LTR және LTR емес ретротранспозондар арасындағы негізгі айырмашылық мынада: LTR ретротранспозондары құрылымында ұзақ терминалдық қайталанулары бар ретротранспозондардың бір түрі болып табылады, ал LTR емес ретротранспозондар ұзақ терминалдық қайталанулары жоқ ретротранспозондардың бір түрі болып табылады. олардың құрылымында.
Ретротранспозондар (I класс транспозиционды элементтер немесе РНҚ аралық өнімдері арқылы транспозондар) – өздерін әртүрлі геномдық орындарға көшіріп, қоя алатын генетикалық компонент түрі. Олар мұны РНҚ транспозициясының аралық затын пайдаланып кері транскрипция деп аталатын процесс арқылы РНҚ-ны қайтадан ДНҚ-ға түрлендіру арқылы жүзеге асырады. LTR және LTR емес ретротранспозондар сияқты ретротранспозондардың екі негізгі түрі бар
LTR ретротранспозондары дегеніміз не?
LTR ретротранспозондары – құрылымында ұзақ терминалдық қайталанулары бар ретротранспозондардың бір түрі. Қайталанатын ДНҚ-ның ұзын тізбектерін LTR ретротранспозонының әр ұшынан табуға болады. Олар ұзақ терминалдық қайталаулар (LTR) ретінде белгілі. Әрбір LTR ұзындығы бірнеше жүз негізгі жұпты құрайды. LTR ретротранспозондарының ұзындығы әдетте 5 килобазадан асады. Сонымен қатар, ұзақ терминалдық қайталанулар арасында ретровирус гендерінің gag және pol эквивалентіне транскрипцияланатын гендер бар. Бұл гендер әдетте алынған транскриптті функционалды ген өнімдеріне өңдейтін протеазаны кодтайтындай қабаттасады.
01-сурет: LTR ретротранспозондары
Ретротранспозондардың Gag гені басқа ретротранспозондар транскрипттерімен байланысып, вирус тәрізді бөлшектерді түзетін өнімді жасайды. Пол гені кері транскриптаза, интеграза және рибонуклеаза Н домендері сияқты ферменттерді қамтитын өнімдерді жасайды. Кері транскриптаза ферменті ретротранспозондық ДНҚ-ның кері транскрипциясын жүзеге асырады. Интеграза ферменті ретротранспозондық ДНҚ-ны эукариоттық геномның ДНҚ-сына біріктіреді. Рибонуклеаза H домендері РНҚ аралық өнімдері арасындағы фосфодиэфирлік байланыстарды үзуге көмектеседі. LTR ретротранспозондары сонымен бірге кері транскрипциядан өте оңай өтуі үшін тРНҚ байланыстыру орындары бар транскрипттерді кодтайды. Сонымен қатар, ретротранспозон құрамында эукариот геномы туралы ақпарат болғандықтан, ол өзінің көшірмелерін эукариоттық жасуша ішіндегі басқа геномдық орындарға енгізе алады.
LTR емес ретротранспозондар дегеніміз не?
LTR емес ретротранспозондар – құрылымында ұзақ терминалдық қайталанулары жоқ ретротранспозондардың түрі. LTR ретротранспозондары сияқты, LTR емес ретротранспозондарда да кері транскриптаза, РНҚ байланыстыратын ақуыз, нуклеаза және кейде рибонуклеаза Н домендері үшін гендер бар. Бірақ оларда ұзақ терминалдық қайталаулар жетіспейді; орнына, оларда бір-бірінің қасында негіздердің төңкерілген реті болуы мүмкін қысқа қайталаулар бар. РНҚ байланыстыратын ақуыздар РНҚ транспозициясының аралық өнімімен байланысады, ал нуклеазалар нуклеин қышқылдарындағы нуклеотидтер арасындағы фосфодиэфирлік байланыстарды бұзады.
02-сурет: LTR және LTR емес ретротранспозондар
Олар ретротранспозондар болғанымен, олар LTR ретротранспозондары сияқты РНҚ аралық өнімін пайдаланып кері транскрипцияны жүзеге асыра алмайды. Себебі LTR емес ретротранспозондарда тРНҚ-ны байланыстыратын тізбектер болмайды. Демек, мРНҚ-ға транскрипцияланған және белоктарға ауысқан LTR емес ретротранспозон кері транскриптаза қызметін атқарады. Кері транскриптаза жаңа сайтта геномға біріктірілуі мүмкін LTR емес ретротранспозонның РНҚ-ның ДНҚ көшірмесін жасайды. Сонымен қатар, LTR емес ретротранспозондар екі түрге бөлінеді: LINE (ұзын кесілген ядролық элементтер) және SINEs (қысқа кесілген ядролық элементтер).
LTR және LTR емес ретротранспозондардың қандай ұқсастықтары бар?
- LTR және LTR емес ретротранспозондар ретротранспозондардың екі негізгі түрі болып табылады.
- Екі түрде де кері транскриптаза, РНҚ байланыстыратын ақуыз, нуклеаза және рибонуклеаза H домендері сияқты ферменттерге арналған гендер бар.
- Оларды адам геномында табуға болады.
- Екі түрі де эволюциялық маңызды.
LTR және LTR емес ретротранспозондардың айырмашылығы неде?
LTR ретротранспозондарының құрылымында ұзақ терминалдық қайталанулар болады, ал LTR емес ретротранспозондарда олардың құрылымында ұзақ терминалдық қайталанулар жоқ. Осылайша, бұл LTR және LTR емес ретротранспозондар арасындағы негізгі айырмашылық. Сонымен қатар, LTR ретротранспозондарында ұзақ тікелей қайталанулар бар, олар өздерін қайталайтын негіздердің бір тізбегі ғана. Екінші жағынан, LTR емес ретротранспозондарда бір-бірінің қасында негіздердің төңкерілген реті болуы мүмкін қысқа қайталаулар болады.
Төмендегі инфографикада LTR және LTR емес ретротранспозондар арасындағы айырмашылықтар қатар салыстыру үшін кесте түрінде берілген.
Қорытынды – LTR және LTR емес ретротранспозондар
LTR және LTR емес ретротранспозондар ретротранспозондардың екі негізгі түрі болып табылады. LTR ретротранспозондарының құрылымында ұзақ терминалдық қайталанулар болады, ал LTR емес ретротранспозондарда олардың құрылымында ұзақ терминалдық қайталанулар болмайды. Демек, бұл LTR және LTR емес ретротранспозондар арасындағы негізгі айырмашылық.
