ДНҚ мен РНҚ зондтарының негізгі айырмашылығы мынада: ДНҚ зондтары мақсатты нуклеотидтер тізбегіне қосымша болып табылатын ДНҚ фрагменттері, ал РНҚ зондтары мақсатты тізбектердің комплементарлы нуклеин қышқылы тізбегі болып табылатын бір тізбекті РНҚ созылымдары болып табылады.
Зонд – радиоактивті немесе радиоактивті емес молекулалармен таңбалануы мүмкін ДНҚ немесе РНҚ-ның жасанды түрде синтезделген қысқа тізбегі. Оның ұзындығы 100-ден 1000-ға дейін негіз болуы мүмкін. Зондтар зонд тізбегіне қосымша болып табылатын мақсатты нуклеотидтер тізбегін анықтауда пайдалы. Қосылғаннан кейін зондтар қосымша реттіліктермен немесе мақсатты тізбектермен будандастырылады және радиоактивтілікті тасымалдайтындықтан, мақсатты тізбектерді анықтау үшін оны көрінетін етеді. Зондтар генетикалық ауруларды анықтау, вирусология, сот-медициналық патология, әке болуды анықтау, ДНҚ саусақ ізін алу, RFLP, молекулалық цитогенетика, in situ будандастыру және т.б. сияқты көптеген микробтық және молекулалық салаларда маңызды молекулярлық құрал болып табылады.
ДНҚ зондтары дегеніміз не?
ДНҚ зондтары – ДНҚ-ның бір тізбекті созылымдары. Оларды будандастыру арқылы комплементарлы нуклеин қышқылы тізбектерінің (мақсатты тізбектердің) болуын анықтау үшін пайдалануға болады. ДНҚ зонды комплементарлы тізбегімен будандастырылғаннан кейін ол қос тізбекті гибридті құрайды. Оларды анықтау үшін ДНҚ зондтары әдетте радиоизотоптармен, биотинмен, эпитоптармен немесе флюорофорлармен белгіленеді. Биотинмен белгіленген ДНҚ зондтарын бірқатар ферментативті және химиялық әдістер арқылы стрептавидинмен белгіленген сілтілі фосфатазамен анықтауға болады.
01-сурет: ДНҚ зонды
ДНҚ зондының нуклеотидтер тізбегі белгілі. Олар ұзындығы 100-ден 1000 негізгі жұпқа дейінгі қысқа тізбектер. Ұзын ДНҚ зондтарын рекомбинантты ДНҚ технологиясы арқылы жасауға болады. Оларды ПТР және клондау арқылы да жасауға болады. Клиникалық микробиология зертханаларында жұқпалы ауруларды жылдам диагностикалау үшін ДНҚ зондтары оңай қол жетімді.
РНҚ зондтары дегеніміз не?
РНҚ зондтары – РНҚ-ның бір тізбекті созылымдары. Олар үлгідегі мақсатты реттіліктерге қосымша реттіліктер. Олар әдетте ДНҚ-ның in vitro транскрипциясы арқылы SP6, T7 немесе T3 бактериофагтарының РНҚ полимеразаларымен синтезделеді. Ұзын РНҚ зондтарын сызықтық плазмидті ДНҚ-дан in vitro транскрипциясы арқылы жасауға болады. Жалпы, РНҚ зондтары ДНҚ зондтарына қарағанда олардың комплементарлы тізбегімен күшті және тығыз байланысады. ДНҚ зондтары сияқты, РНҚ зондтарын да транскрипциялау кезінде белгілеуге болады.
ДНҚ мен РНҚ зондтарының қандай ұқсастықтары бар?
- ДНҚ және РНҚ зондтары бір тізбекті нуклеотидтер тізбегі.
- Екеуі де жасанды түрде жасалған және синтезделген.
- Сонымен қатар олар радиоизотоптармен, эпитоптармен, биотинмен немесе флюорофорлармен белгіленуі мүмкін.
- Олардың белгілі бір ДНҚ немесе РНҚ мақсатты тізбегіне қатты жақындығы бар.
- Олар мақсатты нуклеин қышқылдарының ретін анықтау үшін әртүрлі тазарту және in situ будандастыру әдістерінде қолданылады.
- Зондтардың екі түрін де қосымша ретімен будандастыруға болады.
- Олар сонымен қатар микроорганизмдерді анықтауда және инфекциялық, тұқым қуалайтын және басқа ауруларды диагностикалауда қолданылады.
ДНҚ мен РНҚ зондтарының айырмашылығы неде?
ДНҚ зонды – мақсатты тізбекті толықтыратын ДНҚ-ның қысқа бөлігі. Екінші жағынан, РНҚ зонды - мақсатты тізбекті толықтыратын РНҚ-ның қысқа бір тізбекті созылуы. Осылайша, бұл ДНҚ мен РНҚ зондтарының арасындағы негізгі айырмашылық. Сонымен қатар, ДНҚ зондтарында A, T, C және G, ал РНҚ зондтарында A, U, C және G бар.
Сонымен қатар, ДНҚ мен РНҚ зондтарының арасындағы тағы бір айырмашылық олардың термодинамикалық тұрақтылығы болып табылады. РНҚ зондтары ДНҚ зондтарымен салыстырғанда үлкен термодинамикалық тұрақтылықты көрсетеді.
Төменде инфографика ДНҚ және РНҚ зондтары арасындағы маңызды айырмашылықтарды кестелейді.
Қорытынды – ДНҚ және РНҚ зондтары
Зонд – молекулалық будандастыру арқылы ДНҚ немесе РНҚ үлгісінде белгілі бір тізбектің болуын анықтау үшін қолданылатын ДНҚ немесе РНҚ-ның шағын фрагменті. ДНҚ зондтары қысқа бір тізбекті ДНҚ фрагменттері, ал РНҚ зондтары қысқа бір тізбекті РНҚ тізбегі. Олар белгілі тізбектер. РНҚ зондтарында термодинамикалық тұрақтылық ДНҚ зондтарына қарағанда жоғары. РНҚ зондтары ДНҚ зондтарын байланыстырғаннан гөрі олардың комплементарлы тізбектерімен тығыз байланысады. Осылайша, бұл ДНҚ мен РНҚ зондтарының арасындағы айырмашылықты қорытындылайды.
