Ксилен цианол мен бромофенол көк арасындағы негізгі айырмашылық мынада: 1% агароздық гельде ксилол цианол баяу, ал бромофенол көк жылдамырақ ауысады.
Ксилен цианол және бромофенол көк агарозды гель электрофорезі мен полиакриламидті гель электрофорезі процесін бақылауда қолдануға болатын түсті маркерлер ретінде маңызды.
Ксилен цианол дегеніміз не?
Ксилен цианол - электрофоретикалық түсті маркер немесе бақылау бояуы. Бұл агарозды гель электрофорезі және полиакриламидті гель электрофорезі процесін бақылауда пайдалы. Бұл зат үлгімен араласқан кезде бұл заттың концентрациясы әдетте шамамен 0 болады.005%-дан 0,03%-ға дейін. Ксилен цианолы үшін қолдануға болатын кейбір синонимдерге Acid Blue 147, ксилол цианол, ксилол цианол FF, ксилол цианол FF және т.б. жатады.
Бұл қосылыстың химиялық формуласы: C25H27N2NaO 6S2 Ксилол цианолының молярлық массасы 538,61 г/моль. Бұл зат 1% агарозды гельдерде шамамен 4 – 5 килобаза жұп ДНҚ фрагменттері жылдамдығымен көшуі мүмкін. Дегенмен, бұл біз қолданатын буферге байланысты. Әдетте, 6% полиакриламидті гельдегі ксилол цианол шамамен 140 негіздік жұп ДНҚ фрагменттері жылдамдығымен көшуі мүмкін. Екінші жағынан, ол 20% денатурацияланатын полиакриламидті гель электрофорезінде 25 негіздік олигонуклеотид жылдамдығымен көшуі мүмкін.
Ксилол цианолының сутегі байланысының донорларының саны 2м, ал сутегі байланысының акцепторларының саны 8. Бұл қосылыстың айналмалы байланыс санын 7 деп беруге болады. Ксилол цианолының күрделілігін 1120 градус деп сипаттауға болады. Оның стереоорталық байланысының анықталған саны 1.
Бромфенол көк дегеніміз не?
Бромфенол көк - электрофорездік түсті маркер және бояғыш ретінде пайдалы рН пайдалы индикаторы. Оның химиялық атауы 3’, 3”, 5’, 5”-тетрабромфенолсульфонфталеин, BPB. Бұл қосылыстың химиялық формуласы: C19H10Br4O5 S. Бұл қосылыстың молярлық массасы 669,96 г/моль. Ол иіссіз және оның тығыздығын 2,2 г/мл деп беруге болады. Оның балқу температурасы 273 градус Цельсий, ал қайнау температурасы 279 градус Цельсий. Оны мұздық сірке қышқылындағы фенолсульфонфталеиннің ыстық ерітіндісіне артық бромды баяу қосу арқылы дайындауға болады.
Бромфенол көк pH 3,0 мен 4,6 аралығындағы қышқыл-негіз индикаторы ретінде пайдалы. Ол рН 3,0 кезінде сарыдан рН 4,6-ға дейін өзгереді. Оның үстіне бұл қайтымды реакция. Құрылымы жағынан бромфенол көк фенолфталеинге ұқсас.
Сонымен қатар, оны агарозды гель электрофорезі және полиакриламидті гель электрофорезі процесін бақылау үшін түсті маркер ретінде пайдалануға болады. Бұл зат қалыпты рН кезінде теріс зарядты көтере алады, онда ол гельдегі ДНҚ немесе ақуыз сияқты бағытта қозғала алады. Миграция жылдамдығы гельдің тығыздығына және буфер құрамына байланысты өзгеруі мүмкін. Дегенмен, 1 реттік TAE буферіндегі немесе TBE буферіндегі әдеттегі 1% агарозды гельде бұл зат шамамен 300 негіз жұбынан тұратын ДНҚ фрагменті сияқты жылдамдықпен ауысады.
Ксилен-цианол мен бромофенол көк арасындағы айырмашылық неде?
Ксилен цианол және бромофенол көк маңызды түс маркерлері болып табылады. Ксилол цианол мен бромофенол көк арасындағы негізгі айырмашылық мынада: 1% агароздық гельде ксилол цианол баяу, ал бромофенол көк жылдамырақ ауысады.
Төменде қатар салыстыру үшін ксилол цианол мен бромофенол көк арасындағы айырмашылықтың қысқаша мазмұны кесте түрінде берілген.
Қорытынды – ксилол цианол және бромофенол көк
Ксилен цианол және бромофенол көк агарозды гель электрофорезі мен полиакриламидті гель электрофорезі процесін бақылауда қолданылатын түсті маркерлер ретінде маңызды. Ксилол цианол мен бромофенол көк арасындағы негізгі айырмашылық мынада: 1% агароздық гельде ксилол цианол баяу, ал бромофенол көк жылдамырақ ауысады.