Изошизомерлер мен неосизомерлер арасындағы негізгі айырмашылық мынада: изошизомерлер бірдей тану тізбегіне ие және ДНҚ-ны бірдей позицияларда бөлетін шектеу ферменттері, ал неосизомерлер - тану реті бірдей, бірақ ДНҚ-ны әртүрлі позицияларда бөлетін шектеу ферменттері..
Рестрикциялық ферменттер немесе рестрикциялық эндонуклеазалар – белгілі бір тану орындарында немесе оның жанында ДНҚ-ны фрагменттерге бөлетін ферменттер. Олар ДНҚ-ны шектеу орындарында кесіп тастайды. Рестрикциялық ферменттер әдетте құрылымына, олардың ДНҚ субстратын тану орнында кесіп алуына және тану және ыдырату орындарының бір-бірінен бөлек болуына байланысты бес топқа жіктеледі. Қазірдің өзінде 3600-ден астам рестрикциялық эндонуклеазалар анықталды. 800-ге жуық шектеу ферменттері коммерциялық түрде қол жетімді. Изошизомерлер мен неосизомерлер - тану орны мен бөліну ерекшелігіне негізделген шектеу ферменттерінің екі түрі.
Изосхизомерлер дегеніміз не?
Изосхизомерлер – тану реті бірдей және ДНҚ-ны бірдей позицияларда бөлетін шектеу ферменттері. Бұл рестриктазалардың спецификасы бірдей. Берілген тізбекті танитын бірінші ашылған рестриктаза ферменті прототип ретінде белгілі, ал сол реттілікті танитын барлық кейіннен анықталған шектеу ферменттері изошизомерлер деп аталады. Дегенмен, изошизомерлер сайттың қалауы, реакция жағдайлары, метилдену сезімталдығы және жұлдыз белсенділігі бойынша әр түрлі болуы мүмкін. Изошизомерлер бактериялардың әртүрлі штаммдарынан бөлініп алынады. Сондықтан олар әртүрлі реакция жағдайларын қажет етуі мүмкін. Кейбір жағдайларда изошизомер жұбының біреуі ғана шектеу орындарының метилденген және метилденбеген түрлерін тани алады. Екінші жағынан, басқа шектеу ферменті шектеу аймағының метилденбеген түрін ғана тани алады. Изошизомерлердің бұл ерекше қасиеті шектеу аймағының метилдену күйін анықтауға және оны бактериялық күйден оқшаулауға көмектеседі.
Мысалы, AgeI және BshT1 5’-A↓CCGGT-ді бірдей үлгіде таниды және ажыратады. HpaII және MSPI - изошизомерлердің басқа жұптары. Екеуі де 5’-C↓CGG-3’ тізбегін метилденбеген кезде таниды. Бірақ тізбектің екінші C метилденген кезде, тек MSPI ғана бұл тізбекті тани алады, ал HpaII оны тани алмайды.
Неошизомерлер дегеніміз не?
Неошизомерлер – тану реті бірдей, бірақ ДНҚ-ны әртүрлі позицияларда бөлетін шектеу ферменттері. Кейбір арнайы молекулалық биологиялық қолданбаларда бұл өте пайдалы мүмкіндік. Неошизомерлер изошизомерлердің бір бөлігі болып табылады. Неошизомерлер үшін белгілі мысалдар SmaI (5’-CCC↓GGG-3’) және XmaI (5’-C↓CCGGG-3’); екеуі де 5'-CCCGGG-3' тізбегін таниды, бірақ оларды басқа позицияда ажыратады. Осылайша, бұл екі шектеу ферменттері әртүрлі ұштарды жасайды. Бұл жағдайда SmaI доғал ұштарды, ал XmaI 5' шығыңқы ұштарды жасайды.
01-сурет: неошизомерлер
Тағы бір мысал - MaeII және Tail шектеу ферменттерінің жұбы. MaeII прототипі (A↓CGT) 2 негізді 5'кеңейтімі бар ДНҚ фрагменттерін, ал неосизомер құйрығы (ACGT↓) 4 негізді 3' кеңейтімі бар ДНҚ фрагменттерін шығарады.
Изошизомерлер мен неосизомерлердің қандай ұқсастықтары бар?
- Изошизомерлер мен неосизомерлер - шектеу ферменттерінің екі түрі.
- Олар негізінен прокариоттарда кездеседі.
- Олар бактериялар мен архейлерде кездесетін шектеу-модификация (RM) жүйесінің бөлігі.
- Екеуі де белок молекуласы.
- Екеуі де ДНҚ-ны фрагменттерге бөледі.
Изошизомерлер мен неосизомерлер арасындағы айырмашылық неде?
Изошизомерлер – тану реті бірдей және ДНҚ-ны бірдей позицияларда бөлетін шектеу ферменттері, ал неосизомерлер – тану реті бірдей, бірақ ДНҚ-ны әртүрлі позицияларда бөлетін шектеу ферменттері. Сонымен, бұл изошизомерлер мен неосизомерлер арасындағы негізгі айырмашылық. Сонымен қатар, изошизомерлердің ерекшеліктері бірдей, ал неосизомерлер әртүрлі ерекшеліктерге ие.
Келесі инфографика изошизомерлер мен неосизомерлер арасындағы айырмашылықтарды қатар салыстыру үшін кесте түрінде көрсетеді.
Қорытынды – изошизомерлер және неосхизомерлер
Рестрикциялық ферменттер – ДНҚ кесетін ферменттер. Оларды молекулалық қайшылар деп те атайды. Рестриктеуші ферменттердің әртүрлі түрлері бар. Тану орны мен бөліну ерекшелігіне қарай рестриктеуші ферменттер изошизомерлер және неошизомерлер сияқты екі түрге бөлінеді. Изошизомерлердің тану тізбегі бірдей және ДНҚ-ны бірдей позицияларда бөледі, ал неосизомерлер бірдей тану ретіне ие, бірақ ДНҚ-ны әртүрлі позицияларда бөледі. Осылайша, бұл изошизомерлер мен неосизомерлер арасындағы негізгі айырмашылық.
