолданылатын қасиеттер болып табылады. 1D гель электрофорезі ақуыздарды молекулалық массасына қарай ғана бөледі, ал 2D гель электрофорезі белоктарды изоэлектрлік нүктесі мен молекулалық салмағына қарай бөледі.
Гельдік электрофорез арқылы ақуызды бөлу белоктарды сипаттаудың маңызды әдісі болып табылады. Белоктардың әртүрлі қасиеттері бар; сондықтан бөлу агарозды гель электрофорезі арқылы ДНҚ бөлуге қарағанда күрделірек.
1D гельдік электрофорез дегеніміз не?
1D Гель электрофорезі, сондай-ақ бір өлшемді гель электрофорезі ретінде белгілі, молекулалық салмаққа негізделген ақуызды бөлу әдісі. Ақуызды бөлу негізінен полиакриламидті гель электрофорезі арқылы жүзеге асады. Гельдік электрофорез концепциясына сүйене отырып, молекулалар молекулалық масса мен заряд қасиетіне қарай бөлінеді.
Сондықтан белоктарға біркелкі заряд беру үшін гельдік электрофорезге дейін натрий додецил сульфаты (SDS) өңдеу жүргізіледі. SDS белоктарды денатурациялайды және ақуызға біркелкі теріс зарядты береді; электр өрісінің қолданылуы орын алғанда, ақуыздар олардың молекулалық салмағына негізделген оң терминалға ауысады. Осылайша, бөлуде бір ғана қасиет қарастырылады. Сондықтан бұл әдіс 1D гельдік электрофорез деп аталады.
01-сурет: 1D гельдік электрофорез
1D гельдік электрофорез кезінде белоктар олардың молекулалық салмағына қарай бөлінеді. Осыған байланысты төмен салмақты молекулалар жоғары молекулалық салмақты ақуыздармен салыстырғанда гельде жылдамырақ қоныс аударады. Осылайша, салмағы жоғары ақуыздар ұңғымаларға жақын қалады.
2D гельдік электрофорез дегеніміз не?
2D гельдік электрофорез немесе екі өлшемді гель электрофорезі екі қасиетке негізделген белоктарды бөледі. Екі қасиет - ақуыздың изоэлектрлік нүктесі және молекулалық массасы. Ақуызды бөлудің бұл әдісі ақуызды бөлудің ажыратымдылығын арттырады. Ақуыздың изоэлектрлік нүктесі ақуыз бейтарап болатын рН-ға байланысты.
02-сурет: 2D гельдік электрофорез
Осылайша, 2D гельдік электрофорезде ақуыздың бірінші өлшемдегі бекітілген рН градиентінде жұмыс істеуіне рұқсат етіледі. Екінші өлшемде белоктар тік немесе көлденең полиакриламидті гель электрофорезі арқылы бөлінеді. Осылайша, ақуыздар екінші өлшемдегі молекулалық салмағына қарай бөлінеді.
Сонымен қатар, гельдік электрофорездің бұл әдісі ақуызды бөлудің ажыратымдылығын арттырады. Сондықтан бөлінген белоктар таза болады. Дегенмен, техниканың құны бір өлшемді гельдік электрофорезге қарағанда әлдеқайда жоғары.
1D және 2D гельдік электрофорездің қандай ұқсастықтары бар?
- Екі әдіс те ақуыздарды бөледі.
- Демек, олар белоктарды сипаттауда маңызды.
1D және 2D гельдік электрофорездің айырмашылығы неде?
1D және 2D гель электрофорезінің негізгі айырмашылығы мынада: 1D гель электрофорезі ақуыздарды тек молекулалық салмаққа байланысты бөледі, ал 2D гель электрофорезі белоктарды изоэлектрлік нүктеге және молекулалық салмаққа қарай бөледі. 1D және 2D гельдік электрофорез арасындағы осы негізгі айырмашылыққа байланысты белоктарды бөлу рұқсаты және екі әдістің құны да өзгереді.2D гель электрофорезі 1D гель электрофорезіне қарағанда жоғары ажыратымдылықты көрсетеді. Дегенмен, 2D гель электрофорезі 1D гель электрофорезіне қарағанда қымбатырақ.
Төмендегі инфографика 1D және 2D гель электрофорезі арасындағы айырмашылықты қорытындылайды.
Қорытынды – 1D және 2D гельдік электрофорез
Белоктардың бөлінуі көптеген факторларға байланысты. 1D гель электрофорезі ақуыздарды тек молекулалық массасына қарай бөледі. Дегенмен, екі өлшемді немесе 2D гельдік электрофорез ақуызды бөлудің рұқсатын арттырады. Әрі қарай, 2D гельдік электрофорез белоктарды изоэлектрлік нүктеге және молекулалық салмаққа қарай бөледі. Сондықтан бұл деректер белоктарды төменгі ағынды өңдеу үшін және протеомика саласында маңызды. Осылайша, бұл 1D және 2D гельдік электрофорез арасындағы айырмашылықтың қысқаша мазмұны.
