Негізгі айырмашылық – Экзома мен Транскриптом
Генде кодталатын және кодталмаған аймақтар бар. Кодтау реті экзондар, ал кодталмаған тізбектер интрондар деп аталады. Геннің экзондарының нуклеотидтер тізбегі нақты ақуызды синтездеу үшін геннің генетикалық кодын білдіреді. Демек, экзондар мРНҚ молекуласында қалады. Геномның жалпы экзон аймағы экзома ретінде белгілі және ол геномның маңызды бөлігі болып табылады. Гендердің генетикалық коды ақуызды өндіруге қажетті мРНҚ молекуласының генетикалық кодына айналады. Бір уақытта жасушада немесе жасуша популяциясында транскрипцияланған бүкіл мРНҚ молекулалары транскриптом деп аталады. Экзома мен транскриптомның негізгі айырмашылығы мынада: экзома геномның экзондық аймақтарының ретін білдіреді, ал транскриптом белгілі бір уақытта жасушаның немесе тіннің жалпы мРНҚ-сын білдіреді.
Exome дегеніміз не?
Гендер экзондардан, интрондардан және реттеуші тізбектерден тұрады. Экзондар - транскрипция кезінде мРНҚ тізбегіне транскрипцияланатын ген аймақтары. Транскрипция кезінде интрондар және басқа кодталмаған аймақтар жойылады. Экзондардың нуклеотидтер тізбегі өзі кодтайтын белгілі бір ақуызды синтездейтін геннің генетикалық кодын анықтайды. Ақуыздың мРНҚ-сында тек экзондар қалады. Геномдағы экзондар жинағы организмнің экзомасы деп аталады. Ол гендерде көрсетілген геномның бір бөлігін білдіреді. Адамдарда экзома геномның 1% құрайды. Бұл адам геномының ақуызды кодтайтын бөлігі.
01-сурет: Exome
Транскриптом дегеніміз не?
Транскриптом – берілген ұлпадағы барлық ақуызды кодтайтын және кодтамайтын транскрипттердің (РНҚ) жинағы. Транскриптом жасушадағы немесе тіндегі гендермен көрсетілген жалпы мРНҚ молекулаларының жиынтығын білдіреді. Жасушаның транскриптомы басқа жасуша түрінің транскриптомымен өзгеруі мүмкін. Транскриптом да динамикалық болып табылады – ол ішкі және сыртқы тітіркендіргіштерге жауап ретінде уақыт бойынша өзгереді. Тіпті бір ұлпаның ішінде немесе бір жасуша түрінде транскриптом бірнеше минуттан кейін өзгеруі мүмкін.
Транскриптомның организм экзомасынан айырмашылығы. Транскриптом тек экспозициялық тізбектерді қамтиды. Жасушаның экзомасы өзгеріссіз қалғанымен, транскриптом жасушаларда әр түрлі болады, өйткені геннің экспрессиясы барлық жасушалар немесе тіндер үшін бірдей емес. Әртүрлі жасушалар мен ұлпаларда тек маңызды гендер ғана экспрессияланады. Геннің экспрессиясы - бұл тіннің немесе жасуша түріне тән процесс. Ол әртүрлі факторлармен, соның ішінде қоршаған орта факторларымен реттеледі. Сондықтан транскриптом сыртқы орта жағдайларына байланысты өзгеруі мүмкін.
Транскриптом протеомиканы зерттеу үшін прекурсор ретінде пайдаланылады. Барлық белоктар мРНҚ тізбегінен алынған. Трансляциялық модификациялар белоктардың өзгеруіне әкелуі мүмкін. Дегенмен, транскриптом протеомдық зерттеулер үшін маңызды негізгі ақпаратты береді.
02-сурет: эмбриональды дің жасушаларының транскриптомы
Экзома мен Транскриптомның айырмашылығы неде?
Экзоме және транскриптом |
|
| Экзома – гендердің ақуызды кодтайтын аймағының жинағы. | Транскриптом – мРНҚ қоса алғанда, барлық транскрипцияланған РНҚ жинағы. |
| Үлгі | |
| Экзома ДНҚ үлгісі арқылы зерттеледі. | Транскриптом РНҚ үлгісі арқылы зерттеледі. |
| Оқу әдісі | |
| Бүкіл экзома тізбегі - экзоманы зерттеу әдісі. | РНҚ секвенциясы транскриптомды зерттеу әдісі болып табылады. |
Қорытынды – Экзома және Транскриптом
Экзондар гендердің кодтау тізбегі болып табылады және белоктардың мРНҚ тізбегін анықтайды. Осы кодтау тізбектерінің жинағы (экзондар) организмнің экзомасы ретінде белгілі. Гендер белоктарды жасамас бұрын мРНҚ молекулаларына транскрипцияланады. Кез келген уақытта жасушаның немесе тіннің жалпы мРНҚ молекулалары транскриптом деп аталады. Транскриптом кез келген уақытта мРНҚ-ға белсенді түрде экспрессияланатын гендерді білдіреді. Транскриптом жасуша мен ұлпаға тән және қоршаған орта жағдайларына әсер етеді. Бұл экзома мен транскриптомның айырмашылығы.
