Shine Dalgarno және Kozak тізбегі арасындағы негізгі айырмашылық мынада: Shine Dalgarno тізбегі бактериялық және архейлік хабаршы РНҚ-дағы рибосомалық байланыстыру орны болып табылады, ал Козак тізбегі эукариоттық хабаршы РНҚ-лардың көпшілігінде белок трансляциясын бастау орны болып табылады.
Shine Dalgarno және Kozak тізбегі аударманы бастау үшін өте маңызды екі консенсус тізбегі болып табылады. Молекулалық биологияда трансляция – транскрипция процесінен кейін цитоплазмадағы рибосомалар ақуыздарды синтездейтін процесс. Трансляция кезінде иРНҚ (хабаршы РНҚ) ядродан тыс белгілі бір аминқышқыл тізбегін жасау үшін рибосомада декодталады. Әдетте, рибосома комплементарлы тРНҚ антикодон тізбегінің мРНҚ кодондарымен байланысуын жеңілдету арқылы декодтау процесін индукциялайды. Аударма үш кезеңде жүреді: бастау, ұзарту және аяқтау.
Shine Dalgarno Sequence дегеніміз не?
Shine Dalgarno тізбегі бактериялық және архейлік хабаршы РНҚ-дағы рибосомалық байланыстыру орны болып табылады. Ол әдетте AUG бастапқы кодонынан жоғары 8 негізге жақын орналасқан. Бұл РНҚ тізбегі рибосоманы мРНҚ бастау кодонымен туралау арқылы хабаршы РНҚ-ға рибосомаларды тартуға көмектеседі. Осылайша, ол ақуыз синтезін бастайды. Жалға алғаннан кейін тРНҚ аминқышқылдарын мРНҚ кодондары белгілеген ретпен қоса алады. Бұл ерекше тізбек бактерияларда жиі кездеседі, бірақ архейлерде сирек кездеседі. Сонымен қатар, ол хлоропласт пен митохондриялық транскрипттерде де болады. Shine Dalgarno тізбегін алғаш рет австралиялық ғалымдар Джон Шайн мен Линн Далгарно ұсынған. Алты негізгі консенсус тізбегі AGGAGG болып табылады. Мысалы, ішек таяқшасында тізбек AGGAGGU болып табылады.
01-сурет: Shine Dalgarno Sequence
Бастау орнын таңдау (AUG) рибосоманың 30S суббірлігі мен мРНҚ үлгісінің өзара әрекеттесуіне байланысты. 30S суббірлігінің 16srRNA компонентіндегі пиримидинге бай аймақ мРНҚ-дағы AUG инициация кодонының жоғары ағынында Shine Dalgarno тізбегі деп аталатын пуринге бай аймақпен байланысады. Сонымен қатар, инициациялық кешеннің қалыптасуы кезінде бұл комплементарлы нуклеотидтер тізбегі қос тізбекті РНҚ құрылымын құрайды. Бұл иРНҚ-ның рибосомамен байланысуын жеңілдетеді, осылайша инициациялық кодоны рибосоманың P орнында орналасады.
Kozak Sequence дегеніміз не?
Козак тізбегі эукариоттық мРНҚ-ның көпшілігінде белок трансляциясының басталу орны болып табылады. Бұл тізбекті Козак консенсус тізбегі деп те атайды. Козак тізбегі эукариоттарда трансляцияны бастау үшін оңтайлы реттілік болып табылады. Бұл реттілік ақуызды реттеудің ажырамас аспектісі болып табылады. Бұл жалпы жасушалық денсаулық үшін де өте маңызды. Ол рибосома жинақталуына және аударманың басталуына делдалдық жасау арқылы генетикалық хабарлардан белок аудармасын түзетуге көмектеседі.
02-сурет: Kozak тізбегі
Бұл реттілік оны ашқан ғалым Мэрилин Козактың атымен аталды. Ол оны ДНҚ геномдық тізбектерінің егжей-тегжейлі талдауы арқылы ашты. Kozak тізбегі 5’ (gcc) gccRccAUGG-3’. Бас әріптер сақталған негіздерді, ал кіші әріптер жалпы айнымалы негіздерді көрсетеді. R әрқашан осы жерде орналасқан пуринді (аденин немесе гуанин) көрсетеді.
Shine Dalgarno және Kozak Sequence арасында қандай ұқсастықтар бар?
- Shine Dalgarno және Kozak тізбегі аударманы бастауда өте маңызды екі консенсус тізбегі.
- Екеуі де РНҚ тізбегі.
- Рибосоманың кішірек суббірлігі екі тізбекке де байланысады.
- Екі реттілік те рибосомалардың дұрыс жиналуына және аударманың басталуына делдал болады.
- Олар ақуызды реттеудің және жалпы жасушалық денсаулықтың ажырамас аспектілері болып табылады.
Shine Dalgarno және Kozak Sequence арасындағы айырмашылық неде?
Shine Dalgarno тізбегі бактериялық және архейлік хабаршы РНҚ-да табылған рибосомалық байланыстыру орны болып табылады, ал Козак тізбегі эукариоттық хабаршы РНҚ-ның көпшілігінде кездесетін ақуызды трансляциялау инициациясының орны болып табылады. Сонымен, бұл Shine Dalgarno мен Kozak тізбегі арасындағы негізгі айырмашылық. Сонымен қатар, Shine Dalgarno тізбегі 5'AGGAGGU3' болса, Kozak тізбегі 5' (gcc) gccRccAUGG-3'.
Келесі инфографикада Shine Dalgarno және Kozak тізбегі арасындағы айырмашылықтар қатар салыстыру үшін кесте түрінде берілген.
Қорытынды – Shine Dalgarno vs Kozak Sequence
Shine Dalgarno және Kozak тізбегі - рибосома құрастыру және трансляцияны бастау үшін өте маңызды екі консенсус РНҚ тізбегі. Shine Dalgarno тізбегі бактериялық және архейлік хабаршы РНҚ-дағы рибосомалық байланыстыру орны болып табылады, ал Козак тізбегі эукариоттық хабаршы РНҚ-ның көпшілігінде белок трансляциясын бастау орны болып табылады. Осылайша, бұл Shine Dalgarno және Kozak тізбегі арасындағы айырмашылықты қорытындылайды.
