siRNA vs miRNA
РНҚ-лар организмдердің өмірін құруға көмектесетін өте маңызды молекулалар. Жақында ғалымдар ген экспрессиясын басқару үшін транскрипциядан кейін әрекет ететін РНҚ интерференциясы немесе RNAi деп аталатын шағын РНҚ-ларды тапты. Кішкентай РНҚ-ның екі негізгі түрі - микро РНҚ немесе миРНҚ және кіші интерференциялық РНҚ немесе сиРНҚ. Бұл молекулалар негізінен мақсатты генді басу арқылы ген экспрессиясын реттейді. miRNA да, siRNA да өте ұқсас биогенез жолдары бар, бірақ олардың арасында кейбір айырмашылықтар бар. miRNA және siRNA шығу тегі dsRNA молекулаларынан. Жетілген миРНҚ құрылымдық жағынан siRNA молекулаларына ұқсас.
miRNA
Микро РНҚ немесе миРНҚ – трансляциялық гендік реттеудегі соңғы тексеруге делдалдық жасайтын шағын РНҚ молекулалары. МиРНҚ-ның реттелуі қатерлі ісікке және басқа аурулардың дамуына әкелуі мүмкін. Сондықтан миРНҚ-ның кодталмаған аймағында кодталған ақпараттың дұрыс реттелуі көптеген іргелі жасушалық процестерде өте маңызды.
siRNA
siRNA-лар сонымен қатар қысқа кедергі жасайтын немесе үнсіздендіруші РНҚ деп аталады және 20-25 негіз жұбы бар қос тізбекті РНҚ-дан тұрады. siRNA-ның негізгі рөлі комплементарлы нуклеотидтер тізбегі бар арнайы гендердің экспрессиясына кедергі жасау болып табылады. siRNA ұштары фосфорланған 5' және гидроксилденген 3' ұштары асып түсетін екі нуклеотидтері бар қысқа қос тізбекті РНҚ-дан тұрады.
сиРНҚ мен миРНҚ-ның айырмашылығы неде?
• миРНҚ арнайы геномдық локустардан, ал siRNA мРНҚ-дан, транспозондардан, вирустардан немесе гетерохроматикалық ДНҚ-дан алынған.
• miRNA синтезі ұзағырақ прекурсор шаш қыстырғыш транскрипттерінен (RNase III эндонуклеаза арқылы негізгі ядролық миРНҚ тізбегі) өңделеді, ал siRNA синтезі ұзын бимолекулалық РНҚ дуплекстерінен өңделеді.
• Әрбір миРНҚ прекурсоры молекуласы бір miRNA дуплексін жасайды, ал әрбір siRNA прекурсоры бірнеше siRNA дуплекстерін жасайды.
• siRNA тізбегі сирек сақталады, ал miRNA тізбектері жақсы сақталады.
• siRNA-дағы барлық негіздер оның мақсатты ерекшелігіне ықпал етеді, ал miRNA-ның тек 5’ жартысы оның мақсатты ерекшелігіне ықпал етеді.
• miRNA көбінесе мақсатты транскрипттердің 3' аударылмаған аймағымен байланысады, ал siRNA мақсатты мРНҚ бойында кез келген жерде комплементарлы дуплексті құрайды.
• miRNA «гетеро-үнсіздендіруді» көрсетеді, ал siRNA «автоматты дыбыссыздандыру» үшін пайдаланылады.
• miRNA аударманы болдырмау үшін сигнал ретінде әрекет етеді, ал siRNA физикалық түрде аударманы болдырмайды.