Полисома профилін жасау мен рибосома профилін жасау арасындағы негізгі айырмашылық мынада: полисома профилі трансляция кезінде рибосома мен мРНҚ (полисома) арқылы рибосома әрекетін талдайды, ал рибосома профилі трансляция кезінде тек мРНҚ тізбегін пайдаланып рибосома әрекетін талдайды.
Аударма - мРНҚ-дағы ақпаратты аминқышқылдарының тізбегіне түрлендіретін ақуыз синтезінің екінші фазасы. Транслатомика - бұл организмнің жасушасында белсенді түрде аударылатын ORF (ашық оқу кадрлары) туралы зерттеу. Полисомалар мен рибосомаларды профильдеу әдістері - бұл транслатомды талдау контекстінде әртүрлі параметрлерді бағалау және қорытындылау үшін молекулалық биология саласындағы әдістердің екі түрі.
Полисомды профильдеу дегеніміз не?
Полисомалар профилін жасау – рибосоманың да, мРНҚ-ның да (полисома) әрекетін талдау арқылы белгілі бір мРНҚ трансляциясының күйін анықтайтын әдіс. Басқаша айтқанда, бұл әдіс мРНҚ-ның рибосомалармен байланысы туралы мәліметтер мен қорытындыларды береді. Полисома трансляцияның ұзару фазасында болатын мРНҚ-мен байланысқан рибосомалар тобын білдіреді.
01-сурет: Полизома профилін жасау
Полисомалар профилін жасау үшін жасуша лизаты қажет, содан кейін ол центрифугаланады. Содан кейін центрифугаланған үлгі рибосомалардың кіші және үлкен суббірліктерін және полисоманың түзілуіне қатысатын сәйкес мРНҚ-ны сипаттау үшін олардың тығыздықтары негізінде бөлінеді. Сонымен қатар, процесс оптикалық тығыздықты өлшеуді де қамтиды. Сарапшылар полисома профилін жасауы керек.
Полисомды профильдеу әдісі көптеген қолданбалар үшін маңызды құрал болып табылады. Ғалымдар бұл әдісті жасушалардағы аударма дәрежесін зерттеу үшін пайдаланады. Нақтырақ айтсақ, бұл жеке белоктарды және олардың спецификалық мРНҚ-ларын зерттеу туралы нақты ақпарат беруге арналған құрал. Белгілі бір мРНҚ трансляциясының дәрежесін зерттеу контекстінде полисомаларды профильдеу әдісі өте маңызды. Мұнда мРНҚ-ның 3' және 5' тізбегін олардың өндірілген мРНҚ мөлшеріне және трансляция деңгейіне әсеріне сілтеме жасай отырып зерттеуге болады.
Рибосома профилін жасау дегеніміз не?
Рибосома профилін жасау – трансляция кезінде рибосоманың мРНҚ-ға қатысты әрекетін талдайтын әдіс. Бұл әдісті Джоан Стейц пен Мэрилин Козак тауып, дамытты. Кейінірек бұл технологияны екі ғалым, Николас және Джонатан келесі буынды секвенирлеумен үйлестіре отырып, одан әрі дамытты, бұл Translating Ribosome Affinity Purification (TRAP) әдістемесі сияқты әртүрлі байланысты әдістердің дамуына әкелді.
02-сурет: Рибосомалардың реттілігі
Рибосома профилін жасау процедурасы мРНҚ-ны оқшаулауды, рибосомалармен байланыспаған РНҚ-ны жоюды және рибосомалармен байланысқан мРНҚ-ны бөлуді қамтиды. Осы процедурадан кейін мРНҚ изоляты кері транскрипцияланады және кДНҚ синтезі жүреді. Соңында, иРНҚ-ға қатысты рибосома мінез-құлқының сипаттамаларын шығару үшін реттілік деректерін трансляциялық профильмен теңестіруге болады.
Рибосомаларды профильдеу көптеген зерттеушілерге трансляцияның басталу орындарының орнын, жасушадағы немесе тіндегі аударылған ашық оқу жақтауларының (ORFs) комплементін, мРНҚ-дағы рибосомалардың таралуын және жылдамдығын анықтауға және қорытынды жасауға көмектеседі. рибосомаларды аудару. Рибосома профилін анықтау рибосома ізі немесе Ribo тізбегі ретінде де белгілі.
Полисома профилін жасау мен рибосома профилін жасаудың қандай ұқсастықтары бар?
- Полисомалар мен рибосомалардың профилін жасау - зерттеуде маңызды молекулалық биологиялық әдістер.
- Олар аударма процесі туралы ақпарат береді.
- Екі профильдеу процесі аударманы талдау арқылы деректерді береді.
- Дәл нәтиже алу үшін екі әдісті де орындау үшін кәсіби сарапшылар қажет.
- Биоинформатика құралдары екі әдісте де маңызды рөл атқарады.
Полисома профилін жасау мен рибосома профилін жасаудың айырмашылығы неде?
Полисомалар профилі трансляция кезінде рибосоманың да, мРНҚ (полисома) арқылы да рибосома әрекетін талдайды, ал рибосома профилі трансляция кезінде тек мРНҚ тізбегін пайдаланып рибосома әрекетін талдайды. Осылайша, бұл полисома профилін жасау мен рибосома профилін жасау арасындағы негізгі айырмашылық. Сонымен қатар, полисомаларды профильдеу тығыздық градиентін центрифугалау және оптикалық тығыздықты өлшеу сияқты әдістерді қамтиды, ал рибосомаларды профильдеу мРНҚ экстракциясы мен секвенирлеу әдістерін қамтиды. Сондай-ақ, рибосома профилін жасау полисома профиліне қарағанда дәлірек.
Төмендегі инфографика қатар салыстыру үшін полисома мен рибосома профилін жасау арасындағы айырмашылықтарды кесте түрінде ұсынады.
Қорытынды – Полисомалар профилі және рибосома профилі
Аударма - мРНҚ тізбегі туралы ақпаратты аминқышқылдарының тізбегіне түрлендіруді қамтитын ақуыз синтезінің екінші кезеңі. Бұл процесс үшін мРНҚ үлгісі, рибосомалар, амин қышқылдары, тРНҚ және басқа факторлар қажет. Полисома және рибосома профилін жасау екі молекулалық әдіс болып табылады. Полисомалық профильдеу трансляция кезінде рибосоманың да, мРНҚ-ның (полисоманың) екеуін де пайдалана отырып, рибосоманың әрекетін талдайды, ал рибосома профилі трансляция кезінде тек мРНҚ тізбегін пайдаланып рибосоманың әрекетін талдайды. Полисомалар профилін жасау тығыздық градиентін центрифугалау және оптикалық тығыздықты өлшеу сияқты әдістерді қамтиды. Рибосома профилін жасау мРНҚ экстракциясы, кДНҚ синтезі және секвенирлеу сияқты әдістерді қамтиды. Сонымен, бұл полисома профилі мен рибосома профилінің арасындағы айырмашылықты қорытындылайды.
