LAMP пен ПТР сынағының негізгі айырмашылығы мынада: LAMP күшейту арқылы ДНҚ көшірмелерін жасау үшін тұрақты температурада (60-650C) жүргізіледі, ал ПТР жүргізіледі. күшейту арқылы ДНҚ көшірмелерін жасау үшін температура өзгерістерінің сериясын пайдалану.
LAMP және ПТР екеуі де ДНҚ-ның мыңдаған көшірмелерін жасау үшін қолданылатын in-vitro күшейту әдістері. LAMP-да өндірілген ДНҚ мөлшері RT-ПТР сияқты ПТР әдістерінде өндірілген мөлшерден әлдеқайда жоғары. LAMP - ПТР әдісімен салыстырғанда жаңа әдіс. Бірақ зертханалық жағдайда дайындалған ғалымның орындауы техникалық жағынан қарапайым және оңай. Бұл оны COVID-19 анықтаудың ықтимал пайдалы әдісі етеді. Дегенмен, RT-PCR COVID-19 үшін қазіргі стандартты сынақ болып табылады. Бұл әдістер ДНҚ-ны күшейту тәжірибесі бар зерттеушілер мен клиницистерге жақсы таныс болғанымен, кеңірек қауымға әлі де беймәлім болуы мүмкін.
LAMP сынағы дегеніміз не?
COVID-19 талдауларына арналған цикл арқылы изотермиялық күшейту (LAMP) жағынды арқылы мұрыннан немесе тамақтан үлгілерді жинаудан басталады. Үлгілерді қатты жөтел кезіндегі шырыш сияқты басқа әдістермен де жинауға болады. RT-PCR сияқты ПТР әдісі сияқты, үлгідегі вирустық РНҚ алдымен ДНҚ-ға айналады, бұл оны көшіруге мүмкіндік береді. LAMP реакциясы тұрақты температурада жүргізіледі (60-650C).
LAMP технологиясы мен реагенттерді қамтитын вирустық ДНҚ күшейтілуін реакция қоспасы «магний пирофосфаты» өндірілуіне байланысты бұлыңғыр болған кезде анықтауға болады. Бұл бұлттылық ғалымдар мен клиникаларға COVID-19 диагнозын оңай анықтауға мүмкіндік береді. Сынақ нәтижелерінің дәлдігін реакциялық қоспада арнайы флуоресцентті бояғыштарды немесе түс өзгертетін бояғыштарды қолдану арқылы жақсартуға болады. Бұл бояғыштар вирустық ДНҚ-мен әрекеттеседі және жарықтың немесе түстің өзгеруінің қарқындылығын шамамен үлгідегі вирустық РНҚ молекулаларының санын беру үшін өлшеуге болады.
ПТР сынағы дегеніміз не?
ПТР – ДНҚ анықтау үшін 20-30 жыл бойы зерттеулер мен медицинада кеңінен қолданылған өте кең таралған ғылыми әдіс. ПТР сынақтары вирустық РНҚ анықтау арқылы антигенді анықтау үшін тікелей қолданылады. Әдетте, вирустық РНҚ антиденелерді анықтағанға дейін немесе аурудың белгілерін алғанға дейін денеде болады. Сондықтан ПТР сынағы біреуде вирустың бар-жоғын ерте анықтауға болады. Қазіргі уақытта ПТР COVID-19 анықтауға арналған стандартты сынақ болып табылады. ПТР әдістерінің әртүрлі түрлері бар, мысалы нақты уақыттағы ПТР, кірістірілген ПТР, мультиплексті ПТР, ыстық бастау ПТР және ұзақ мерзімді ПТР және т.б. ПТР күшейту арқылы ДНҚ көшірмелерін жасау үшін температура өзгерістерінің сериясын пайдаланады.
RT-ПТР – ПТР техникасының арнайы нұсқасы. Ол РНҚ анықталған кезде қолданылады. Ол қазір COVID-19 сынағы үшін қолданылады. RT-ПТР – өте сезімтал және сенімді әдіс. RT-ПТР-де үлгі жиналғаннан кейін РНҚ-ны артта қалдырып, қажетсіз белоктарды, майларды және басқа молекулаларды жою үшін химиялық заттар қолданылады. Сынақ жинағы ферменттері алдымен РНҚ-ны ДНҚ-ға айналдырады, содан кейін вирусты анықтау үшін вирустық ДНҚ-ны күшейтеді. Флуоресцентті бояғыштар әдетте күшейтілген ДНҚ-ға қосылу және жарық шығару үшін қолданылады. Сынақ нәтижесін шығару үшін оны құрылғы оқуы мүмкін.
LAMP және ПТР сынағының қандай ұқсастықтары бар?
- Бұл күшейту әдістері.
- Екеуі де көшірілген ДНҚ жасайды.
- Олар антиденелерді анықтау сияқты иммундық техникаға қарағанда өте сезімтал және сенімді әдістер.
- Олардың екеуі де COVID-19 сынағы үшін пайдаланылады.
LAMP пен ПТР сынағының айырмашылығы неде?
LAMP және ПТР сынақтарының арасындағы негізгі айырмашылық мынада: LAMP-те күшейтуге тұрақты температура (60-650C), ал ПТР кезінде циклді қолдану арқылы жүзеге асырылады. температуралар қажет. Қазіргі уақытта LAMP техникасының бірнеше түрі бар. Бірақ COVID-19 анықтау үшін ең маңыздылары кері транскрипция циклі арқылы изотермиялық әдіс (RT-LAMP) және транскрипт арқылы күшейту (TMA) болып табылады. Сонымен қатар, нақты уақыттағы ПТР, RT-ПТР, кірістірілген ПТР, мультиплексті ПТР, ыстық басталатын ПТР, ұзақ диапазондағы ПТР және т.б. сияқты ауруларды диагностикалау үшін қазіргі уақытта клиникалық тәжірибеде ПТР әдістерінің әртүрлі түрлері бар.
Төмендегі инфографика кесте түрінде LAMP және ПТР сынағы арасындағы айырмашылықтарды көрсетеді.
Қорытынды – LAMP және ПТР сынағы
Цикл көмегімен изотермиялық күшейту RT-ПТР сияқты ПТР сынақтарына ұқсас процесс, бірақ ол тұрақты температурада көбірек вирустық ДНҚ көшірмелерін шығарады. Полимеразды тізбекті реакция сынағы қазіргі уақытта COVID-19 диагнозы сияқты ауруды диагностикалау үшін әлемдегі ең кең таралған және стандартты сынақ түрі болып табылады. Ол жеткілікті сенімді болып саналады. ПТР күшейту арқылы ДНҚ көшірмелерін жасау үшін температураның бірқатар өзгерістерін пайдаланады. Осылайша, бұл LAMP және ПТР сынағы арасындағы айырмашылықты қорытындылайды.