Негізгі айырмашылық – VNTR және STR
ДНҚ зерттеулерінің филогенетикалық қарым-қатынастарды түсіну және анықтау, генетикалық ауруларды диагностикалау және организмнің геномдарын картаға түсіруде үлкен пайдасы бар. Белгілі бір генді немесе белгісіз ДНҚ пулындағы ДНҚ тізбегін анықтау үшін ДНҚ талдауымен байланысты бірнеше әдістер қолданылады. Олар генетикалық маркерлер ретінде белгілі. Генетикалық маркерлер молекулярлық биологияда даралар мен түрлер арасындағы генетикалық вариацияны анықтау үшін қолданылады. Айнымалы сандық тандемді қайталау (VNTR) және қысқа тандемді қайталау (STR) - жеке адамдар арасында полиморфизмді көрсететін генетикалық маркерлердің екі түрі. Екі түрі де кодталмаған қайталанатын ДНҚ болып табылады, олар тандемдік қайталанады. Олар хромосомаларда басынан құйрығына қарай орналасады. VNTR - қысқа нуклеотидтер тізбегі бірнеше рет қайталанатын геномның бөлімі. STR - екіден он үшке дейінгі нуклеотидтерден тұратын жүз рет қайталанатын бірліктер ретінде ұйымдастырылған геномдағы ДНҚ-ның басқа бөлімі. VNTR мен STR арасындағы негізгі айырмашылық - қайталанатын тізбектегі нуклеотидтердің саны. VNTR қайталанатын бірліктері 10-нан 100-ге дейін нуклеотидтерден тұрады, ал STR қайталанатын бірлігі 2-ден 13-ке дейін нуклеотидтерден тұрады. VNTR және STR криминалистикалық зерттеулерде кеңінен қолданылады.
VNTR дегеніміз не?
Тандемді қайталау – белгілі бір хромосомалық локуста басынан құйрығына қарай қайталанатын ДНҚ-ның қысқа тізбегі. Тандем қайталауында басқа реттілік немесе нуклеотид жоқ. Геномда тандемді қайталаудың бірнеше түрі бар. VNTR - олардың арасында 10-нан 100-ге дейін нуклеотидтерден тұратын қайталанатын бірліктері бар тандемді қайталау түрі. VNTR - шағын жерсеріктің бір түрі. Бұл тандемді қайталаулар көптеген хромосомаларда кездеседі. Олар адам геномының ішінде қиылысады және негізінен хромосомалардың субтеломерлік аймақтарында орналасқан.
VNTR жеке адамдар арасында тандемді қайталанатын полиморфизмді көрсетеді. Хромосоманың белгілі бір жеріндегі VNTR ұзындығы осы ДНҚ бөлімінде ұйымдастырылған қайталанатын бірліктердің санының өзгеруіне байланысты жеке адамдар арасында өте өзгермелі. Сондықтан VNTR жеке тұлғаларды анықтауда қуатты құрал ретінде пайдаланылуы мүмкін және VNTR талдауы генетика, биология зерттеулері, криминалистика және ДНҚ саусақ басып шығару сияқты көптеген салаларда қолданылады. VNTR сүйек кемігін трансплантациялауды сандық бағалау үшін қолданылған алғашқы генетикалық маркерлер болды. VNTRs сонымен қатар сот сараптамасында ДНҚ профилін жасауда қолданылған алғашқы полиморфты маркерлер болды.
01-сурет: алты адамдағы VNTR өзгеруі
VNTR талдауы оңтүстік будандастырудан кейін шектеу фрагментінің ұзындығы полиморфизмі арқылы орындалады. Демек, оған салыстырмалы түрде үлкен ДНҚ үлгісі қажет. VNTR профилін түсіндіру де проблемалы. Осы шектеулерге байланысты сот-генетикада VNTR қолдану шектелді және ол STR талдауымен ауыстырылды.
STR дегеніміз не?
STR – тандемдік тәртіпте ұйымдастырылған екі-он үш нуклеотидті қайталанатын бірліктерден тұратын өте қайталанатын ДНҚ бөлімі. STR VNTR-ге ұқсас. Бірақ ол VNTR-ден қайталанатын тізбектегі нуклеотидтер саны мен қайталанулар санына қарай өзгереді. STR - микрожерсерік түрі.
STR талдауы қайталанатын бірліктердің нақты санын өлшеуге қатысты. STR жеке адамдар арасында VNT-ге ұқсас өте өзгермелі. STR профильдері әр адамда әр түрлі болады. Сондықтан STR талдауы молекулалық биологияда екі немесе одан да көп үлгілердің ДНҚ-дағы нақты локустарды салыстыру үшін қолданылады. Сондықтан STR молекулалық биологиядағы күшті генетикалық маркерлер ретінде қарастырылады. Ол жоғары полиморфизм дәрежесіне және салыстырмалы түрде қысқа ұзындыққа байланысты тұлғаларды сәйкестендірудің тамаша құралын ұсынады.
Қазіргі уақытта STRs соттық генетикада ең жиі қолданылатын талданатын генетикалық полиморфизм құралы болып табылады. Сот-медициналық істердің көпшілігі STR полиморфтық талдауды қамтиды. STR локустары бүкіл геномға таралған. Хромосомаларда мыңдаған STR бар, оларды сот сараптамасында қолдануға болады. STR талдауы VNTR талдауы сияқты шектеу ұзақтығы полиморфизмін қамтымайды. STR талдауы шектеу ферменттері бар ДНҚ-ны кеспейді. Арнайы зондтар ДНҚ-ға қажетті аймақтарды бекіту үшін пайдаланылады және ПТР әдісін қолдана отырып, STR ұзындығы анықталады.
02-сурет: үлгілер арасындағы STR ауытқуы
VNTR және STR арасындағы қандай ұқсастықтар бар?
- VNTR және STR кодталмаған ДНҚ.
- Екеуі де тандемді қайталау.
- Екеуі де ДНҚ бөлімі ұзындығының айырмашылығына байланысты жеке адамдар арасында полиморфизмді көрсетеді.
- Екеуі де ДНҚ саусақ басып шығаруда және сот-медициналық зерттеулерде күшті генетикалық маркерлер ретінде пайдаланылады.
VNTR мен STR арасындағы айырмашылық неде?
VNTR және STR |
|
| VNTR - тандемді түрде қайталанатын қысқа нуклеотидтер тізбегі бар кодталмаған қайталанатын ДНҚ. | STR – тандемдік тәртіпте ұйымдастырылған екі-он үш нуклеотидті қайталанатын бірліктерден тұратын өте қайталанатын ДНҚ бөлімі. |
| Өлшем | |
| VNTRs STR-ден үлкен. | STRs VNTR-ден кішірек. |
| Қайталанатын реттегі нуклеотидтер саны | |
| VNTR қайталанатын бірлігі 10-100 нуклеотидтен тұрады. | STR қайталанатын бірлігі 2-13 нуклеотидтен тұрады. |
Қорытынды – VNTR және STR
VNTR және STR - молекулалық биологияда, әсіресе сот-генетика саласында қолданылатын екі күшті генетикалық маркерлер. VNTR - шағын жерсеріктің бір түрі, ал STR - микросателлит. VNTR және STR кодталмаған, қайталанатын ДНҚ. Олар тандемді қайталаулар. VNTR және STR жалпы құрылымы бірдей. Бірақ қайталанатын тізбектегі нуклеотидтердің саны мен ұзындығы әртүрлі. VNTR 10-нан 100-ге дейінгі нуклеотидтерден тұратын қайталанатын тізбектерге ие. STR 2-ден 13-ке дейінгі нуклеотидтерден тұратын қайталанатын тізбектерге ие. Бұл VNTR мен STR арасындағы айырмашылық.
VNTR және STR арасындағы PDF нұсқасын жүктеп алу
Осы мақаланың PDF нұсқасын жүктеп алып, дәйексөздерге сәйкес офлайн мақсаттарда пайдалануға болады. PDF нұсқасын мына жерден жүктеп алыңыз VNTR және STR арасындағы айырмашылық.
