Рестрикциялық эндонуклеаза мен экзонуклеазаның негізгі айырмашылығы мынада: рестрикциялық эндонуклеаза белгілі бір ДНҚ тізбегін танитын және ДНҚ-ны сол тізбегінің ішінде немесе оған іргелес ыдырататын нуклеаза ферменті, ал экзонуклеаза - нуклеотидтерді ыдырататын нуклеаза ферменті. полинуклеотидтер 5' ұшынан немесе 3' ұшынан бір-бірден.
Нуклеазалар – нуклеин қышқылдарының нуклеотидтері арасындағы фосфодиэфирлік байланыстарды үзетін ферменттер. Тірі организмдерде олар жасушадағы ДНҚ жөндеудің көптеген аспектілері үшін маңызды құралдар болып табылады. Бұл ферменттердің ақаулары генетикалық тұрақсыздық пен иммун тапшылығын тудыруы мүмкін. Рестрикциялық нуклеазалар - жұмыс істеуі белгілі бір нуклеотидтер тізбегіне тәуелді арнайы нуклеазалар. Мысал ретінде рестрикциялық эндонуклеазаны келтіруге болады. Эндонуклеаза және экзонуклеаза сияқты белсенділік локусына негізделген нуклеазалардың негізгі классификациясы бар. Эндонуклеаза мақсатты ДНҚ молекуласының ортасындағы аймақтарды қорытады. Экзонуклеаза нуклеин қышқылдарын ұшынан сіңіреді. Демек, рестрикциялық эндонуклеаза және экзонуклеаза нуклеаза ферменттерінің екі түрі болып табылады.
Шектеу эндонуклеазасы дегеніміз не?
Рестрикциялық эндонуклеаза – бұл белгілі бір ДНҚ тізбегін танитын және ДНҚ-ны сол тізбегінің ішінде немесе оған іргелес бөлетін нуклеаза ферменті. Арнайы ДНҚ тізбегі шектеу орны ретінде белгілі. Оны рестриктаза немесе рестриктаза деп те атайды. Рестрикциялық эндонуклеаза өте ерекше фермент болып табылады. Бұл ферменттердің кеңірек эндонуклеаза тобының бір класы. Рестрикциялық эндонуклеазалар әдетте құрылымымен және тану орнындағы ДНҚ субстратын кесу қабілетімен ерекшеленетін бес түрге жіктеледі. Бес түрі - I тип, II тип, III тип, IV тип және V түрі.
01-сурет: шектеуші эндонуклеаза
Рестрикциялық эндонуклеазалар әдетте бактериялар мен археяларда кездеседі. Олар бактерияларды вирустардан қорғау механизмін қамтамасыз етеді. 3600-ден астам рестрикциялық эндонуклеазалар белгілі. Олар 250-ден астам әртүрлі ерекшеліктерді білдіреді. Олардың 3000-нан астамы егжей-тегжейлі зерттелген. Сонымен қатар, олардың 800-ден астамы коммерциялық қол жетімді.
Экзонуклеаза дегеніміз не?
Экзонуклеаза – полинуклеотидтегі нуклеотидтерді 5’ ұшынан немесе 3’ ұшынан бір-бірден бөлетін нуклеаза ферменті. Бұл соңында нуклеотидтер арасындағы фосфодиэфирлік байланыстарды бұзатын гидролиздік реакция арқылы жүреді. Эукариоттар мен прокариоттарда экзонуклеазалардың үш түрі бар. Бұл экзонуклеазалар мРНҚ-ның қалыпты айналымына қатысады. Олар 5' - 3' экзонуклеаза (Xrn1), 3' - 5' экзонуклеаза және поли-А спецификалық 3' - 5' экзонуклеаза. 5' - 3' экзонуклеаза - тәуелді декаптикалық ақуыз. 3' - 5' экзонуклеаза тәуелсіз ақуыз болып табылады. Поли А спецификалық 3'-5' экзонуклеаза поли-А құйрығының экзонуклеолитикалық ыдырауына қатысатын поли-А-спецификалық рибонуклеаза ретінде де белгілі.
02-сурет: экзонуклеаза
Архейлерде де, эукариоттарда да РНҚ ыдырауы 3'-5' экзорибонуклеазалардан тұратын көп белокты экзосомалар кешені арқылы жүзеге асады.
Рестрикциялық эндонуклеаза мен экзонуклеазаның қандай ұқсастықтары бар?
- Рестрикциялық эндонуклеаза және экзонуклеаза - нуклеаза ферменттерінің екі түрі.
- Екі фермент ДНҚ молекулаларын кеседі.
- Бұл ферменттер прокариоттарда кездеседі.
- Олар белоктар.
Рестрикциялық эндонуклеаза мен экзонуклеазаның айырмашылығы неде?
Рестрикциялық эндонуклеаза - белгілі бір ДНҚ тізбегін танитын және ДНҚ-ны сол тізбегінің ішінде немесе оған іргелес бөлетін нуклеаза ферменті, ал экзонуклеаза - полинуклеотидтегі нуклеотидтерді 5' немесе 3' ұшынан бөлетін нуклеаза ферменті бір уақытта. Сонымен, бұл шектеу эндонуклеазасы мен экзонуклеаза арасындағы негізгі айырмашылық. Оның үстіне рестрикциялық эндонуклеаза тек прокариоттарда, ал экзонуклеаза прокариоттарда да, эукариоттарда да кездеседі.
Келесі инфографика шектеуші эндонуклеаза мен экзонуклеаза арасындағы айырмашылықтарды қатар салыстыру үшін кесте түрінде көрсетеді.
Қорытынды – Шектеулі эндонуклеаза және экзонуклеаза
Нуклеазалар – нуклеин қышқылдарының нуклеотидтері арасындағы фосфодиэфирлік байланыстарды бұзатын ферменттер. Рестрикциялық эндонуклеаза және экзонуклеаза - нуклеаза ферменттерінің екі түрі. Рестрикциялық эндонуклеаза – бұл белгілі бір ДНҚ тізбегін танитын және ДНҚ-ны сол тізбегінің ішінде немесе оған іргелес бөлетін нуклеаза ферменті. Экзонуклеаза – полинуклеотидтегі нуклеотидтерді 5’ ұшынан немесе 3’ ұшынан бір-бірден бөлетін нуклеаза ферменті. Осылайша, бұл рестрикциялық эндонуклеаза мен экзонуклеаза арасындағы айырмашылықты қорытындылайды.
