LINEs және SINE арасындағы негізгі айырмашылық мынада: LINEs (ұзын аралығы бар ядролық элементтер) LTR емес ұзағырақ ретротранспозондардың бір түрі, ал SINE (қысқаша кесілген ядролық элементтер) LTR емес әлдеқайда қысқа ретротранспозондардың бір түрі.
LTR емес ретротранспозондарда ұзақ терминалдық қайталаулар (LTR) жоқ. Алайда олардың құрамында кері транскриптаза, РНҚ байланыстыратын ақуыз, нуклеаза және рибонуклеаза Н доменіне арналған гендер бар. LTR емес ретротранспозондарда қысқа қайталанулар болады. Бұл қайталауларда бір-бірінің қасында негіздердің инверттелген реті бар. Бұдан басқа, LTR емес ретротранспозондарда LRT транспозондарында тікелей қайталанулар бар. LTR емес ретротранспозондар LINE және SINE деп екі санатқа бөлінеді.
Жолдар дегеніміз не?
Желілер (ұзын арақашықтықта орналасқан ядролық элементтер) ұзағырақ LTR емес ретротранспозондар болып табылады. Олар эукариоттардың геномдарында кең таралған. Олар әдетте адам геномының 21,1% құрайды. Әрбір LINE ұзындығы шамамен 7000 негізгі жұпты құрайды. Желілер мРНҚ-ға транскрипцияланып, кері транскриптаза ферменті қызметін атқара алатын ақуызға ауыса алады. Бұл кері транскриптаза LINEs РНҚ-ның ДНҚ көшірмелерін жасайды. Бұл ДНҚ көшірмелерін жаңа сайтта геномға біріктіруге болады.
01-сурет: сызықтар мен SINEs
Адам геномында LINE-1 деп аталатын бір ғана мол сызық бар. LINE-1 элементінің ұзындығы шамамен 6000 негізгі жұпты құрайды. Адам геномында шамамен 100 000 кесілген LINE-1 элементтері бар. Кездейсоқ мутация LINE-да пайда болуы мүмкін. Кездейсоқ мутацияларға байланысты сызықтар нашарлауы мүмкін. Олар енді транскрипцияланбайды немесе аударылмайды. Сонымен қатар, LINEs L1, RTE, R2, I және жокей сияқты бес негізгі топқа топтастырылған. Бұл бес топ тағы 28 класқа бөлінеді.
Желілер әдетте мақсатты бастапқы кері транскрипция механизмі (TPRT) деп аталатын механизм арқылы таралады. Желілерді енгізу адамда гемофилия А, қатерлі ісік, мендельдік бұзылулар, т.б. сияқты ауруларды тудырады. Желілердің гипометиляциясы қатерлі ісіктің кейбір түрлерін де қоздырады.
SINE дегеніміз не?
SINE (қысқа аралықтағы ядролық элементтер) әлдеқайда қысқа LTR емес ретротранспозондардың бір түрі. Олардың ұзындығы шамамен 100-ден 700-ге дейін негізгі жұптар. SINE-лер сонымен қатар РНҚ аралық өнімдері арқылы эукариоттық геномдарда өздерін күшейтетін ДНҚ элементтері болып табылады. SINE сүтқоректілер геномының шамамен 13% құрайды. SINE ішкі аймақтары тРНҚ-дан туындайды. Ол жоғары деңгейде сақталған. Олар көбінесе омыртқалы және омыртқасыз жануарлардың көптеген түрлерінде кездеседі. SINE-дағы көшірме санының вариациясы мен мутациялары түрлердің филогенезге негізделген жіктелуін құру үшін біріктірілуі мүмкін.
SINE-ларды үш негізгі түрге топтастыруға болады: CORE-SINEs, V-SINEs және AmnSINEs. Alu элементі приматтарда ең көп таралған SINE болып табылады. Сонымен қатар, SINE енгізумен байланысты 50-ден астам адам аурулары бар. Олар экзондардың ішіне немесе жанына кіргізгенде, олар дұрыс қосылмауы немесе оқу жақтауын өзгертуі мүмкін. Бұл сүт безі обыры, тоқ ішек обыры, лейкемия, гемофилия, муковисцидоз, тоқ ішек қатерлі ісігі, Дент ауруы, нейрофиброматоз және т.б. сияқты аурудың фенотипіне әкеледі.
LINEs және SINE арасындағы қандай ұқсастықтар бар?
- LINEs және SINE - LTR емес ретротранспозондардың екі түрі.
- Екеуінде де ұзын терминал аймақтары (LTR) жоқ.
- Екеуі де негізінен тек эукариоттарда кездеседі.
- Олардың екеуі де автономды емес.
СОЛЫҚ пен SINE арасындағы айырмашылық неде?
LINEлар ұзағырақ LTR емес ретротранспозондар, ал SINE - LTR емес ретротранспозондар әлдеқайда қысқа. Сонымен, бұл LINE және SINE арасындағы негізгі айырмашылық. Сонымен қатар, LINES кері транскриптаза ферментін кодтайды, ал SINE кері транскриптаза ферментін кодтамайды. Осылайша, бұл LINE және SINE арасындағы тағы бір айырмашылық.
LINE және SINE арасындағы қосымша айырмашылықтар қатар салыстыру үшін төменде кесте түрінде берілген.
Қорытынды – LINEs және SINEs
Ретротранспозондар негізінен барлық эукариоттарда кездеседі, бірақ прокариоттарда жоқ. Адам геномының шамамен 37% ретротранспозондардан тұрады. Ретротранспозондар негізінен екі түрге бөлінеді: LTR және LTR емес ретротранспозондар. LTR емес ретротранспозондарда LTR ретротранспозондарында болатын ұзақ терминалдық қайталаулар (LTR) жоқ. LTR емес ретротранспозондар екі санатқа бөлінеді: LINEs және SINE. LINEs ұзағырақ LTR емес ретротранспозондар, ал SINE - LTR емес ретротранспозондар әлдеқайда қысқа. Осылайша, бұл LINE және SINE арасындағы айырмашылықтың қысқаша мазмұны.
