Байланыстырғыш пен адаптердің негізгі айырмашылығы мынада: байланыстырғыштың біріктірілген ұштары болмайды, ал адаптердің бір ұштары болады.
ДНҚ-ны байлау - бұл фосфодиэфирлік байланыстарды құра отырып, екі ДНҚ молекуласын біріктіру процесі. ДНҚ лигаза деп аталатын фермент бұл реакцияны катализдейді. Бұл рекомбинантты ДНҚ технологиясы және ДНҚ клондау сияқты заманауи молекулалық биологиялық салалардағы маңызды қадамдардың бірі. Байланыстырудың тиімділігі байланыстырылатын ДНҚ молекулаларының ұштарына байланысты. ДНҚ ұштарының жабысқақ ұштары және доғал ұштары сияқты екі түрі бар. Жабысқақ ұштармен байланыстыру тиімділігі доғал ұштарға қарағанда жоғары. Мақсатты ДНҚ молекулаларының ұштары доғал болса, адаптерлер немесе сілтемелер деп аталатын молекулалар пайдалы болады. Адаптерлер мен байланыстырғыштар - бұл ДНҚ байланыстыруға көмектесетін химиялық синтезделген олигонуклеотидтік молекулалар. Олардың ішкі шектеу сайттары да бар. Адаптердің бір жабысқақ және бір ұшы бар, ал байланыстырғыштың екі ұшы бар.
Сілтеме дегеніміз не?
Linker – қос тізбекті химиялық синтезделген олигонуклеотидтер тізбегі. Линкердің екі ұшы бар. Линкер векторларға доғал ұштары бар ДНҚ молекулаларын байлау үшін қолданылады. Онда бір немесе бірнеше ішкі шектеу сайттары бар. Бұл шектеу тораптары шектеу ферменттерін тану орындары ретінде жұмыс істейді.
01-сурет: байланыстырушы
Байланыстырғаннан кейін біріктірілген ұштарды шығару үшін ДНҚ қайтадан рестриктеу ферменттерімен шектеледі. EcoRI-сілтемелері және sal-I байланыстырғыштары жиі қолданылатын сілтемелер.
Адаптор дегеніміз не?
Адаптер – екі ДНҚ молекуласын байланыстыру үшін қолданылатын қос тізбекті олигонуклеотидтер тізбегі. Бұл бір доғал ұшы және бір жабысқақ немесе біртұтас ұшы бар қысқа реттілік. Сондықтан ол ДНҚ байлау тиімділігін арттыратын бір шетінде бір жіпті құйрықтан тұрады.
02-сурет: Адаптор арқылы ДНҚ-ны байланыстыру
Сонымен қатар адаптерде ішкі шектеу тораптары бар. Сондықтан, байлаудан кейін жаңа шығыңқы ұшты жасау үшін ДНҚ-ны тиісті шектеу ферменттерімен шектеуге болады. Адаптерлердің бір кемшілігі - екі адаптер негізді жұптастыру арқылы диммерлерді құра алады. Бұны оларды сілтілі фосфатаза деп аталатын ферментпен емдеу арқылы болдырмауға болады.
Байланыстырғыш пен адаптордың қандай ұқсастықтары бар?
- Байланыстырғыш және адаптер екеуі екі тізбекті қысқа олигонуклеотидтер тізбегі.
- Оларда ішкі шектеу сайттары бар.
- Сонымен қатар олар химиялық жолмен синтезделген ДНҚ молекулалары және синтетикалық молекулалар.
- Олар екі ДНҚ молекуласын байланыстыра алады.
- Сілтемелер мен адапторларды байлағаннан кейін жабысқақ ұштарды жасау үшін ДНҚ қайтадан рестриктазалармен шектеледі.
Байланыстырғыш пен адаптордың айырмашылығы неде?
Байланыстырғыш – химиялық синтезделген қысқа олигонуклеотидті екі ұштары бар дуплекс. Адаптер - бұл бір жабысқақ ұшы және бір доғал ұшы бар химиялық синтезделген қысқа олигонуклеотидтік дуплекс. Осылайша, бұл байланыстырғыш пен адаптордың негізгі айырмашылығы. Сонымен қатар, адаптерлер димерлерді құра алады, ал байланыстырғыштар димерлерді түзбейді. Сонымен, бұл байланыстырғыш пен адаптор арасындағы тағы бір маңызды айырмашылық.
Төменде кестелік түрдегі сілтемелер мен адаптер арасындағы айырмашылықтардың қысқаша мазмұны берілген.
Қорытынды – байланыстырғыш пен адаптор
Линкер және адаптер - бұл ұшты ДНҚ-ны байланыстыруға пайдалы химиялық синтезделген олигонуклеотидтердің екі түрі. Линкердің екі доғал ұшы бар, ал адаптердің бір доғал ұшы және бір ұштары бар. Сонымен, бұл байланыстырғыш пен адаптердің негізгі айырмашылығы. Олар ішкі шектеу орындары бар қос тізбекті молекулалар. Олар рекомбинантты ДНҚ технологиясында және ДНҚ клондауында кеңінен қолданылады.
