CGH мен CGH массивінің арасындағы негізгі айырмашылық мынада: CGH ажыратымдылығы төмен сынақ үлгісінің ДНҚ-дағы көшірме санының вариациясын талдауға арналған дәстүрлі молекулалық цитогенетикалық әдіс, ал CGH массиві толық автоматтандырылған молекулалық цитогенетикалық әдіс болып табылады. Ажыратымдылығы жоғары сынақ үлгісінің ДНҚ-дағы көшірме санының өзгеруін талдау.
CGH және CGH массиві - жеке адамдардағы көшіру санының ауытқуларын анықтаудың екі әдісі. Көшірме санының вариациясы геномның қайталанатын бөлімдерін білдіреді. Көшірме саны әр адамда әр түрлі болады. Көшіру санының вариациясы әдетте екі топқа бөлінеді: қысқа қайталаулар және ұзақ қайталаулар. Қысқа көшірме санының вариациясының ең танымал мысалдарының бірі хантингтин геніндегі CAG тринуклеотидінің қайталануы болып табылады. Бұл хантингтин деп аталатын неврологиялық ауруды тудырады. Ұзақ қайталанатын көшірме санының вариациясының ең жақсы мысалы инсулинге төзімділікті тудыратын альфа амилаза гені болып табылады. Көшіру санының өзгеруін FISH, CGH және CGH массиві сияқты әдістер арқылы анықтауға болады.
CGH дегеніміз не?
CGH – эталондық үлгімен салыстырғанда сынақ үлгісінің ДНҚ-дағы көшірме санының өзгеруін талдауға арналған дәстүрлі молекулалық цитогенетикалық әдіс. Оның автоматтандырылған техникамен салыстырғанда ажыратымдылығы төмен. Бұл әдістеменің мақсаты әртүрлі көздерден алынған екі геномдық ДНҚ үлгісін жылдам және тиімді салыстыру болып табылады.
01-сурет: CGH
Рәсім екі көзден ДНҚ-ны оқшаулауды қамтиды: сынақ және анықтама. Содан кейін келесі қадам әртүрлі түсті флюорофорлармен сынақ және анықтамалық ДНҚ үлгілерін тәуелсіз таңбалау болып табылады. Кейінірек бір тізбекті ДНҚ үлгілерін алу үшін екі ДНҚ үлгісі денатурацияланды. Соңында, хромосомалардың қалыпты метафазалық таралуына 1:1 қатынасында екі нәтижелі ДНҚ үлгісін будандастыру орындалды. Хромосомалық айырмашылықтарды флуоресцентті микроскоп пен компьютерлік бағдарламалық құрал арқылы екі көз арасында анықтауға болады. Сонымен қатар, CGH әдісі тек теңгерілмеген хромосомалық аномалияларды анықтауға қабілетті.
CGH массиві дегеніміз не?
CGH массиві – эталондық үлгімен салыстырғанда сынақ үлгісінің ДНҚ-дағы көшірме санының өзгеруін талдауға арналған толық автоматтандырылған молекулалық цитогенетикалық әдіс. Оның жоғары ажыратымдылығы бар және ол дәстүрлі CGH шектеулерін азайту үшін әзірленген. CGH массиві CGH принциптерін микромассивтерді қолданумен біріктіреді. Метафазалық хромосомалардың таралуын пайдаланудың орнына бұл әдіс нысана ретінде ДНҚ-ның шағын сегменттері бар слайдтарды пайдаланады. Бұл микромассивтер қатты шыны тірекке ДНҚ-ның (зондтардың) аз мөлшерін салу және иммобилизациялау арқылы жасалды. Зондтардың өлшемі олигонуклеотидтен бактериялық жасанды хромосомаға дейін өзгеруі мүмкін.
02-сурет: CGH массиві
Зондтарға қарамастан, CGH массивінің негізгі әдісі CGH-ге ұқсас. Құрамында микромассив бар зондтар дайындалғаннан кейін, әртүрлі түсті флюорофорлармен таңбаланған екі ДНҚ үлгісі (сынақ және анықтамалық) бірге араласады және микромассивке қосылады. Үлгілердегі ДНҚ денатурацияға байланысты бір тізбекті болғандықтан, бұл ДНҚ бір тізбекті зондтармен гибридтенеді. Сандық бейнелеу жүйесін пайдалана отырып, екі көз арасындағы хромосомалық айырмашылықтарды анықтауға болады.
CGH және CGH массивінің қандай ұқсастықтары бар?
- CGH және CGH массиві көшірме санының ауытқуларын анықтаудың екі әдісі болып табылады.
- Бұл молекулалық цитогенетикалық әдістер.
- Екі әдіс те теңгерілмеген хромосомалық аномалияларды диагностикалайды.
- Флюорофорлар екі әдіске де қатысады.
- Көшірме санының өзгеруіне байланысты генетикалық бұзылуларды анықтау үшін екі әдісті де пайдалануға болады.
- Олар салыстырмалы геномдық талдауда кеңінен қолданылады.
CGH және CGH массивінің айырмашылығы неде?
CGH – ажыратымдылығы төмен сынақ үлгісінің ДНҚ-дағы көшірме санының өзгеруін талдауға арналған дәстүрлі молекулалық цитогенетикалық әдіс, ал CGH массиві – сынақ үлгісінің ДНҚ-дағы көшірме санының өзгеруін талдауға арналған толық автоматтандырылған молекулалық цитогенетикалық әдіс. бұл жоғары ажыратымдылыққа ие. Сонымен, бұл CGH мен CGH массивінің негізгі айырмашылығы. Сонымен қатар, CGH-де сынақ және анықтамалық ДНҚ үлгілері хромосомалардың қалыпты метафазалық таралуымен будандасады, бірақ CGH массивінде сынақ және анықтамалық ДНҚ үлгілері микромассиві бар иммобилизацияланған ДНҚ зондтарымен будандастырады.
Төмендегі инфографика CGH және CGH массиві арасындағы айырмашылықтарды қатар салыстыру үшін кесте түрінде көрсетеді.
Қорытынды – CGH және CGH массиві
CGH және CGH массиві теңгерімсіз хромосомалық аномалияларды анықтауға арналған екі молекулалық цитогенетикалық әдіс болып табылады. Олар салыстырмалы геномдық талдауда кеңінен қолданылады. CGH - ажыратымдылығы төмен сынақ үлгісінің ДНҚ-дағы көшірме санының өзгеруін талдауға арналған дәстүрлі молекулярлық цитогенетикалық әдіс. Керісінше, CGH массиві жоғарырақ ажыратымдылығы бар сынақ үлгісінің ДНҚ-дағы көшірме санының өзгеруін талдауға арналған толық автоматтандырылған молекулалық цитогенетикалық әдіс болып табылады. Осылайша, бұл CGH және CGH массиві арасындағы айырмашылықты қорытындылайды.
