Гомодимер мен гетеродимердің басты айырмашылығы мынада: гомодимер екі бірдей ақуыздан жасалған ақуыз, ал гетеродимер екі түрлі ақуыздан жасалған ақуыз.
Белок – аминқышқылдарының тізбектерінен тұратын биомолекула. Протеин димері - екі ақуыз мономерінің немесе екі аминқышқыл тізбегінің қосылуынан түзілетін төрттік ақуыз құрылымы. Әдетте олар бір-бірімен ковалентті емес байланыстар арқылы байланысады. Белок димерлері гомодимерлер немесе гетеродимерлер болып табылады. Гомодимерде ковалентті емес байланысқан екі бірдей ақуыз бар. Гетеродимерде бір-бірімен байланысқан екі түрлі ақуыз бар. Бұл протеин димерінің әрекеттесуі реттеу мен катализде маңызды.
Гомодимер дегеніміз не?
Гомодимер – екі бірдей мономерден тұратын ақуыз димерінің бір түрі. Мономерлер ковалентті емес байланыстармен байланысады. Әдетте, гомодимерлерде H байланысының орташа саны 18 болады. Сонымен қатар, гомодимердегі Н-байланыстар мен интерфейс қалдықтары арасындағы корреляция коэффициенті 0,85. Сонымен қатар, гомодимердің интерфейстік қалдығы үшін H байланыстарының максималды саны 0,44 құрайды. Бұл ғана емес, гомодимерлерде молекулааралық H байланыстары да көп. Дегенмен, бір интерфейс қалдығы үшін H байланысының тығыздығы гомодимерлерде төмен.
01-сурет: Гомодимер
Гомодимерлерге мысалдарды қарастырғанда, 1-сыныптағы РНҚ-лар гомодимерлер болып табылады. Бұл гомодимерде R1 ақуызы нуклеотидтердің азаюына жауап береді, ал R2 ақуызы дирон тирозил массивінің орналасуына жауап береді. Басқа протеиннің гомодимері - қалқанша безі шығаратын тироглобулин. Ксантиноксидаза мен этанерцеп те ақуыздық гомодимерлер болып табылады.
Гетеродимер дегеніміз не?
Гетеродимер – екі бірдей емес мономерден комплексті ақуыз димерінің түрі. Басқаша айтқанда, гетеродимер - бұл екі түрлі ақуыз мономерінен тұратын ақуыз. Жалпы алғанда, гетеродимерлерде H байланысының 12 орташа саны бар. Сонымен қатар, гетеродимердегі Н-байланыстары мен интерфейстік қалдықтар арасындағы корреляция коэффициенті 0,83 құрайды. Сонымен қатар, гетеродимердің интерфейстік қалдығы үшін H байланыстарының максималды саны 0,65 құрайды. Гомодимерлермен салыстырғанда гетеродимерлерде молекулааралық Н байланыстары аз болады. Дегенмен, гетеродимерлерде интерфейс қалдығы үшін H байланысының тығыздығы жоғары.
02-сурет: гетеродимер
кері транскриптаза ферменті – екі түрлі аминқышқылдарының тізбегінен тұратын гетеродимер. Гетеродимердің тағы бір мысалы - опиоидты рецепторлар. Оның үстіне тубулин гетеродимер ақуызы болып табылады.
Гомодимер мен гетеродимердің қандай ұқсастықтары бар?
- Гомодимер және гетеродимер - ақуызды реттегіштердің екі түрі.
- Екеуінде екі мономер бар.
- Олар төрттік белок құрылымдары.
- Димерлер катализ және реттеуде кең таралған.
Гомодимер мен гетеродимердің айырмашылығы неде?
Гомодимер - екі бірдей ақуыз мономерінен тұратын ақуыз димері, ал гетеродимер - екі түрлі ақуыз мономерінен тұратын ақуыз димері. Сонымен, бұл гомодимер мен гетеродимер арасындағы негізгі айырмашылық. Сонымен қатар, гомодимерлерде H байланысының 18 орташа саны, ал гетеродимерлерде H байланысының 12 орташа саны бар.
Сонымен қатар, гомодимер мен гетеродимердің тағы бір айырмашылығы, Н-байланыстары мен интерфейс қалдықтары арасындағы корреляция коэффициенті гомодимерлерде 0,85, ал гетеродимерлерде 0,83 болады.
Гомодимер мен гетеродимер арасындағы айырмашылықтың төмендегі инфографикасында екі димер арасындағы көбірек салыстырулар көрсетілген.
Қорытынды – Гомодимер және Гетеродимер
Протеин димерлері катализ бен реттеуде кең таралған. Олар гомодимерлер де, гетеродимерлер де болуы мүмкін. Гомодимерлер екі бірдей ақуыз мономерінен тұрады. Керісінше, гетеродимерлер екі бірдей емес ақуыз мономерінен тұрады. Осылайша, бұл гомодимер мен гетеродимер арасындағы негізгі айырмашылық.
