PFGE мен CRP талдауының негізгі айырмашылығы мынада: PFGE мезгіл-мезгіл өзгеретін электр өрісін қолдану арқылы үлкен ДНҚ молекулаларын бөлу үшін қолданылатын зертханалық әдіс, ал CRP (c-реактивті ақуыз) талдауы қан плазмасында сақина тәрізді ақуызды анықтайды.
PFGE және CRP талдауы - ғалымдар адам ағзасына зақым келтіретін әртүрлі патогендік ағзаларды анықтау үшін қолданатын екі әдіс. Импульстік өрісті гельдік электрофорез (PFGE) – патогеннің, әсіресе бактериялық изоляттың ДНҚ саусақ ізін анықтайтын тікелей зертханалық әдіс. Екінші жағынан, CRP - бұл қабыну нәтижесінде пайда болған қандағы белгілі бір ақуызды анықтау үшін қолданылатын жанама сынақ. Бұл қабынулар әдетте бактериялық немесе басқа патогендердің инфекцияларына байланысты.
PFGE дегеніміз не?
Импульсті-өрісті гель электрофорезі – электр өрісін қолдану арқылы гельдік матрицадағы үлкен ДНҚ молекулаларын бөлу үшін қолданылатын әдіс. Электр өрісі периодты түрде өз бағытын өзгертеді. Ол гендік инженерия немесе әртүрлі организмдердің генотипін анықтау үшін қолданылуы мүмкін. PFGE процедурасы стандартты гельдік электрофорез әдісіне салыстырмалы түрде ұқсас. Жалғыз айырмашылық - үш бағытта мезгіл-мезгіл өзгеретін кернеу. Бір бағыт гельдің орталық осі арқылы өтеді, ал қалған екеуі екі жағында 60 градус бұрышта өтеді. Импульс уақыты әр бағыт үшін бірдей болғандықтан, бұл ДНҚ-ның таза алға көшуіне әкеледі.
01-сурет: PFGE талдауы
Бұл процедура шешілетін фрагменттердің өлшеміне байланысты жалпы гельдік электрофорезге қарағанда ұзағырақ уақыт алады. PFGE техникасында электр өрісі бағытының өзгеруімен ДНҚ-ның әртүрлі ұзындықтары өзгерістерге әртүрлі жылдамдықпен әрекет етеді. Үлкен ДНҚ фрагменттері тез түзетілетін кіші ДНҚ фрагменттерімен салыстырғанда баяу қалпына келеді. Сондықтан бұл әдіс арқылы ДНҚ фрагменттерін жақсырақ бөлуге болады.
PFGE әдетте Listeria monocytogenes сияқты бактериялық патогендерді анықтау үшін қолданылады. Бұл клиникалық инфекцияларды анықтаудың танымал әдісі.
CRP талдау дегеніміз не?
С-реактивті ақуыз (CRP) - қан плазмасында кездесетін сақиналы (сақина тәрізді) пентамерлі ақуыз. Әдетте, CRP қабынуға жауап ретінде концентрацияда жоғарылайды. CRP талдауы қан плазмасында осы ақуызды анықтауға негізделген. CRP ақуызы макрофагтар мен май жасушалары шығаратын белгілі бір факторларға жауап ретінде бауырда синтезделеді. CRP протеині – анықталатын алғашқы үлгі тану рецепторы (PRR).
02-сурет: CRP талдауы
СРП ақуыз деңгейінің жоғарылауы жарақаттан, инфаркттан, аутоиммундық бұзылулардан және сепсис сияқты бактериялық инфекциялардан кейін байқалуы мүмкін. Қан плазмасындағы CRP ақуызының қалыпты деңгейі литріне 0,3-10 миллиграмм (мг/л) құрайды. Қан тамырдан, әдетте науқастың қолынан алынады. Талдау биохимиялық өлшеу процедурасын қолдану арқылы жүзеге асырылады. CRP сынағы нәтижесінде 10 мг/л-ден жоғары CRP деңгейі ауыр инфекцияның (сепсис) белгісі болып табылады. CRP сынағы қабынудың орнын немесе себебін түсіндірмейді. Сондықтан дәрігерлер қабынудың себебін түсіндіру үшін қосымша тестілеуді ұсынуы керек. Кейде CRP протеинінің деңгейі темекі шегуге, семіздікке және жаттығулардың болмауына байланысты көтеріледі.
PFGE және CRP талдауының қандай ұқсастықтары бар?
- PFGE және CRP талдауы зертханаларда қолданылатын сынақ процедуралары болып табылады.
- Екеуі де биомолекулаларға бағытталған.
- Олар адам ауруларын анықтау үшін қолданылады.
- Бұл сынақтар қоздырғыштарды анықтауға қабілетті.
PFGE мен CRP талдауының айырмашылығы неде?
PFGE - периодты түрде өзгеретін электр өрісін қолдану арқылы үлкен ДНҚ молекулаларын бөлу үшін қолданылатын зертханалық әдіс. Керісінше, CRP талдауы қан плазмасындағы сақина тәрізді ақуыздарды анықтайтын әдіс болып табылады. Осылайша, бұл PFGE мен CRP талдауының негізгі айырмашылығы. Оның үстіне PFGE қоздырғыштарды тікелей анықтайды, ал CRP талдауы патогендерді жанама түрде анықтайды.
Төменде кесте түрінде PFGE және CRP талдауы арасындағы маңызды айырмашылықтардың тізімі берілген.
Қорытынды – PFGE және CRP талдауы
PFGE және CRP талдауы – клиникалық зертханаларда әдеттегідей қолданылатын екі сынақ. PFGE – ғалымдар ДНҚ саусақ іздерін, әсіресе бактериялық патогендерді алу үшін қолданатын зертханалық әдіс. С-реактивті протеин (CRP) сынағы қан плазмасындағы c-реактивті ақуыздың жоғарылауын анықтау арқылы қабынуды анықтау үшін қолданылады. Екі сынақтың да адам ауруларын анықтауда маңызы зор. Осылайша, бұл PFGE мен CRP талдауының арасындағы айырмашылықты қорытындылайды.
