SF1 мен SF2 арасындағы негізгі айырмашылық олардың нуклеин қышқылдарын босату қабілеті болып табылады. SF1 тек ДНҚ-ны ашса, SF2 ДНҚ мен РНҚ-ны ашады.
Геликаза – ДНҚ репликация процесіне, сондай-ақ ДНҚ жөндеу процестеріне қатысатын негізгі ферменттердің бірі. Геликазаның негізгі рөлі қос тізбекті ДНҚ молекулаларының бөлінуін жеңілдету үшін ағыту процесіне қатысу болып табылады. Ферменттің белсенділігі ДНҚ репликациясының бастау фазасында маңызды. Спиральдар негізінен құрылымдық айырмашылықтарына қарай Super Family 1 және Super Family 2 болып бөлінеді. Әрбір супер жанұяда спиралдардың әртүрлі түрлері бар.
SF1 дегеніміз не?
Super Family 1 геликазасы – спиральдық белсенділікті бейнелейтін ішкі ядро ақуызымен қатар гексамерлі құрылымды қамтитын спираль түрі. SF1 геликазы - геликаздың ең үлкен кластарының бірі және оны одан әрі SF1A спиралдары және SF1B спиралдары ретінде жіктеуге болады. PcrA, Rep және UvrD сияқты ақуыздар SF1A спиральдары класына жатады. Салыстыру үшін RecA және Dda сияқты ақуыздар SF1B спиралдарының класына жатады. SF1 спиральдарының функциялары кең көлемде өзгереді. SF1 геликазаларының кейбір өмірлік маңызды функцияларына ДНҚ репликациясы, ДНҚ рекомбинациясы, Оказаки фрагменттерін өңдеу, теломерлердің түзілуі және ДНҚ зақымдануының нуклеотидтердің эксцизиясын қалпына келтіру жатады. Кейбір бактериялық түрлерде SF1 типті геликаздар конъюгация арқылы көлденең генді тасымалдауға көмектеседі. Сонымен қатар, вирустарда SF1 спиральдары вирустың репликациясына көмектеседі.
01-сурет: спираль әрекеті
SF1 спиральдарының құрылымымен байланысты көптеген түрлі мотивтер бар. Оларда SF1 спиралдарының (Q, I, Ia, II, III, IV, V және VI) әр түрлі түрлерінің арасында кемінде 7 сақталған мотивтер бар. SF1 геликазының құрылымы кристалл болып табылады, мұнда мотивтер біріктірілген. Мотивтер мен ДНҚ байланыстыру орны арасында тән АТФ байланыстыру қалтасы бар. Консервацияланбаған домендер геликаз молекуласының құрылымдық тұтастығын сақтау үшін таратылады. Бұл домендер SF1A спиралдары мен SF1B спиралдары арасында өзгеруі мүмкін.
SF2 дегеніміз не?
Super family 2 спираль - спиральдық суперотбасылардың ең алуан түрлі топтарының бірі. SF2 спиралдарының көптеген түрлері бар, мысалы, RecQ тәрізді спиральдар, RecG – спираль тәрізді, Rad3/XPD және NS3 спиральдары. Кейбір шектеу ферменттері, мысалы, I типті шектеу ферменттері де осы санатқа жатады. SF2 спиралдарының жалпы қызметі қос тізбекті ДНҚ-ны ағыту болып табылады. Дегенмен, SF2 спиральдарының кейбір түрлерінің геликаза ферменттері ретінде толық әрекет ету мүмкіндігі жоқ. SF2 спиральдары РНҚ өңдеуде де кеңінен қолданылады. SF2 спиральдарының DEAD-box отбасы транскрипцияны, сплайсингті, трансляцияны өңдеуді және РНҚ-ақуыз кешенін құрастыруды қоса алғанда, РНҚ өңдеуге қатысады.
02-сурет: спираль
SF2 спиралының құрылымында да сақталған мотивтер бар. Дегенмен, кейбір домендер SF1 спиралынан аздап ерекшеленеді. Олар сонымен қатар ДНҚ байланыстыру доменінен бөлек ATP байланыстыру доменін қамтиды.
SF1 және SF2 арасындағы қандай ұқсастықтар бар?
- SF1 және SF2 спираль белсенділігін көрсетеді.
- Сонымен қатар екеуі де ДНҚ репликациясына және рекомбинациясына қатысады.
- SF1 және SF2 сақталған мотивтерден тұрады.
- Екеуінде де ATP байланыстыру домені және ДНҚ байланыстыру домені бар.
- Бұл пішіндер көп доменді ақуыздар.
- Сонымен қатар, егер мутация екі түрде де орын алса, бұл зиянды әсерлерге әкеледі.
- SF1 және SF2 екеуі де жасушалық циклдің үздіксіздігін қамтамасыз ету үшін өте маңызды.
- SF1 және SF2 прокариоттарда да, эукариоттарда да кездеседі.
SF1 мен SF2 арасындағы айырмашылық неде?
SF1 және SF2 - спиральдың екі супер тұқымдасы. Олар кең әртүрлілікті көрсетеді. SF1 мен SF2 арасындағы негізгі айырмашылық SF1 негізінен ДНҚ-ны ашуға қатысады, ал SF2 транскрипция және трансляция кезінде РНҚ өңдеуге қатысады. Ақуыздың әртүрлі мотивтерін салыстыру кезінде SF1 және SF2 бірінші кезекте III мотив пен IV мотивке негізделген. Олардың құрылымдық ұқсастығы болса да, SF1 спиральдары тороидты гексамерлі құрылымдарды құрайды, ал SF2 бұл құрылымдық құрылымдарды құрмайды.
SF1 мен SF2 арасындағы тағы бір айырмашылық мынада: SF1 спиральдары аденин нуклеотидтерін көбірек ұнатады, ал SF2 спиралдары ағыту үшін барлық бес нуклеотидті де жақсы көреді. Орау бағытын салыстырған кезде, SF1 спиральдары тек 5'-3' бағытта орын ауыстырады, ал SF2 спиралдары екі бағытта да нуклеин қышқылдарымен бірге орын ауыстыру мүмкіндігіне ие.
Төмендегі инфографика SF1 және SF2 арасындағы айырмашылықтарды қатар салыстыру үшін кесте түрінде ұсынады.
Қорытынды – SF1 және SF2
Геликаздар – ДНҚ репликациясына қатысатын өте маңызды және алуан түрлі ферменттер тобы. Дегенмен, жоғары әртүрлілігіне байланысты ферменттер суперфамилияларға бөлінеді. SF1 және SF2 - спиральдардың екі үлкен супер тұқымдасы. SF1 негізінен ДНҚ-ға қатысты өңдеумен байланысты болса, SF2 ДНҚ және РНҚ өңдеумен байланысты. Осылайша, бұл SF1 мен SF2 арасындағы негізгі айырмашылық. Сонымен қатар, SF1 және SF2 құрылымдық орналасуымен ерекшеленеді, өйткені SF2 гексамерлі құрылымдарды құрмайды. SF1 және SF2 спиральдарындағы мутациялар жасушалық циклдің және ДНҚ репарациясы сияқты басқа өмірлік маңызды механизмдердің реттелуінің бұзылуынан кейін қатерлі ісіктің дамуына әкеледі.
