dATP мен ddATP арасындағы негізгі айырмашылық мынада: dATP ДНҚ синтезін тоқтатпайды, ал ddATP ДНҚ синтезін тоқтата алады. Себебі ddATP-де пентозалық қанттың 3′ позициясында H атомы, ал dATPде 3′ позициясында OH тобы бар.
dNTP - ДНҚ-ның құрылыс блоктары. Пуриндік немесе пиримидиндік негіздер бойынша dNTP төрт түрі бар - олардың біреуі dATP. dATP азотты негізі аденозин болып табылады. ddNTPs - Сэнджер секвенирлеуінде қолданылатын нуклеотидтер. ddNTP төрт түрі бар. ddATP – ddNTPs.
dATP дегеніміз не?
Деоксиаденозинтрифосфаты – ДНҚ-ның құрылыс материалы болып табылатын нуклеотид. ДНҚ-полимераза ферменті ДНҚ синтезі үшін субстрат ретінде dATP пайдаланады. dATP үш компоненттен тұрады: дезоксирибоза қант молекуласы, аденозин және үш фосфат тобы. Сондықтан бұл пуринді нуклеозид-трифосфаты. dATP химиялық формуласы: C10H16N5O12 P3, және оның молекулалық массасы 491,182.
01-сурет: dATP
dATP қант құрамдас бөліктері бойынша АТФ-дан (аденозинтрифосфаттан) ерекшеленеді. ATP құрамында рибоза қант бар. Транскрипция кезінде dATP негізі урацил нуклеотидімен жұптасады. ДНҚ синтезіне қатысудан басқа, dATP жасушалардың өміршеңдігін сақтау үшін энергияны тасымалдаушы молекула ретінде әрекет ете алады. Ағзадағы dATP жоғары деңгейі улы болып табылады, өйткені ол рибонуклеотид-редуктаза ферменті үшін бәсекеге қабілетсіз ингибитор ретінде әрекет ете алады. Бұл иммундық функцияның төмендеуіне әкелуі мүмкін.
ddATP дегеніміз не?
Дидеоксиаденозинтрифофафат немесе ddATP - Сэнджер секвенирлеу әдісінде қолданылатын нуклеотидтердің төрт түрінің бірі. Құрылымдық жағынан ddATP-де dATP-ге ұқсас үш компонент бар. Олар аденин негізі, дезоксирибоза қант және үш фосфат.
02-сурет: ddATP
dATP-тен айырмашылығы, көрші нуклеотидпен фосфодиэфирлік байланыс құру және тізбектің ұзаруын жалғастыру үшін ddATP пентоза қантының 3′ позициясында OH тобы жоқ. Оның 3 позициясында Н атомы бар. Сондықтан ddATP қосылғаннан кейін ДНҚ синтезі аяқталады. Бұл Сэнгер реттілігінің негізгі принципі. Сондықтан ddATP Сэнгер секвенирлеуінде тізбектің ұзару ингибиторы ретінде жұмыс істейді. Sanger секвенирлеуінде төрт түтік пайдаланылады және бір түтікке ddATP қосылады.
dATP және ddATP арасындағы қандай ұқсастықтар бар?
- dATP және ddATP - нуклеотидтер.
- Екеуі де аденин, дезоксирибоза және үш фосфаттан тұрады.
- Олар органикалық қосылыстар.
- dATP және ddATP екеуі де Sanger секвенирлеуінде түтіктерге қосылады.
dATP мен ddATP арасындағы айырмашылық неде?
dATP-де пентозалық қанттың 3' позициясында OH тобы бар, ал ddATP-де пентозаның 3' позициясында OH тобы жоқ. Сонымен қатар, dATP - бұл ДНҚ синтезінде қолданылатын мономер, ал ddATP Сангер секвенциясы кезінде тізбектің ұзаруын тоқтату үшін қолданылады. Сонымен, бұл dATP мен ddATP арасындағы негізгі айырмашылық. Сонымен қатар, dATP фосфодиэфирлік байланыстарды құра алады, ал ddATP фосфодиэфирлік байланыстарды құра алмайды.
Төмендегі инфографикада dATP және ddATP арасындағы қосымша айырмашылықтар қатар салыстыру үшін кесте түрінде көрсетілген.
Қорытынды – dATP және ddATP
Қысқаша айтқанда, dATP - ДНҚ синтезінің прекурсоры, ал ddATP - Сангер секвенирлеуінде ДНҚ синтезін тоқтату үшін қолданылатын нуклеотид. Сонымен қатар, dATP пентозалық қанттың 3 позициясында OH тобына ие және ол келесі нуклеотидпен фосфодиэфирлік байланыстың пайда болуына мүмкіндік береді. Сонымен қатар, ddATP 3 позицияда OH тобына ие емес; демек, ол келесі нуклеотидпен фосфодиэфирлік байланыс түзе алмайды. Нәтижесінде ДНҚ тізбегі ұзаруын тоқтатады. Осылайша, бұл dATP және ddATP арасындағы айырмашылықты қорытындылайды.
