Негізгі айырмашылық – Минисателлит пен Микросателлит
Қайталанатын ДНҚ – организмдердің геномында қайта-қайта қайталанатын нуклеотидтер тізбегі. Қайталанатын ДНҚ геномдық ДНҚ-ның едәуір бөлігін құрайды және тандемді қайталаулар, терминалдық қайталаулар және қиылысу қайталанулары деп аталатын үш негізгі түрі бар. Тандемді қайталаулар - үзіліссіз бір-біріне жақын орналасқан өте қайталанатын тізбектер. Омыртқалы жануарлар геномында тандемді қайталаудың үш негізгі түрі бар. Олар спутниктік ДНҚ, микросателлиттік ДНҚ және минисателлиттік ДНҚ. Минисателлит - 10-нан 100-ге дейінгі негізгі жұптардан тұратын қайталанатын тізбектің сериясынан тұратын, өте қайталанатын ДНҚ бөлімі. Микросателлит - 1-ден 9-ға дейінгі негізгі жұптардан тұратын қысқа қайталанатын тізбектерден тұратын қайталанатын ДНҚ бөлімі. Сондықтан, шағын жерсерік пен микросерік арасындағы негізгі айырмашылық - қайталанатын тізбектің өлшемі немесе ұзындығы.
Шағын жерсерік дегеніміз не?
Минисателлиттік ДНҚ – ұзындығы 10-60 негіз жұбы болатын қысқа ДНҚ қайталанатын тізбегінен тұратын ДНҚ бөлімі. Шағын жерсеріктерді айнымалы сандар тандемінің қайталануы (VNTR) деп те атайды. Шағын жерсеріктерді микроспутниктермен жиі шатастырады. Дегенмен, минисателлиттер мен микросеріктерді ғалымдар қайталанатын реттілік өлшеміне қарай ажыратады.
Миниспутниктерді адам геномының 1000-нан астам жерінен көруге болады. Бұл қысқа реттіліктер G және C әрпіне бай. Берілген шағын жерсеріктегі қайталанулар саны жеке адамдар арасында әр түрлі болады.
Адамның алғашқы шағын жерсерігін 1980 жылы А. Р. Уайман және Р. Уайт анықтаған. Кейінірек Алек Джеффрис организмдер арасындағы минисеріктердің көшірме санының шектен тыс полиморфизмін ашты. Бұл ашылулар минисателлиттерді ДНҚ саусақ іздерін алу, байланыстарды талдау және популяцияны зерттеу үшін тамаша маркерлер ретінде жасады. Минисателлиттер сонымен қатар ген экспрессиясын, транскрипцияны, балама сплайсингті және т.б. реттеуге үлес қосады.
Микросателлит дегеніміз не?
Микросателлит – ДНҚ-ның 1-ден 10-ға дейінгі негізгі жұпқа дейінгі қарапайым реттілік қайталануы бар бөлімі. Микросателлиттерді қысқа ретті қайталаулар (SSR) немесе қарапайым тандемді қайталаулар (STR) деп те атайды. Қарапайым микроспутниктер және композиттік микросателлит деп аталатын микросеріктердің екі түрі бар. Қарапайым микроспутниктер қайталанатын тізбектердің тек бір түрінен тұрады. Құрама микросателлиттер қайталанудың бірнеше түрінен тұрады. Микросателлиттерде көбінесе поли А/Т аймақтары болады. Микросателлиттер кодоминантты және эукариоттық геномдарда көп.
Шағын жерсеріктерге ұқсас, микросеріктер де жеке адамдар арасында полиморфизмді көрсетеді. Берілген микросателлит үшін қайталанулар саны жеке адамдар арасында әр түрлі болады. Сондықтан микросателлиттерді ДНҚ саусақ іздерін алуда генетикалық маркерлер ретінде де қолдануға болады. Микросателлиттік полиморфизмді ПТР және гельдік электрофорез арқылы оңай анықтауға болады. Микросателлиттің қаптал аймағы туысқан түрлерде жоғары деңгейде сақталған.
Мисателлит пен микросателлиттің қандай ұқсастықтары бар?
- Шағын жерсеріктері мен микросеріктері кодталмаған ДНҚ тізбегі болып табылады.
- Екеуі де тандемді қайталау.
- Екеуі де қайталанатын реттіліктерден тұрады.
- Екеуі де ДНҚ саусақ ізі үшін күшті генетикалық маркерлер ретінде пайдаланылуы мүмкін.
Мисателлит пен микросателлиттің айырмашылығы неде?
Минисателлит пен Микросателлит |
|
| Минисателлиттер - мономердің қайталану ұзақтығы 10-100 негізгі жұп болатын тандемді қайталаулар. | Микросателлиттер - 1-9 негізгі жұп мономер қайталанатын тізбектерден тұратын қысқа тандемдік қайталанулар. |
| Қайталанатын тізбектің өлшемі | |
| Минисателлитте 10-100 негізгі жұптың қайталанатын тізбегі бар. | Microsatellite 1-9 негізгі жұптан тұратын қысқа реттіліктерге ие. |
| Жалпы негіздер | |
| Шағын жерсеріктері G және C негіздеріне бай. | Микроспутниктер A және T негіздеріне бай. |
| Басқа атаулар | |
| Шағын жерсеріктері айнымалы сандық тандемді қайталаулар (VNTR) ретінде де белгілі. | Микроспутниктер қысқа ретті қайталаулар (SSR) немесе қарапайым тандемді қайталаулар (STR) ретінде де белгілі. |
Қорытынды – Minisatellite және Microsatellite
Минисателлит және микросерік - тандемді қайталаудың екі түрі. Олар қайталанатын тізбектегі негіздердің санына немесе реттілік өлшеміне қарай ажыратылады. Шағын жерсеріктің 10-нан 100-ге дейінгі негізгі жұп ұзындығының қайталанатын тізбегі бар, ал микросателлиттің 1-ден 9-ға дейінгі негізгі жұптың қайталанатын тізбегі бар. Бұл минисателлит пен микросателлиттің негізгі айырмашылығы. Минисателлиттерде және микросателлиттерде қайталанатын тізбектердің көшірме саны жеке адамдар арасында кеңінен өзгереді. Минисателлиттер де, микросателлиттер де түрлердің популяцияларының ішіндегі және арасындағы генетикалық вариацияны талдауға арналған қуатты ДНҚ маркерлері болып табылады.
Minisatellite және Microsatellite қолданбасының PDF нұсқасын жүктеп алу
Осы мақаланың PDF нұсқасын жүктеп алып, дәйексөздерге сәйкес офлайн мақсаттарда пайдалануға болады. PDF нұсқасын мына жерден жүктеп алыңыз: Минисателлит пен микросателлиттің айырмашылығы.
