NAAT пен ПТР арасындағы негізгі айырмашылық мынада: NAAT генетикалық материалды полимеразды тізбекті реакцияны, тізбекті ауыстыруды немесе транскрипция арқылы күшейтуді қоса алғанда, бірнеше әдістерді қолдана отырып күшейтеді, ал ПТР генетикалық материалды тек қолдана отырып күшейтетін әдіс. термиялық цикл.
Патогендер негізінен олардың генетикалық материалының күшеюі арқылы анықталады. Бұл саладағы әдістердің көпшілігі нақты уақыт режимінде нақты тізбектерді күшейту арқылы патогеннің генетикалық материалын анықтауға бағытталған. Сондықтан диагностикалық контексте нәтижелер өте жылдам шығарылады. NAAT, ПТР, биосенсор және LCR - патогеннің генетикалық материалын күшейту үшін зертханаларда қолданылатын бірнеше әдістер.
NAAT дегеніміз не?
Нуклеин қышқылын күшейту сынағы (NAAT) молекулалық биологиядағы әдіс, полимеразды тізбекті реакция, тізбекті ауыстыруды күшейту немесе транскрипция арқылы күшейту сияқты бірнеше әдістерді пайдаланып генетикалық материалды күшейтеді. Генетикалық материалды күшейтуді NAAT процедурасында байлау тізбегі реакциясы және тармақталған ДНҚ реакциясы (квантиплекс b ДНҚ) сияқты әдістер арқылы да жасауға болады. NAAT Watson-Crick негізін жұптастырудың ерекшелігін пайдаланады. NAAT процедурасында бір тізбекті зонд немесе праймер молекуласы мақсатты ДНҚ немесе РНҚ молекуласымен будандастырылады. Сондықтан зонд тізбегінің дизайны анықтаудың сезімталдығы мен ерекшелігін арттыру үшін өте маңызды. Содан кейін NAAT келесі қадамы анықтау үшін оның көптеген көшірмелерін жасау арқылы генетикалық материалды күшейтеді.
01-сурет: NAAT
NAAT қазіргі уақытта Neisseria gonorrhea, Chlamydia trachomatis, Mycobacterium tuberculosis және SARS-COV2 сияқты бірнеше патогенді анықтау үшін қолданылады. Сонымен қатар, NAAT тесті терезе кезеңін қысқарту үшін әзірленген. Терезе кезеңі - пациенттің жұқтырылуы мен антидене сынамалары оң нәтиже көрсеткені арасындағы уақыт кезеңі. Сонымен қатар, NAAT скрининг әдісі алғаш рет 1999 жылы FDA мақұлдаған. NAAT-тың көптеген артықшылықтары бар, соның ішінде ДНҚ немесе РНҚ төмен деңгейлерін анықтау, жоғары сезімталдық және жоғары ерекшелік.
ПТР дегеніміз не?
ПТР – молекулалық биологиядағы әдіс, ол генетикалық материалды тек термиялық циклді қолдана отырып күшейтеді. ПТР полимеразды тізбекті реакцияны білдіреді. Бұл бактериялар, саңырауқұлақтар және вирустар сияқты белгілі бір ағзаның генетикалық материалын анықтауға арналған сынақ. Ауруды диагностикалау кезінде ПТР патогеннің болуын анықтайды, егер адам сынақ кезінде патоген болса. Ауруды диагностикалауда ПТР хаттамасында үлгі жинау, ДНҚ экстракциясы, ПТР және секвенирлеуді қоса алғанда, бірнеше қадамдар бар. Патогендерді сынау кезінде жиналған үлгі генетикалық материалды (ДНҚ немесе РНҚ) алу үшін пайдаланылады. ПТР процедурасы термиялық цикл деп аталатын ПТР аппаратының ішінде генетикалық материалдың миллиондаған көшірмелерін жасау үшін арнайы химиялық заттарды, праймерлерді және ферменттерді қажет етеді. ПТР өнімінен күшейтілгеннен кейін патогенді анықтауға болады. Ғалымдар нәтижелерді түсіндіру үшін арнайы бағдарламалық құралды пайдаланады.
02-сурет: ПТР
Сонымен қатар, қазіргі уақытта зерттеуде қолданылатын ПТР әртүрлі түрлері бар. RT-PCR, Multiplex PCR, RAPD және Nested ПТР солардың қатарына жатады. ПТР әсіресе фарингит (Streptococcl pharyngitis), атипті пневмония (Chlymidia pneumoniae), қызылша (Morbillivirus), гепатит (HBV) және ойық жаралы урогенитальды инфекцияны (Haemophilus ducreyi) анықтауда пайдалы.
NAAT пен ПТР арасындағы қандай ұқсастықтар бар?
- NAAT және ПТР - генетикалық материалды күшейту үшін қолданылатын екі маңызды молекулалық биологиялық әдіс.
- Нуклеин қышқылдары (ДНҚ немесе РНҚ) екі әдіспен де күшейтіледі.
- Олар жылдам және жылдам әдістер.
- Екі әдіс те қазіргі уақытта ауруды диагностикалау үшін қолданылады.
- Олар әдеттегі әдістерге қарағанда қымбат.
NAAT пен ПТР арасындағы айырмашылық неде?
NAAT – молекулалық биологиядағы генетикалық материалды бірнеше әдістер арқылы күшейтетін әдіс, ал ПТР – молекулалық биологиядағы генетикалық материалды тек термиялық цикл арқылы күшейтетін әдіс. NAAT полимеразды тізбекті реакция, тізбекті ауыстыруды күшейту, транскрипция арқылы күшейту, байлау тізбегі реакциясы және тармақталған ДНҚ реакциясы (квантиплекс b ДНҚ) сияқты генетикалық материалды күшейту әдістерін пайдаланады. Екінші жағынан, ПТР RT-ПТР сияқты әртүрлі генетикалық материалды күшейту әдістерін пайдаланады. Мультиплексті ПТР, RAPD, кірістірілген ПТР. Демек, бұл NAAT пен ПТР арасындағы негізгі айырмашылық.
Төмендегі инфографика NAAT және ПТР арасындағы айырмашылықтарды қатар салыстыру үшін кесте түрінде ұсынады.
Қорытынды – NAAT және ПТР
Генетикалық материалдарды күшейту үшін зертханаларда қолданылатын әртүрлі молекулалық биологиялық құралдар бар. NAAT, ПТР, биосенсор және LCR осындай бірнеше әдістер болып табылады. NAAT - полимеразды тізбекті реакция, тізбекті ауыстыру немесе транскрипция арқылы күшейту сияқты бірнеше әдістерді қолдана отырып, генетикалық материалды күшейтетін молекулалық биологиялық әдіс. ПТР – молекулалық биологиядағы жылу циклін қолдана отырып, генетикалық материалды күшейтетін әдіс. Осылайша, бұл NAAT пен ПТР арасындағы негізгі айырмашылық.
