FISH пен CGH арасындағы негізгі айырмашылық мынада: FISH - флуоресцентті таңбаланған зондтарды пайдаланып хромосомадағы белгілі бір ДНҚ тізбегін анықтайтын молекулалық әдіс, ал CGH - геномдық ДНҚ өзгерістерін анықтайтын басқа молекулярлық цитогенетикалық әдіс.
Цитогенетикалық талдау медицинада аневлоидия, делеция, қайталану және қайта құрылымдау сияқты хромосомалық ауытқуларды анықтауда маңызды рөл атқарады. Хромосомалық ауытқулар ақырында қатерлі ісік, бедеулік, Даун синдромы, Клайнфельтер синдромы сияқты генетикалық ауруларға әкеледі. синдром, лейкоз және т.б. Жоғарыда аталған ақаулар мен ауруларды анықтаудың әртүрлі молекулалық цитогенетикалық әдістері бар. Олардың ішінде FISH (флуоресцентті in situ будандастыру) және CGH (салыстырмалы геномдық будандастыру) екі күшті будандастыру әдістері болып табылады. Дегенмен, екі әдістің де оң және теріс жақтары бар.
БАЛЫҚ дегеніміз не?
FISH - тіннің бір бөлігінде немесе бөлігінде, бүкіл ұлпада немесе жасушаларда орындалатын нуклеин қышқылын будандастыру әдісі. Бұл зондқа негізделген әдіс. Бұл әдіс Уотсон Криктің қосымша негізді жұптастыру теориясына байланысты, нәтижесінде ДНҚ – ДНҚ гибридтері немесе ДНҚ – РНҚ гибридтері пайда болады, осылайша мутацияланған гендерді анықтай алады немесе қызықтыратын генді анықтай алады. Әрі қарай, бұл әдіс бір тізбекті ДНҚ тізбегін, екі тізбекті ДНҚ тізбегін, бір тізбекті РНҚ тізбегін немесе гендер тізбегіне қосымша болып табылатын зондтар ретінде ник-трансляцияны пайдалана отырып дайындалған синтетикалық олигонуклеотидті пайдаланады. Сонымен қатар, бұл техниканың ең маңызды ерекшелігі зондтарды флуоресцентті бояғыштармен таңбалау болып табылады. Осылайша, зондтар хромосоманың комплементарлы бөліктерімен байланысып, анықтауды жеңілдетеді.
Сонымен қатар, FISH өте сезімтал және ерекше әдіс. Демек, бұл гематологиялық қатерлі ісіктерді және қатты ісіктерді зерттеуде де, диагностикалауда да кең таралған әдіс. Бірақ, FISH төмен ажыратымдылықты көрсетеді. Ол сондай-ақ зонд ретін жобалау үшін мақсатты ауытқуды алдын ала білуді талап етеді.
01-сурет: БАЛЫҚ
БАЛЫҚ-тың көптеген қолданулары бар, негізінен жұқпалы аурулардың молекулалық диагностикасында қоздырғыштардың болуын анықтау және патогенді молекулалық диагностика арқылы растау үшін. Сонымен қатар, FISH даму биологиясы, кариотиптеу және филогенетикалық талдау және хромосомалардың физикалық картасын жасау салаларында жиі қолданылатын әдіс болып табылады.
CGH дегеніміз не?
Салыстырмалы геномдық будандастыру (CGH) – геномдық ДНҚ тізбегінің өзгерістерін анықтай алатын басқа ДНҚ негізіндегі молекулалық цитогенетикалық әдіс. Бұл әдіс геномдық ДНҚ тізбегіндегі өзгерістерді немесе өзгерістерді анықтау үшін хромосома мен ген модификацияларын талдай алатын жетілдірілген әдіс болып табылады. Әрі қарай, CGH эксперименттік үлгіден және анықтамалық үлгіден ДНҚ-ны оқшаулауды және фрагментациялауды талап етеді. Содан кейін үлгілерді екі түрлі флуоресцентті бояғыштарды (әдетте қызыл және жасыл) пайдаланып таңбалау керек. Кейінірек екі үлгі де араласады және бәсекеге қабілетті будандастыруға рұқсат етіледі. Соңғы қадам - геннің қайталануы, геннің жоғалуы, т.б. сияқты ДНҚ өзгерістеріне үлгілерді талдау. Әсіресе, ол сынақ үлгісі мен бақылау үлгісі арасындағы ДНҚ көшірме санының айырмашылығын өлшейді.
02-сурет: CGH
CGH бағдарламасының басқа нұсқасы қазір қолжетімді; бұл қалыпты CGH қарағанда жетілдірілген әдіс. Бұл массив негізіндегі CGH немесе aCGH деп аталатын әдіс. aCGH бір экспериментте мыңдаған реттіліктегі генді немесе тізбекті жоюды дәл анықтауға мүмкіндік береді.
FISH пен CGH арасындағы қандай ұқсастықтар бар?
- FISH және CGH екі молекулалық әдіс.
- FISH және CGH екеуі де нуклеин қышқылының гибридизациясына негізделген.
- Сонымен қатар, екі әдіс те арнайы ДНҚ нысандарын анықтау үшін жобаланған зондтарды қажет етеді.
- Біз оларды генетикалық аурулардың босанғанға дейінгі және кейінгі диагностикасы үшін қолданамыз.
- Сонымен қатар, FISH және CGH екеуі де геномдық өзгерістерді зерттеуге арналған өте күшті құрал.
- Олар зондтарды белгілеу үшін флуоресцентті бояғыштарды пайдаланады.
FISH пен CGH арасындағы айырмашылық неде?
FISH - нақты ДНҚ тізбектерін анықтау үшін флуоресцентті зондтарды пайдаланатын in situ будандастыру процедурасы, ал CGH - геномдық ДНҚ реттерінің өзгерістерін анықтайтын молекулалық будандастыру әдісі. Демек, бұл FISH пен CGH арасындағы негізгі айырмашылық.
Сонымен қатар, FISH зонд тізбегін жобалау үшін мақсатты ауытқуды алдын ала білуді талап етеді, ал CGH алдын ала білімді қажет етпейді. Сондай-ақ, FISH пен CGH арасындағы тағы бір айырмашылық мынада: FISH шектеулі ажыратымдылықты көрсетеді, ал aCGH жоғары ажыратымдылықты көрсетеді.
Төмендегі инфографика FISH пен CGH арасындағы айырмашылықты қорытындылайды.
Қорытынды – FISH және CGH
FISH және CGH - қызығушылық тудыратын гендік тізбектерді анықтауды жеңілдететін екі молекулалық цитогенетикалық әдіс. FISH флуоресцентті таңбаланған зондтарды пайдаланып хромосомадағы нақты ДНҚ тізбегін анықтауды жеңілдетеді, ал CGH геномдық ДНҚ өзгерістерін анықтауды жеңілдетеді. Демек, бұл FISH пен CGH арасындағы негізгі айырмашылық.
