QTL мен GWAS арасындағы негізгі айырмашылық талдауда пайдаланылатын реттілік түріне байланысты. QTL полигендік тұқым қуалаушылықпен байланысты фенотиптік белгілерді талдау үшін байланыс генінің локустарын пайдаланады, ал GWAS белгілі бір жағдайдың бір нуклеотидтік полиморфизмдерін талдау үшін тұтас геномдық тізбектерді пайдаланады.
QTL карталары мен GWAS әртүрлі белгілерге арналған генетикалық талдауларда маңызды рөл атқарады. Сонымен қатар, олар этиологиясы белгісіз әртүрлі ауру жағдайларын талдауда маңызды. Сонымен қатар, секвенирлеу екі әдісте де маңызды рөл атқарады. Бұл әдістерді жоғары дәлдік пен дәлдік үшін басқа жоғары өткізу қабілеттілігі әдістерімен біріктіруге болады.
QTL дегеніміз не?
QTL сандық қасиет локусын білдіреді. Бұл фенотиптік белгімен байланысты ДНҚ аймағы. Әдетте, QTL полигендік әсерлерді тудырады. QTL таралуы әртүрлі, ал QTL саны белгілі бір фенотиптік белгінің өзгеру дәрежесін болжайды. Оған қоса, олар әдетте дискретті белгілерді емес, негізгі үздіксіз белгілерді кодтайды.
QTL аймақтарын анықтау кезінде белгілі бір QTL аймағын реттілікке келтіру маңызды. Сонымен қатар, зерттеулер мен зерттеулерді жеңілдету үшін биоинформатиканың қатысуымен жалпы QTL аймақтарының реттілік деректерін реттілік және сақтау жүзеге асырылады. Біз бұл әдісті QTL картасы деп атаймыз. Одан кейін дерекқор QTL аймағы реттіліктерімен құрастырылады.
01-сурет: QTL сканерлеу
Сонымен қатар, QTL тізбектерінің қолданбалары негізінен реттілік ұқсастығын анықтауға болатын BLAST құралына негізделген. Бұл организмдер арасындағы қарым-қатынастарды шығаруда маңызды. Сонымен қатар, бұл белгілі бір полигендік фенотиптің күрделілігін анықтауда маңызды. Ол сондай-ақ белгілі бір белгінің дамуын анықтайды.
Қазіргі уақытта QTL талдауы ДНҚ микромассивтері сияқты басқа жоғары өткізу қабілеттілігі әдістерімен біріктірілген. Бұл фенотипті экспрессиялық талдауда маңызды. Қазіргі уақытта ғалымдар QTL дерекқорын жасауға қызығушылық танытуда, өйткені QTL аймақтары әртүрлі түрлердің көптеген маңызды белгілеріне жауапты.
GWAS дегеніміз не?
GWAS геномдық қауымдастықты зерттеу дегенді білдіреді. Бұл сонымен қатар геномдық ассоциацияны зерттеуге қатысты. Бұл зерттеулер негізінен бақылау зерттеулеріне бағытталған. Ол әдетте белгілі бір белгімен байланысты әртүрлі адамдардың генетикалық нұсқаларын талдайды. Сонымен қатар, бүкіл геном GWAS талдауы үшін маңызды.
02-сурет: GWAS
GWAS әртүрлі ауру жағдайларымен байланысты бір нуклеотидтік полиморфизмдерді талдаудың маңызды құралы болып табылады. Бұл сонымен қатар кең популяциядағы әртүрлі жалғыз нуклеотидтік полиморфизмдердің салыстырмалы зерттеуі. Сонымен қатар, GWAS зерттеу үлгісі өте жоғары; демек, ол сонымен қатар көлденең қималық когортты зерттеу форматын алады.
Сонымен қатар, бірінші GWAS зерттеуі миокард инфарктісіне қатысты және миокард инфарктісіне байланысты гендерді талдау болды. Қазіргі уақытта GWAS этиологиясы белгісіз күрделі аурулардың генетикалық фонын анықтауда маңызды рөл атқарады.
QTL және GWAS арасындағы қандай ұқсастықтар бар?
- Олар талдау үшін ДНҚ тізбегі деректеріне сүйенеді.
- Екеуі де әртүрлі кейіпкерлердің генетикалық фонымен байланысты.
- Сонымен қатар, олар нәтижелерді шығару және түсіндіру үшін биоинформатика құралдарын қажет етеді.
- Олар үлкен популяцияларда жасалады.
QTL мен GWAS арасындағы айырмашылық неде?
QTL байланысқан гендік локустарды пайдалана отырып, полигендік мұраға байланысты фенотиптік белгілерді талдайды, ал GWAS тұтас геномдық тізбектерді пайдалана отырып, белгілі бір жағдайдың жалғыз нуклеотидтік полиморфизмдерін талдайды. Осылайша, бұл QTL мен GWAS арасындағы негізгі айырмашылық. QTL картасы GWAS-қа қарағанда салыстырмалы түрде күрделірек әдіс, өйткені ол толық геномды секвенирлеуді қажет етеді.
Төмендегі инфографика кесте түрінде QTL және GWAS арасындағы айырмашылықты қорытындылайды.
Қорытынды – QTL және GWAS
QTL картасы және GWAS әртүрлі фенотиптік белгілердің генетикалық фонын анықтауда үлкен рөл атқарады. Олар сондай-ақ әртүрлі аурулардың генетикалық фонын талдауға көмектеседі. QTL картасы үздіксіз белгілерге жауап беретін байланыс гендерін картаға түсіреді, сонымен қатар полигендік тұқым қуалаушылық гендерін картаға түсіруді қамтиды. GWAS, екінші жағынан, бір нуклеотидтік полиморфизмдер үшін тұтас геномды талдаумен өтеді. Бұған қоса, бұл үлкен популяцияда орын алады. Осылайша, бұл QTL мен GWAS арасындағы айырмашылықтың қысқаша мазмұны.
