Мотив пен домен арасындағы негізгі айырмашылық мынада: мотив тәуелсіз тұрақты, ал домен тәуелсіз тұрақты.
Белоктар – біздің денеміздегі маңызды биологиялық макромолекулалар. Екінші жағынан, геннің генетикалық коды ақуыздың аминқышқылдарының тізбегін шешеді. Сонымен қатар, белоктардың бастапқы, екінші және үшінші құрылымдары болады. Бастапқы құрылым - полипептидтік тізбектің аминқышқылдарының тізбегі. Полипептидтік тізбектер бір-бірімен қатпарланса, ол белоктың екінші реттік құрылымын құрайды. Альфа спиральдары, бета парақтары және супер-екінші құрылымдар қайталама құрылымдарға жатады. Супер-екінші элементтердің белгілі бір топтары ақуыз мотивтері ретінде белгілі. Ақуыздың үшінші реттік құрылымы ақуыздың қызметін анықтайтын оның үш өлшемді құрылымын білдіреді. Домен – глобулярлы және дискретті қызмет атқаратын белок молекуласының бүктелген бөлімі. Бұл ақуыздың негізгі функционалдық және үш өлшемді құрылымы.
Мотив дегеніміз не?
Мотив - альфа спиральдары және бета құрылымдары сияқты белоктардың супер қосалқы элементтерінің белгілі бір тобы. Олар әртүрлі ақуыздарда болатын үлгілердің бір түрі. Мотивтер қосалқы құрылымдық элементтердің қатпарлану үлгілерін және олардың өзара әрекеттесуін сипаттайды. Бұл қатпарлы үлгілер үшінші дәрежелі құрылымдарда болатын ұқсас байланыстар арқылы тұрақтанады. Дегенмен, олар үшінші деңгейлі құрылымдар сияқты күрделі емес.
01-сурет: Мотив
Бұл белоктардың қайталама құрылымдарының қарапайым қосындылары. Мотив өздігінен тұрақты емес. Сонымен қатар, мотивтер ақуыздың құрылымын түсіндіреді, бірақ ақуыздың қызметін болжамайды. Ақуыз мотивтерінің мысалдары - бета-альфа-бета мотиві, грек кілт мотиві, бета бөшке, бета-меандр мотиві, т.б.
Домен дегеніміз не?
Домен – ақуыздың негізгі, функционалды және үш өлшемді бірлігі. Ол белгілі бір функцияны орындайды. Бір протеиннің бірнеше түрлі домендері болуы мүмкін. Әрбір домен тәуелсіз бірлік болып табылады. Бұл шар тәрізді құрылым. Ол белгілі бір функция немесе өзара әрекеттесу үшін жауап береді. Домендерді сипатталмаған ақуыздың функциясы туралы гипотеза жасау үшін пайдалануға болады. Ақуызды талдау кезінде оны ескеру қажет, өйткені домендер ақуыздың функционалдық бірліктері болып табылады.
02-сурет: Пируваткиназаның үш түрлі домені
Домендер өте тұрақты және ықшам құрылымдар. Оларды басқа аймақтардан оңай ажыратуға болады. Пируваткиназаның 02-суретте көрсетілгендей үш ерекшеленетін домені бар. Доменнің ұзындығы әртүрлі болуы мүмкін, ал орташа ұзындығы 100 амин қышқылын құрайды. Әрбір доменде қосалқы құрылымдық бірліктерден жасалған гидрофобты ядро бар. Бірнеше домен бірге ақуыздың үшінші реттік құрылымын құрайды.
Мотив пен доменнің қандай ұқсастықтары бар?
- Мотив пен домен белок молекулаларының өзінде бар бірлік.
- Олар ақуыз тұқымдастарын жіктеу кезінде пайдалы.
Мотив пен доменнің айырмашылығы неде?
Мотив - альфа спиральдары және бета құрылымдары сияқты белоктардың супер қосалқы элементтерінің белгілі бір тобы, ал домен белоктың функционалды бірлігі болып табылады. Сонымен қатар, мотив қайталама құрылым болып табылады, ал домен ақуыздың үшінші құрылымына жауап береді. Сонымен қатар, домен мотивке қарағанда тәуелсіз бірлік болып табылады. Сондай-ақ, домен белоктың функциясын бейнелейді, ал мотив жоқ. Бұл мотив пен домен арасындағы негізгі айырмашылықтар. Төмендегі инфографика кесте түрінде мотив пен домен арасындағы айырмашылықты көрсетеді.
Қорытынды – Мотив пен Домен
Мотив – белок молекуласының қайталама құрылымдарының орналасуы. Ол доменге қарағанда әдетте өздігінен тұрақты емес. Домен белоктың тәуелсіз тұрақты құрылымы болып табылады. Сондықтан ол ақуыз молекуласының бір бөлігі немесе тұтас болуы мүмкін. Бұл ақуыздың үш өлшемді негізгі функционалды бірлігі. Оның үстіне, оның функциясы бар және ол тәуелсіз бірлік болып табылады. Мотив доменнің бөлігі болуы мүмкін. Бірақ домен мотивтің бөлігі бола алмайды. Бұл мотив пен домен арасындағы айырмашылық.
