Мақсатты және мақсатсыз протеомиканың негізгі айырмашылығы мынада: мақсатты протеомика белгілі бір ақуыздың көптігін өлшеуге бағытталған, ал мақсатсыз протеомика белгілі бір ақуызға бағытталған емес.
Протеомика - белоктарды, олардың құрылымдарын және қызметтерін кең ауқымды зерттеу. Ол белгілі бір жағдайларда жасушадағы, ұлпадағы немесе ағзадағы ақуыздың толық комплементін зерттейді. Протеомиканың мақсатты протеомика және мақсатсыз протеомика сияқты екі түрі бар.
Мақсатты протеомика дегеніміз не?
Атауынан көрініп тұрғандай, мақсатты протеомика талдау үшін белгілі бір ақуызды немесе ақуыздардың күрделі қоспасындағы пептидті нысанаға алады. Содан кейін ол алдын ала таңдалған арнайы ақуыздың болуын және мөлшерін талдайды. Бұл әдіс тек бір үлгі үшін немесе бірнеше үлгілер бойынша мүмкін. Бұл әдіс тіпті ақуыздардың белгілі бір тобына да жарамды. Бұл дәлірек, сандық және құпия деректерге әкеледі. Сонымен қатар, мақсатты протеомикамен біріктірілген масс-спектрометрия дәлірек сенімді өлшемдерді жасайды. Бұл әдіс талдау үшін үштік төрт полюсті масс-спектрометрді (QQQ) пайдаланады.
01-сурет: Протеомика
Нысананың шын мәнінде құлағанын тексергіңіз келсе немесе қан сарысуындағы, церебральды сұйықтықтағы немесе жасуша лизатындағы белгілі бір ақуызды/пептидті және т.б. санын анықтағыңыз келсе, мақсатты протеомика қолайлы әдіс болып табылады. оны белгілі бір ақуыздың үлгілер бойынша дифференциалды түрде экспрессияланатынын немесе уақыт курсы эксперименті кезінде тексергіңіз келсе пайдаланыңыз.
Мақсатсыз протеомика дегеніміз не?
Мақсатсыз протеомика, аты айтып тұрғандай, оны талдау үшін белгілі бір ақуызды немесе пептидті бағыттамайды. Ашылу протеомикасы - мақсатсыз протеомиканың басқа атауы. Шын мәнінде, бұл «жаһандық» талдау. Әдетте, мақсатсыз протеомиканы орындау «бұл үлгіде немесе бірнеше үлгіде қандай ақуыз немесе ақуыз бар?» Деген сұраққа жауап беру болып табылады. Бұл әдіс мақсатты протеомика сияқты сезімтал емес. Бірақ ол көптеген ақуыздарды, соның ішінде жаңа ақуыздарды анықтап, өлшей алады. Мақсатсыз протеомика сандық және сапалық өлшемдерді де жасай алады.
Мақсатты және мақсатсыз протеомиканың қандай ұқсастықтары бар?
- Мақсатты және мақсатсыз протеомика үлгілердегі ақуыздарды өлшейді.
- Олар протеомды талдауда маңызды.
- Бұл әдістер масс-спектрометрияны пайдаланады.
Мақсатты және мақсатсыз протеомиканың айырмашылығы неде?
Біріншіден, мақсатты протеомика - бұл белоктардың күрделі қоспасында белгілі бір ақуыздың немесе пептидтің болуы мен мөлшерін анықтау. Керісінше, мақсатсыз протеомика - бұл белгілі бір ақуызды бағыттамай, үлгіде немесе үлгілерде бар ақуыздарды сандық және сапалық зерттеу. Мақсатты протеомика алдын ала таңдалған немесе мақсатты ақуыздармен орындалады, ал мақсатсыз протеомика осы үлгідегі ақуыздардың түрлерін білу үшін орындалады. Оның үстіне мақсатты протеомика мақсатсыз протеомикаға қарағанда сезімталырақ.
Қорытынды – мақсатты және мақсатсыз протеомика
Қорытындылайтын болсақ, мақсатты және мақсатсыз протеомика - ақуызды зерттеудің екі түрі. Олардың аттары айтып тұрғандай, мақсатты протеомика белгілі бір ақуызға бағытталған, ал мақсатсыз протеомика белгілі бір ақуызға бағытталған емес. Бұл мақсатты және мақсатсыз протеомика арасындағы айырмашылық.
