ITS1 мен ITS2 арасындағы негізгі айырмашылық мынада: ITS1 эукариоттардағы 18S және 5.8S рРНҚ гендері арасында орналасқан аралық ДНҚ, ал ITS2 - эукариоттарда 5,8S және 28S рРНҚ гендері арасында орналасқан аралық ДНҚ.
Ішкі транскрипцияланған аралық (ITS) – әдетте хромосомадағы кіші суббірлік рибосомалық РНҚ мен үлкен суббірлік рибосомалық РНҚ гендері арасында немесе полицистрондық рРНҚ прекурсоры транскрипт молекуласындағы сәйкес транскрипцияланған аймақта орналасқан аралық ДНҚ. Бактериялар мен архейлерде 16S және 23S рРНҚ гендерінің арасында жалғыз ITS бар. Бірақ эукариоттарда екі ITS аралық ДНҚ бар: ITS1 (18S мен 5 арасында.8S рРНҚ гендер) және ITS2 (5,8S және 28S рРНҚ арасында). Демек, ITS1 және ITS2 эукариоттардағы рРНҚ гендері арасында табылған екі аралық ДНҚ болып табылады.
ITS1 дегеніміз не?
ITS1 - эукариоттардағы 18S және 5,8S рРНҚ гендері арасында орналасқан аралық ДНҚ. ITS рРНҚ гендері арасында орналасқан функционалды емес аралық ДНҚ бөлігін білдіреді. ITS1 ұзындығы ITS2-ге қарағанда көбірек өзгереді. ITS1 ұзындығының өзгеруі шамамен (200-300 бит). ITS1 сияқты ITS маркерлері әртүрлі таксондар арасындағы филогенетикалық қатынастарды түсіндіруде тиімділігін дәлелдеді. Сонымен қатар, ITS1 аралық ДНҚ ITS2 аралық ДНҚ-ға қарағанда аз сақталады. ITS1 құрылымдары әлдеқайда кіші таксономиялық бірліктерде ғана сақталады. Әрбір эукариоттық рибосомалық кластерде сыртқы транскрипцияланған аралық бөліктер (5’ және 3’ ETS) деп аталатын аймақтар да бар.
01-сурет: ITS1 аймағы
ITS1 аралық қосқыш ДНҚ 5'сыртқы транскрипцияланған аралық қосқышқа (5' ETS) өте жақын. Сонымен қатар, егер біреу филогенетикалық қарым-қатынастарды зерттеу үшін ITS1 аймағын күшейткісі келсе, олар осы мақсат үшін арнайы праймер жұбын (кері және тура праймерлер) пайдалануы керек. ITS1 аймағын күшейту үшін әдетте зертханалардың ПТР хаттамаларында екі праймер жинағы пайдаланылады. Олар ITS1 алға және ITS2 кері немесе ITS1 алға және ITS4 кері.
ITS2 дегеніміз не?
ITS2 - эукариоттардағы 5,8S және 28S рРНҚ гендері арасында орналасқан аралық ДНҚ. ITS2 аймағының ұзындығы ITS1 аймағына қарағанда қысқарақ. ITS2 ұзындығының өзгеруі шамамен (180-240 бит). Дегенмен, ITS2 аймағы көптеген таксономиялық бірліктерде ITS1 аймағына қарағанда көбірек сақталған. Ол барлық ITS2 тізбегі қайталама құрылымның ортақ өзегін бөлісетінін анықтайды. Сонымен қатар, ITS2 аймағының 40% барлық ангиоспермдердің арасында сақталады, ал ITS2 аймағының 50% отбасы мен одан жоғары деңгейде теңестіруге болады.
02-сурет: ITS2 аймағы
Сақтау көлеміне қарамастан, ITS2 аймағын пайдалану филогенетикалық қатынастарды зерттеуде, әсіресе саңырауқұлақ ДНҚ штрих-кодтауында ITS1 аймағы сияқты өте танымал. ITS2 аймағын күшейту үшін әдетте зертханалардың ПТР хаттамаларында арнайы праймер жинағы пайдаланылады. Яғни ITS1 алға және ITS4 кері. Бірақ ПТР хаттамасы осы праймер жиынтығын пайдаланған кезде, ол ITS1 аймағын ITS2 аймағымен бірге күшейтеді. Сонымен қатар, ITS2 аралық қосқыш ДНҚ 3'сыртқы транскрипцияланған аралық қосқышқа (3' ETS) өте жақын.
ITS1 және ITS2 арасындағы ұқсастықтар
- ITS1 және ITS2 - рРНҚ гендері арасында орналасқан екі аралық ДНҚ.
- Олар тек эукариоттарда болады.
- Екеуі де арнайы праймер жұптарын пайдалану арқылы күшейтілуі мүмкін.
- Олардың екеуі де рРНҚ жетілуінде функционалды емес жанама өнімдер ретінде эксцизденеді.
- Екеуі де филогенетикалық қатынасты зерттеу үшін өте маңызды, әсіресе саңырауқұлақ ДНҚ штрих-кодында.
ITS1 және ITS2 арасындағы айырмашылық
ITS1 - эукариоттарда 18S және 5,8S рРНҚ гендері арасында болатын аралық ДНҚ, ал ITS2 - эукариоттарда 5,8S және 28S рРНҚ гендері арасында орналасқан аралық ДНҚ. Сонымен, бұл ITS1 мен ITS2 арасындағы негізгі айырмашылық. Сонымен қатар, ITS1 ITS2-мен салыстырғанда ұзындықтың үлкен вариациясына ие. Екінші жағынан, ITS2-де ITS1-мен салыстырғанда қысқарақ ұзындығы бар. Бұл ITS1 мен ITS2 арасындағы тағы бір айырмашылық.
Төмендегі инфографика ITS1 және ITS2 арасындағы айырмашылықтарды қатар салыстыру үшін кесте түрінде көрсетеді.
Қорытынды – ITS1 және ITS2
Ішкі транскрипцияланған аймақ (ITS) - рРНҚ гендері арасында орналасқан аралық ДНҚ-ның жұмыс істемейтін бөлігі. Бактериялар мен археяларда тек жалғыз ITS аймағы бар. Бірақ эукариоттарда екі ITS аймағы бар: ITS1 және ITS2. ITS1 - эукариоттарда 18S және 5,8S рРНҚ гендері арасында орналасқан аралық ДНҚ, ал ITS2 - эукариоттарда 5,8S және 28S рРНҚ гендері арасында орналасқан аралық ДНҚ. Осылайша, бұл ITS1 және ITS2 арасындағы айырмашылықтың қысқаша мазмұны.
