Генетикалық карта мен физикалық картаның негізгі айырмашылығы геномды карталауда қолданылатын әдістерде. Генетикалық картаны жасау кезінде гендердің байланыс үлгілерін зерттеу үшін генетикалық маркерлер мен генетикалық локустар пайдаланылады, ал физикалық картада шектеу фрагментінің ұзындығы полиморфизмі (RFLP) және гибридизация әдістері сияқты молекулалық биология әдістері қолданылады.
Генетикалық карталар және физикалық карталар хромосомаларда орналасқан гендерді көрсету үшін жасалған карталардың екі түрі. Олар генетикалық диагностикаға және геномды талдауға қатысты эволюцияны болжауға қатысады. Сонымен қатар, олар гендік локустар арасындағы қашықтықты талдау және гендік полиморфизмдерді талдау үшін пайдаланады.
Генетикалық карта дегеніміз не?
Генетикалық карта байланыс талдауы және гендердің ассоциациясын зерттеу арқылы анықталған гендердің орналасуы мен генетикалық маркерлеріне негізделген. Мендельдік генетика генетикалық карталарды түсіндіреді және бұл тұжырымдаманы енгізген адам Грегор Мендель болды. Генетикалық карта хромосомалардың орналасуын және белгілі бір белгілердің пайда болуына қатысатын гендерді зерттеуде пайдалы. Ұрпақтарға мұраланған бұл гендер белгілі бір ауру немесе сипаттың генетикалық маркерлері ретінде анықталады.
01-сурет: Генетикалық карта
Генетикалық картаны жасамас бұрын көптеген ұрпақтар бойына бірнеше өсіру әдістері, содан кейін белгілі бір белгі немесе сипаттама үшін өсіру үлгілерін талдау қажет. Сондай-ақ, гендік ассоциация зерттеулері генетикалық карталаудағы нақты тұқым қуалаушылық үлгілеріне жауап беретін әртүрлі аллельдерді анықтауды одан әрі қолдайды. Аллель жиілігі мен ген жиілігі хромосомадағы белгілі бір геннің гендік картасын болжауға көмектеседі.
Физикалық карта дегеніміз не?
Гендердің физикалық карталары рестрикциялық ферментті қорыту және т.б. сияқты молекулалық биологиялық әдістерді пайдалана отырып құрастырылады. Демек, шектеу картасы бұл картаның басқа атауы. Физикалық картаны құру кезінде бастапқыда рестриктазалар ДНҚ-ны фрагменттерге бөледі. Содан кейін бұл фрагменттер гельдік электрофорез арқылы бөлінеді. Келесі қадам - ДНҚ физикалық картасын жасау. Келесі қадам ретінде, будандастырудан кейін оларды тазарту әдістеріне ұшыратуға болады. Қазіргі уақытта генетикалық маркерлер ретінде пайдалану үшін физикалық карталарды жасауда флуоресценция In situ гибридизациясы сияқты жоғары өнімділік әдістері қолданылуда.
02-сурет: Физикалық карта
Физикалық карталар генетикалық карталармен салыстырғанда дәлірек және жылдамырақ. Демек, оларды гендік полиморфизмді талдауда пайдалану генетикалық карталармен салыстырғанда жоғары. Физикалық карта мендельдік генетикалық үлгілерді де қарастырмайды.
Генетикалық карта мен физикалық картаның қандай ұқсастықтары бар?
- Екі карта да генетикалық маркерлерді сипаттайды.
- Геномдық зерттеулер екі картаны да пайдаланады.
- Генетикалық карта және физикалық карта генетикалық диагностикада пайдалы.
Генетикалық карта мен физикалық картаның айырмашылығы неде?
Генетикалық карта – генетикалық маркерде немесе хромосоманың гендік локусында жүргізілген гендер байланысы мен гендердің ассоциациясын зерттеуге негізделген гендік карта. Физикалық карта - бұл гендік карта ДНҚ-ны оқшаулау және молекулалық биология әдістерін қолдана отырып, нақты генетикалық маркерді алу арқылы физикалық түрде алынған гендік карта. Осы екі картада қолданылатын әдістерге келетін болсақ, генетикалық карта мен физикалық картаның айырмашылығы генетикалық картада гендік байланыс пен гендік ассоциацияны талдау әдістері қолданылады, ал физикалық картада шектеуді карталау және будандастыру әдістері қолданылады. Сондықтан генетикалық картадағы дәлдік төмен, ал физикалық картада жоғары.
Осы екі картада қолданылатын әдістердің жылдамдығын салыстырған кезде, генетикалық картада жылдам, уақытты қажет ететін әдістер аз болады. Дегенмен, физикалық картаның өте жылдам әдістері бар. Демек, генетикалық картаның тиімділігі төмен, ал физикалық картаның тиімділігі жоғары. Сонымен қатар, генетикалық карталар мендельдік тұқым қуалау үлгілеріне негізделген, ал физикалық карталар тікелей мендельдік тұқым қуалау үлгілеріне жатпайды.
Қорытынды – Генетикалық карта және физикалық карта
Геномдық зерттеулер хромосомаларда орналасқан генетикалық маркерлерді пайдаланады. Бұл маркерлерді зерттеу үшін оларды әртүрлі әдістерді қолдану арқылы картаға түсіру керек. Мендельдік генетика – генетикалық карталардың негізі. Генетикалық карта жасау кезінде көптеген ұрпақтар үшін әртүрлі белгілер зерттеледі және гендер гендік байланыс пен гендердің ассоциациясын зерттеу арқылы талданады. Керісінше, Физикалық гендік карталар генетикалық маркерлерді бөліп алу және оны алу арқылы физикалық түрде сипаттауды қамтиды. Бұл генетикалық карта мен физикалық картаның негізгі айырмашылығы.
