Ақуыз суббірлігі мен домен арасындағы негізгі айырмашылық мынада: ақуыз суббірлігі белоктың жеке полипептидтік тізбегі болып табылады, ол ақуыз кешенін құру үшін басқа полипептидтік тізбектермен біріктіріледі, ал ақуыз домені полипептидтік тізбектің іргелес аймағы болып табылады. ықшам, жергілікті және жартылай тәуелсіз бірлікке тәуелсіз жиі жиналатын ақуыздың.
Ақуыз суббірлігі мен домені мультимерлі ақуыздың өте маңызды бөліктері болып табылады. Белоктар – полипептидтерден түзілген полимерлер. Әрбір полипептидтік тізбек амин қышқылы деп аталатын мономерден түзіледі. Күрделі ақуыздың құрамында суббірліктер, домендер, мотивтер және қатпарлар сияқты ерекше құрылымдық бірліктер болады. Күрделі ақуыздың бұл құрылымдық бірліктері оның құрылымы үшін және сайып келгенде қызметі үшін өте маңызды.
Ақуыз суббірлігі дегеніміз не?
Ақуыз суббірлігі – белок кешенін құру үшін басқа полипептидтік тізбектермен қосылатын белоктың жеке полипептидтік тізбегі. Құрылымдық биологияда белок суббірлігі - ақуыз кешенін түзу үшін басқа ақуыз молекулаларымен бірге жиналатын бір белок молекуласы. Табиғи ақуыздарда гемоглобин және ДНҚ полимераза сияқты суббірліктер салыстырмалы түрде аз. Сондықтан оларды олигомерлі деп атайды. Басқа белоктар көптеген суббірліктерден тұрады, сондықтан олар мультимерлі деп сипатталады. Мысалы, микротүтікшелер және басқа цитоскелеттік ақуыздар мультимерлі болып табылады. Мультимерлі ақуыздың суббірліктері бірдей (гомологиялық) немесе мүлдем ұқсамайтын (гетерологиялық) болуы мүмкін.
01-сурет: ақуыз суббірлігі
Кейбір мультимерлі белоктарда бір суббірлік каталитикалық суббірлік болуы мүмкін. Екінші жағынан, екіншісі - реттеуші бөлімше. Каталитикалық суббірліктің функциясы ферментативті реакцияны катализдейді, ал реттеуші бөлімшенің қызметі оның белсенділігін жеңілдетеді немесе тежейді. Жиналған кезде каталитикалық және реттеуші бөлімшелерден тұратын фермент әдетте голофермент деп аталады. Мысалы, I класс фосфоинозитид 3-киназа ферментінде p110 каталитикалық суббірлігі және p85 реттеуші суббірлігі бар. Сонымен қатар, ақуыздың әрбір суббірлік үшін бір гені болуы керек. Себебі суббірлік бір кодтау гені бар жеке полипептидтік тізбектен тұрады.
Белоктық домен дегеніміз не?
Протеин домені – ақуыздың полипептидтік тізбегінің іргелес аймағы, ол ықшам, жергілікті және жартылай тәуелсіз бірліктерге жиі тәуелсіз қатпарланады. Белоктың домені өзін-өзі тұрақтандыратын және қалғандарынан тәуелсіз қатпарланатын белоктың полипептидтік тізбегінің аймағы ретінде де белгілі. Олар ақуыздың құрылымдық және функционалдық бірлігі болып табылады. Әдетте, домендер белгілі бір функцияға немесе ақуыздың жалпы рөліне ықпал ететін өзара әрекеттесуге жауап береді. Мысалы, SH3 домені шамамен 50 аминқышқылдарының қалдықтары болып табылады. Олар белоктардың әртүрлі диапазонында кездеседі, соның ішінде адаптер белоктары, фофатидилозитол3-киназалар, фосфолипазалар және миозиндер. Бұл SH3 домендері ақуыз-белок өзара әрекеттесуіне қатысады.
02-сурет: ақуыз домендері
Домендердің ұзындығы 50 аминқышқылынан 250 аминқышқылына дейін өзгереді. Ең қысқа домендер, мысалы, мырыш саусақтары, металл иондары мен дисульфидті көпірлер арқылы тұрақтандырылады. Домен көбінесе кальмодулиннің кальцийді байланыстыратын EF-қол домені сияқты функционалдық бірліктерді шығарады. Сонымен қатар, домендерді гендік инженерия арқылы бір ақуыздан екіншісіне ауыстыруға болады, ол химерикалық ақуыздарды жасайды.
Ақуыз суббірлігі мен доменнің қандай ұқсастықтары бар?
- Ақуыз суббірлігі мен домені мультимерлі ақуыздың құрылымдық бірлігі болып табылады.
- Екеуі де аминқышқылдарынан тұрады.
- Олар «полипептидтік тізбек» терминімен байланысты.
- Сонымен қатар, олардың екеуі де ақуыздың жалпы қызметі үшін өте маңызды.
Белок суббірлігі мен доменнің айырмашылығы неде?
Ақуыз суббірлігі – белок кешенін құру үшін басқа полипептидтік тізбектермен қосылатын белоктың жеке полипептидтік тізбегі. Екінші жағынан, ақуыз домені - бұл ақуыздың полипептидтік тізбегінің іргелес аймағы, ол ықшам, жергілікті және жартылай тәуелсіз бірліктерге жиі тәуелсіз қатпарланады. Сонымен, бұл ақуыз суббірлігі мен домен арасындағы негізгі айырмашылық. Сонымен қатар, ақуыз суббірлігі ақуыз доменінен үлкенірек.
Келесі кестеде кесте түріндегі белок суббірлігі мен домен арасындағы айырмашылық жинақталған.
Қорытынды – Протеин суббірлігі және домен
Белоктардың құрылыс материалы аминқышқылдары болып табылады. Белоктар аминқышқылдарының конденсациялануынан түзіледі. Белок құрылымдарының мөлшері ондаған бірнеше мың аминқышқылдарына дейін болады. Ақуыз құрылымы сутектік байланыстар, иондық байланыстар, Ван-дер-Ваальс күштері, гидрофобтық байланыстар және дисульфидтік байланыстар сияқты коваленттік өзара әрекеттесулер сияқты ковалентті емес әрекеттесулер арқылы тұрақтанады. Күрделі ақуыздың құрамында суббірліктер, домендер, мотивтер және қатпарлар сияқты ерекше құрылымдық бірліктер болады. Ақуыз суббірлігі – белоктың жеке полипептидтік тізбегі, ол басқа полипептидтік тізбектермен қосылып, ақуыз кешенін құрайды. Екінші жағынан, ақуыз домені белоктың полипептидтік тізбегінің аймағы болып табылады, ол өзін-өзі тұрақтандырады және қалғандарынан тәуелсіз қатпарланады. Осылайша, бұл ақуыз суббірлігі мен домен арасындағы айырмашылықтың қысқаша мазмұны.
