Кленов фрагменті мен ДНҚ-полимераза 1 арасындағы негізгі айырмашылық мынада: Кленов фрагменті ДНҚ-полимераза 1-нің үлкен бөлігі болып табылады, онда 5′-3′ экзонуклеаза белсенділігі жоқ, ал ДНҚ полимераза үшеуі де бар E. coli ферменті болып табылады. домендер, соның ішінде 5′-3′ экзонуклеаза белсенділігі.
ДНҚ-полимераза тірі ағзалардағы ДНҚ репликациясына қатысатын негізгі ферменттердің бірі болып табылады. Өлшемі мен пішініне байланысты эукариоттар мен прокариоттарда кездесетін ДНҚ-полимераза ферментінің әртүрлі формалары бар. ДНҚ-полимераза 1, 2 және 3 тек прокариоттық организмдерде кездеседі және олар ДНҚ репликациясында әртүрлі рөл атқарады. ДНҚ-полимераза 1-де 5′ - 3′ полимераза, 3′ – 5′ экзонуклеаза белсенділігі және 5′ – 3′ экзонуклеаза белсенділігі бар үш домен бар. Кленов фрагменті ДНҚ-полимераза 1-нің протеолитикалық өнімі болып табылады. Ол ДНҚ-полимераза 1-нің 5-3′-полимераза және 3′-5′ экзонуклеаза белсенділігіне ие, бірақ оған 5′-3′ экзонуклеаза белсенділігі жоқ.
Кленоу фрагменті дегеніміз не?
Кленов фрагменті ДНҚ-полимераза 1-нің үлкен бөлігі болып табылады. ДНҚ-полимераза 1-ден айырмашылығы, Кленоу фрагментінде 5′-3′ экзонуклеаза белсенділігі байқалмайды, өйткені оның 5′-тен 3′ дейінгі алдыңғы экзонуклеаза домені жоқ. Кленоу фрагменттері ДНҚ-полимераза 1-ді субтилизин деп аталатын протеазамен ыдырату арқылы өндіріледі, ол ақуызды қорытатын фермент болып табылады. Кейбір қолданбаларда Кленоу фрагментінің 3′-тен 5′ке дейінгі экзонуклеаза белсенділігі қалаусыз болады. Оны Кленов фрагментін кодтайтын генге мутация енгізу арқылы жоюға болады. Алынған фермент тек 5′-3′ полимераза белсенділігі бар экзо-Кленоу фрагменті деп аталады. Морфологиялық жағынан Кленов фрагменті адамның оң қолына ұқсайды. Оның N-терминалды 3′-5′ экзонуклеаза домені және шамамен 30 A бөлінген C-терминал полимераза домені бар.
01-сурет: Кленов фрагменті және ДНҚ полимераза 1
Кленоу фрагменті молекулалық биологиялық әдістердегі маңызды құрал болып табылады. Klenow фрагменттерінің бірнеше қолданылуы бар. Олар доғал фрагменттерді алу үшін ұшты клондау кезінде өте маңызды. Кленоу фрагменттері 3′ саңылауларды алып тастай алады немесе 5′ саңылауларды толтырып, доғал ұштарды қалыптастырады. Сонымен қатар, Кленов фрагменттері қос тізбекті ДНҚ-ны бір тізбектен синтездеу үшін қолданылады. Бұдан басқа, олар 5’-3′ ДНҚ-ға тәуелді ДНҚ полимераза белсенділігін пайдаланып радиоактивті таңбаланған зондтарды дайындау үшін қолданылады.
ДНҚ-полимераза 1 дегеніміз не?
ДНҚ-полимераза 1 (Пол 1) - бактериялардың ДНҚ репликациясына қажетті прокариоттарда кездесетін фермент. Бұл 1956 жылы Артур Корнберг ашқан ДНҚ-полимеразаның бірінші түрі. Пол 1 - E. coli ішіндегі ең көп таралған полимераза. Ол полА генімен кодталған және 928 аминқышқылдарынан тұрады. Ол үш доменнен тұрады. Барлық үш домен әртүрлі функцияларды орындайды. Екі домен 5′ – 3′ экзонуклеаза белсенділігін және 3′ – 5′ экзонуклеаза белсенділігін жүзеге асырады. Пол 1-дің осы белсенділігінің арқасында ол ДНҚ репликациялаушы фермент емес, ДНҚ түзететін фермент ретінде танымал. Үшінші домен ДНҚ үлгісін шығарар алдында бірнеше полимерленуді (5′-тен 3′-ке дейін) катализдеу мүмкіндігіне ие және жаңа ДНҚ толтыру және РНҚ праймерлерін жою арқылы Оказаки фрагменттерін біріктіреді.
02-сурет: ДНҚ полимераза
E Coli-ден бөлінген Pol 1 молекулалық қолданбаларда кеңінен қолданылды. Алайда, Taq Polymerase ашылғаннан кейін ол ПТР технологиясында E Coli Pol 1-ді ауыстырды. Taq полимераза - Пол 1-ге жататын термотұрақты ДНҚ-полимераза түрі.
Кленов фрагменті мен ДНҚ-полимераза 1 арасындағы қандай ұқсастықтар бар?
- Кленоу фрагменті - ДНҚ-полимераза 1-нің үлкен бөлігі.
- Олардың 5'-3′ ДНҚ-ға тәуелді ДНҚ полимераза белсенділігі және 3’-5′ экзонуклеаза белсенділігі бар, олар түзетуге делдалды.
- Олар бірнеше мақсатта қолданылады.
Кленов фрагменті мен ДНҚ-полимераза 1 арасындағы айырмашылық неде?
Кленов фрагменті мен ДНҚ-полимераза 1 арасындағы негізгі айырмашылық мынада: Кленов фрагментінде 5'-3' экзонуклеаза белсенділігі жоқ, ал ДНҚ-полимераза 1-де 5'-3' экзонуклеаза белсенділігі бар. Демек, Кленоу фрагментінде екі домен бар, ал ДНҚ-полимераза 1 барлық үш доменге ие.
Төмендегі инфографика Кленов фрагменті мен ДНҚ-полимераза 1 арасындағы айырмашылықтың толығырақ мәліметтерін көрсетеді.
Қорытынды – Кленов фрагменті және ДНҚ полимераза 1
ДНҚ-полимераза 1 – E. coli ферменті, оның 5′-3′ полимерлену домені, 3′-тен 5′ дейінгі экзонуклеаза домені және 5′-тен 3′ дейінгі экзонуклеаза домені сияқты үш домені бар. Кленов фрагменті ДНҚ полимеразасының үлкен бөлігі болып табылады. Онда ДНҚ-полимераза 1-нің бір домені жоқ, ол 5′-тен 3′ дейінгі экзонуклеаза домені. Кленов фрагменті мен ДНҚ полимераза 1 арасындағы негізгі айырмашылық мынада: Кленов фрагменттері 5′-тен 3′ке дейін экзонуклеаза доменіне ие емес, ал ДНҚ-полимераза 1-де 5′-3′ экзонуклеаза домені бар.
