Кандидат гені мен GWAS арасындағы негізгі айырмашылық мынада: кандидат гендік әдіс қызығушылықтың алдын ала көрсетілген гендерінің аз санындағы генетикалық вариацияны зерттейді, ал GWAS белгілі бір ауру жағдайының артындағы жалпы генетикалық вариация үшін бүкіл геномды зерттейді.
Үміткер гендік көзқарас және геномдық қауымдастық зерттеулері (GWAS) ауруларға генетикалық бейімділікті анықтау үшін маңызды екі әдіс болып табылады. Кандидаттың гендік тәсілі алдын ала көрсетілген гендердің аз санына негізделген, ал GWAS бүкіл геномды сынауға негізделген. Демек, кандидат гендік көзқарас GWAS-тен айырмашылығы, ауруға қатысты гендер туралы алдын ала білімді талап етеді.
Үміткер Джин дегеніміз не?
Үміткер гендік тәсіл – қызығушылық тудыратын алдын ала көрсетілген гендердегі генетикалық вариация мен фенотиптер немесе ауру күйлері арасындағы байланысты зерттейтін әдістердің бірі. Бұл тәсілде геннің қарастырылып отырған белгіге немесе ауруға биологиялық функционалдық әсері туралы алдын ала білу қажет. Осы білімнің негізінде гендердің аздаған саны таңдалып, генетикалық вариация үшін талданады.
01-сурет: Кандидат генінің тәсілі
Гендерді таңдау осы тәсілде қарастырылып отырған ауруға биологиялық, физиологиялық және функционалдық сәйкестік негізінде жүргізіледі. Бұл әдіс көбінесе жағдайды бақылау зерттеуі ретінде жасалады.
GWAS дегеніміз не?
GWAS геномдық қауымдастықты зерттеу дегенді білдіреді. Бұл сонымен қатар тұтас геномдық ассоциацияны зерттеуге қатысты. Бұл зерттеулер негізінен бақылау зерттеулеріне бағытталған. Олар әдетте белгілі бір белгімен байланысты әртүрлі адамдардың генетикалық нұсқаларын талдайды. Бүкіл геном GWAS талдауы үшін маңызды.
GWAS әртүрлі ауру жағдайларымен байланысты бір нуклеотидтік полиморфизмдерді талдаудың маңызды құралы болып табылады. Бұл кең популяциядағы әртүрлі жалғыз нуклеотидтік полиморфизмдерді салыстырмалы зерттеу. GWAS зерттеу үлгісі өте жоғары; демек, ол сонымен қатар көлденең қималық когортты зерттеу форматын алады.
02-сурет: GWAS
Бірінші GWAS зерттеуі миокард инфарктісіне қатысты және миокард инфарктісіне байланысты гендерді талдауға қатысты. Қазіргі уақытта GWAS этиологиясы белгісіз күрделі аурулардың генетикалық фонын анықтауда маңызды рөл атқарады.
Үміткер ген мен GWAS арасындағы қандай ұқсастықтар бар?
- Үміткер гендік тәсіл де, GWAS да аурудың генотипі мен фенотипі арасындағы генетикалық байланысты талдайтын әдістер.
- Екі тәсіл де ауруға бейімділіктің генетикалық негізін түсінуге көмектеседі.
Үміткер ген мен GWAS арасындағы айырмашылық неде?
Үміткер гендік көзқарас кандидат гендерге немесе алдын ала көрсетілген гендерге негізделген, ал GWAS бүкіл геномға негізделген. Сонымен, бұл кандидат гені мен GWAS арасындағы негізгі айырмашылық. Сондай-ақ кандидаттық гендік тәсілде гендерді таңдау қажет, ал GWAS-та қажет емес.
Сонымен қатар кандидат гендік тәсіл ауруға қатысты гендер туралы алдын ала білімді қажет етеді, ал GWAS үшін бұл қажет емес.
Төмендегі инфографика кандидат гені мен GWAS арасындағы айырмашылыққа қатысты толығырақ салыстыруды ұсынады.
Қорытынды – Кандидат Ген және GWAS
Үміткер ген және GWAS екі ген ассоциациясын зерттеу болып табылады. Кандидаттың гендік тәсілі алдын ала көрсетілген гендердің аз санындағы аурумен байланысты генетикалық вариацияға бағытталған. Керісінше, GWAS бүкіл геномдағы аурумен байланысты генетикалық вариацияны зерттейді. Сонымен, бұл кандидат гені мен GWAS арасындағы негізгі айырмашылық. Ауруға бейімділіктің генетикалық негізін түсіну үшін екі әдіс те маңызды.
