РНҚ-полимераза өзегі мен голофермент арасындағы негізгі айырмашылық мынада: РНҚ-полимераза өзегі сигма факторы жоқ фермент, ал РНҚ полимераза голоферменті сигма факторынан тұратын фермент.
Бактериялардағы транскрипция – бұл бактериялық ДНҚ сегменті РНҚ полимераза ферментінің көмегімен жаңадан синтезделген мРНҚ тізбегіне көшірілетін процесс. Бұл процесс үш негізгі сатыда жүреді: инициация, созылу және аяқталу. Бактериялық РНҚ полимераза 6 суббірліктен тұрады. РНҚ полимераза өзегі β, β′, α2 және ω суббірліктерінен тұрады. Бұл РНҚ-полимераза өзегі σ (сигма) факторы өзек ферментімен байланысқан кезде голоферментке айналады. РНҚ полимераза өзегі және голофермент бактериялық РНҚ полимераза ферментінің екі формасы болып табылады.
РНҚ полимераза ядросы дегеніміз не?
РНҚ-полимераза өзегі – сигма факторы жоқ бактериялық транскрипцияға қатысатын фермент. Ол β, β′, α2 және ω ретінде белгіленген 5 ішкі бірліктен тұрады. Бұл фермент бактериялық және фагтық ДНҚ промоторларынан спецификалық транскрипцияны бастамайды. Себебі ол ешқандай арнайы бактериялық немесе фагтық ДНҚ промоторларын танымайды. Дегенмен, бұл фермент РНҚ-ны спецификалық емес инициация тізбегінен транскрипциялау мүмкіндігін сақтайды. Сонымен қатар, бұл ферментке сигма факторының қосылуы ферментке арнайы бактериялық және фаг промоторларынан РНҚ синтезін бастауға мүмкіндік береді. РНҚ-полимераза негізгі ферментінің молекулалық салмағы шамамен 400 кДа.
01-сурет: РНҚ полимераза ядросы
Негізгі ферментте РНҚ-полимеразаның каталитикалық қасиеттері бар. α суббірлігі 36,5 кДа өлшемді гомодимер болып табылады. Ол rpoA генімен кодталған. Бұл суббірліктің функциялары - RNAP құрастыру, ДНҚ-мен өзара әрекеттесу және транскрипцияны реттеуге арналған транскрипция факторлары. Β суббірлігінің өлшемі 150,4 кДа. Ол rpoB генімен кодталған. Бұл суббірліктің функциялары: ДНҚ мен РНҚ байланысуы, РНҚ синтезі, NTP байланысуы, RMP байланысу орны және σ факторды байланыстыру. β′ суббірлігінің өлшемі 155 кДа және ол rpoC генімен кодталған. Бұл суббірліктің функциялары: ДНҚ байланыстыру, РНҚ синтезі, каталитикалық Mg2+үйлестіру, ppGpp 1-байланыс орны және σ факторды байланыстыру. Сонымен қатар, ω факторының өлшемі 10,2 кДа және rpoZ генімен кодталған. ω факторының функциясы - RNAP бүктеу және ppGpp байланыстыру орны 1.
РНҚ-полимераза голофермент дегеніміз не?
РНҚ полимераза голоферменті β, β′, α2 және ω суббірліктерінен басқа сигма факторы деп аталатын белгілі бір компоненттен тұрады. Сигма факторының арқасында РНҚ-полимераза голоферменттері промоторларды тани алады. Сигма факторы сонымен қатар РНҚ-полимераза голоферментінің дұрыс орналасуына және бастапқы орнында босатуға көмектеседі. Сигма факторы өзінің қажетті және ерекше функциясын орындағаннан кейін, ол РНҚ полимераза голоферментінен диссоциацияланады, ал РНҚ полимеразаның каталитикалық бөлігі (β, β′, α2 және ω) ДНҚ-да қалады және транскрипцияны жалғастырады.
02-сурет: РНҚ-полимераза голоферменті
Сигма факторларының саны бактерия түрлері арасында өзгереді. E. coli-де жеті сигма факторы бар. Сонымен қатар, сигма факторлары олардың тән молекулалық салмағымен ерекшеленеді. Мысалы, σ70 - молекулалық салмағы 70 кДа болатын сигма коэффициенті. Бактериялар әр түрлі орта жағдайларында әртүрлі сигма факторларын пайдаланады. Әртүрлі σ факторларының мысалдары мыналарды қамтиды; σ19, σ24, σ18, σ32, σ38 және σ54
РНҚ полимераза ядросы мен голоферменттің қандай ұқсастықтары бар?
- РНҚ-полимераза өзегі мен голофермент бактериялық РНҚ-полимераза ферментінің екі түрі болып табылады.
- Екі нысан да бактериялық транскрипцияға қатысады.
- Олардың ішкі бірліктері бар.
- Олар амин қышқылдарынан тұратын белок молекулалары.
РНҚ-полимераза ядросы мен голоферменттің айырмашылығы неде?
РНҚ полимераза өзегі сигма факторы жоқ фермент, ал РНҚ полимераза голоферменті сигма факторынан тұратын фермент. Осылайша, бұл РНҚ полимераза ядросы мен голофермент арасындағы негізгі айырмашылық. Сонымен қатар, РНҚ полимераза өзегі негізінен транскрипцияның ұзару сатысына қатысады, ал РНҚ полимераза голоферменті негізінен транскрипцияның бастама сатысында катализдейді.
Төмендегі инфографика РНҚ-полимераза өзегі мен голофермент арасындағы айырмашылықтарды қатар салыстыру үшін кесте түрінде ұсынады.
Қорытынды – РНҚ полимераза ядросы және голофермент
Бактериялық РНҚ полимераза – көп суббірлік ДНҚ-ға тәуелді фермент. Ол бактериялардың транскрипциясына қатысады. Бұл ген экспрессиясының негізгі ферменті және реттеу мақсаты. РНҚ полимераза өзегі және голофермент бактериялық РНҚ полимераза ферментінің екі формасы болып табылады. РНҚ полимераза өзегінде сигма факторы жоқ, ал РНҚ полимераза голоферментінде сигма факторы болады. Сонымен, бұл РНҚ полимераза ядросы мен голофермент арасындағы айырмашылықты қорытындылайды.
