Гуанидин тиоцианаты мен гуанидин гидрохлориді арасындағы негізгі айырмашылық гуанидин тиоцианатының РНҚ оқшаулауында жиі қолданылатын күшті белок денатуранты болып табылады, ал гуанидин гидрохлориді - РНҚ-да азырақ қолданылатын әлсіз белок денатурант..
Денатурация – белоктар өздерінің төрттік құрылымын, үшінші реттік құрылымын және әдетте өз күйінде болатын екіншілік құрылымын жоғалту процесі. Бұл күшті қышқыл немесе негіз, концентрлі бейорганикалық тұз, органикалық еріткіш (спирт, хлороформ), қозу, сәулелену немесе жылу сияқты кейбір сыртқы кернеулерді немесе қосылыстарды қолдану арқылы жасалуы мүмкін. Гуанидин тиоцианаты және гуанидин гидрохлориді - ақуызды денатуранттардың екі түрлі түрі.
Гуанидинтиоцианат дегеніміз не?
Гуанидин тиоцианаты (GTC) РНҚ оқшаулауында жиі қолданылатын күшті белокты денатурациялаушы агент болып табылады. Ол сондай-ақ гуанидиний изоцианаты (GITC) ретінде белгілі. Хаотропты агент бола отырып, бұл жалпы ақуызды денатурант ретінде жиі қолданылатын химиялық қосылыс. Хаотропты агент - су молекулалары арасындағы сутегі байланысының желісін бұзуы мүмкін су ерітіндісіндегі молекула. Бұл гидрофобты әсерді әлсірету арқылы белоктар және нуклеин қышқылдары сияқты макромолекулалар сияқты ерітіндідегі басқа молекулалардың табиғи күйінің тұрақтылығына әсер етеді. Гуанидин тиоцианаты сияқты хаотропты заттар гидрофобты амин қышқылдарының айналасында су молекулалары мен гидратация қабықшаларында түзілетін ақуыз құрылымындағы реттілік мөлшерін азайтады. Бұл ақуыздың денатурациясын тудыруы мүмкін.
Гуанидин тиоцианатын 1918 жылы испан тұмауы сияқты ауруларды тудыратын тұмау сияқты вирустарды залалсыздандыру үшін пайдалануға болады. Сондықтан оны медициналық немесе ауруханалық қондырғыларда қолдануға болады. Сонымен қатар, гуанидин тиоцианаты РНҚ және ДНҚ экстракцияларында жасушалар мен вирус бөлшектерін лизис үшін де қолданылады. Мұнда гуанидин тиоцианатының қызметі лизистік әрекетке көмектесу және денатурация арқылы RNase ферменттері мен DNase ферменттерінің белсенділігін болдырмау болып табылады. Бұл ферменттер сығындыға (РНҚ немесе ДНҚ) зақым келтіруі мүмкін.
Гуанидин гидрохлориді дегеніміз не?
Гуанидин гидрохлориді (GdnHCl) - РНҚ оқшаулауында жиі қолданылатын әлсіз белок денатурант. Ол гуанидиний хлориді (GdmCl) ретінде де белгілі. Бұл гуанидиннің гидрохлоридті тұзы. Гуанидин гидрохлориді хаотропты және белоктардың қатпарлануын физика-химиялық зерттеулерде қолданылатын денатуранттардың бірі.
01-сурет: гуанидин гидрохлориді
Гуанидин гидрохлоридінің сонымен қатар фермент белсенділігін төмендету және гидрофобты молекулалардың ерігіштігін арттыру мүмкіндігі бар. Әдетте, гуанидин гидрохлоридінің жоғары концентрациясында белоктар реттелген құрылымын жоғалтады. Протеиндер гуанидин гидрохлоридінің осы концентрациясында кездейсоқ оралуға бейім. Медициналық немесе ауруханалық қондырғыларда гуанидин гидрохлориді бұлшықет әлсіздігі және Итон-Ламберт синдромы ауруымен байланысты жеңіл шаршау белгілерін азайту үшін көрсетілген. Сонымен қатар, гуанидин гидрохлоридін қолданудың жанама әсерлері перистальтиканы, диареяны және сүйек кемігінің өліммен аяқталуын қамтуы мүмкін.
Гуанидинтиоцианат пен гуанидин гидрохлоридінің қандай ұқсастықтары бар?
- Гуанидин тиоцианаты және гуанидин гидрохлориді - ақуызды денатуранттардың екі түрлі түрі.
- Екі денатуранттың да құрылымдарында гуанидин бар.
- Олар хаотропты заттар.
- Екі денатурантты да РНҚ оқшаулау үшін пайдалануға болады.
- Олардың екеуі де медициналық немесе ауруханалық қондырғыларда қолданылады.
Гуанидинтиоцианат пен гуанидин гидрохлоридінің айырмашылығы неде?
Гуанидин тиоцианаты РНҚ оқшаулауында жиі қолданылатын күшті белокты денатурант болып табылады, ал гуанидин гидрохлориді - РНҚ оқшаулауында жиі қолданылатын әлсіз белок денатурант. Осылайша, бұл гуанидин тиоцианаты мен гуанидин гидрохлориді арасындағы негізгі айырмашылық. Сонымен қатар, гуанидин тиоцианатының химиялық формуласы C2H6N4S, ал химиялық формуласы: гуанидин гидрохлоридінің CH5N3HCl.
Төмендегі инфографика гуанидин тиоцианаты мен гуанидин гидрохлориді арасындағы айырмашылықтарды қатар салыстыру үшін кесте түрінде ұсынады.
Қорытынды – Гуанидинтиоцианат пен гуанидин гидрохлориді
Гуанидин тиоцианаты және гуанидин гидрохлориді - ақуызды денатуранттардың екі түрлі түрі. Денатуранттардың екеуі де хаотроптар. Гуанидин тиоцианаты РНҚ оқшаулауында жиі қолданылатын ақуыздың күшті денатурант агенті болып табылады, ал гуанидин гидрохлориді РНҚ оқшаулауында сирек қолданылатын әлсіз белок денатурант болып табылады. Сонымен, бұл гуанидин тиоцианаты мен гуанидин гидрохлориді арасындағы айырмашылықты қорытындылайды.
