Негізгі айырмашылық – Метаболомика мен Метабономика
Метаболиттер – жасушалардағы зат алмасу реакцияларына қатысатын шағын молекулалар. Метаболиттерге зат алмасудың аралық өнімдері, гормондар, екіншілік метаболиттер, сигналдық молекулалар және т.б. жатады. Олар жасушалардың биохимиялық реакцияларының жұмыс істейтін молекулалары болып табылады. Биологиялық үлгінің немесе бір организмнің метаболиттерінің толық жиынтығы метаболом деп аталады. Метаболома - денеде секунд сайын өзгеретін динамикалық жинақ. Метаболомика және метабономика - бұл организмнің метаболомасын зерттеуге қатысты екі термин. Метаболомика мен метабономика арасындағы негізгі айырмашылық мынада: метаболомика жасушалық немесе органдық деңгейде қалыпты эндогендік метаболизмге және метаболикалық профильге көбірек көңіл бөледі, ал метабономика қоршаған орта факторларына, ауруларға, ішектерге байланысты метаболизмнің бұзылуы туралы ақпаратпен метаболикалық профильді кеңейтуге көбірек қатысты. микроорганизмдер және метаболикалық профильді салыстыру және т.б. Метаболомика негізінен масс-спектрометрияға негізделген, ал метабономика метаболиттерді талдау үшін ЯМР спектроскопиясын пайдаланады.
Метаболомика дегеніміз не?
Метаболомика - бұл жасушаларда, биологиялық сұйықтықтарда, ұлпаларда немесе ағзаларда болатын метаболикалық процестерді зерттейді. Ол жақсы аналитикалық және статистикалық құралдарды пайдалана отырып, жасушалық метаболиттерді анықтауды және санын анықтауды қамтиды. Метаболомика маңызды зерттеу болып саналады, өйткені ол ағзадағы зат алмасу туралы ақпаратты ашады.
Субстраттар мен метаболикалық реакциялардың өнімдерін зерттеу үшін метаболомика аналитикалық платформа ретінде масс-спектрометрияны пайдаланады. Масс-спектрометрия жасушалардың немесе тіндердің нақты биохимиялық күйін көрсететін метаболиттердің түрлерін және олардың концентрациясын анықтайды. Демек, метаболомиканы организмнің молекулалық фенотипінің ең жақсы өкілі деп санауға болады. Метаболомика - бұл организмдердің кіші молекулаларының омикалық технологиясы және басқа омикалық зерттеулермен салыстырғанда; метаболомика өте маңызды, өйткені ол жасушалардың биохимиялық реакциясының ағымдағы күйін тікелей көрсетеді.
Метаболомиканы протеомиканың жалғасы ретінде де қарастыруға болады, себебі олар келесі суретте көрсетілгендей белоктар болып табылатын ферменттердің белсенділігіне байланысты түзіледі.
01-сурет: Метаболомика схемасы
Метабономика дегеніміз не?
Метабономика патофизиологиялық күйзелістерге немесе генетикалық модификацияға қатысты белгілі бір уақыттағы көп параметрлі метаболикалық жауаптардың сандық өлшемі ретінде анықталады. Бұл әдетте адамның тамақтануы және есірткіге немесе ауруға жауаптары туралы жүргізілген зерттеулерге қолданылады. Бұл тәсілді Лондондағы Императорлық колледжде Джереми Николсон ұсынған және ол токсикология, ауруларды диагностикалау, тамақтану және т.б. сияқты бірқатар салаларда қолданылған. Тарихи тұрғыдан метабономика жүйелік биология саласын зерттеулерге қолданудың алғашқы әдістерінің бірі болды. метаболизм.
Метабономика метаболомикадағы жеке метаболикалық қосылыстарды анықтаудан гөрі биохимиялық профильдерді салыстыруға көбірек көңіл бөледі. Сондықтан метабономиканы метаболомиканың ішкі жиынтығы ретінде анықтауға болады. Ол негізінен әртүрлі популяциялардың метаболикалық профильдерін ауруларға, қоршаған ортаның күйзелістеріне, генетикалық модификацияға, тамақтануға, дәрілік заттарға және т.б. қатысты салыстыруға баса назар аударады. Өйткені метаболиттер аурудың жағдайын, дәрілік заттардың әсерін, қоршаған ортаның күйзелістерін, токсиндердің әсерін көрсететін жақсы маркерлер болып табылады., т.б.
Метабономикалық зерттеулер жасушаішілік және жасушадан тыс метаболиттерді анықтайды. Ол жасушалардың физиологиялық күйін уақытша зерттеуге мүмкіндік беретін метаболиттердің үлкен санын бір уақытта және қайталап талдау үшін жоғары өткізу қабілеттілігін пайдаланады. Ол сондай-ақ метаболиттер мен ағзаның патологиялық жағдайы арасындағы корреляцияны анықтайды. Метабономикалық зерттеулерді қолдау үшін геномика мен протеомиканы қолдануға болады, өйткені олар жоғарыдағы суретте көрсетілгендей өзара байланысты.
Метаболомика мен метабономиканың айырмашылығы неде?
Метаболомика және Метабономика |
|
| Метаболомика – организм метаболиттерінің толық жиынтығын зерттейтін ғылым | Метабономика – патофизиологиялық ынталандыруға немесе генетикалық модификацияға уақытша негізде тірі жүйелердің көп параметрлі метаболикалық жауаптарын сандық зерттеу. |
| Негізгі алаңдаушылық | |
| Metabolomics метаболизм профилін жасаумен және жасушаларда бар жеке метаболиттерді анықтаумен көбірек айналысады. | Метабономика популяциялардың метаболиттерін немесе метаболикалық профильдерін генетикалық модификацияларға, ауруларға, қоршаған ортаның күйзелістеріне, патологиялық ынталандыруларға, дәрілерге және т.б. салыстыруға көбірек қатысты. |
| Ақпарат | |
| Метаболомика негізінен эндогендік метаболизмге бағытталған. | Метабономика эндогендік метаболизммен шектелмейді. Ол диета, токсиндер, ауру процестері және т.б. сияқты ішкі және сыртқы факторлардан туындаған метаболизмнің бұзылуы туралы ақпаратты табуға мүмкіндік береді. |
| Аналитикалық құралдар | |
| Ол негізгі аналитикалық платформа ретінде масс-спектрометрияны пайдаланады | Метабономика негізгі аналитикалық платформа ретінде ЯМР спектроскопиясын пайдаланады. |
Қорытынды – Метаболомика және Метабономика
Метаболома жасушада немесе ағзада болатын метаболиттер деп аталатын шағын молекулалардың толық жиынтығын білдіреді. Метаболомика - бұл метаболизм профилін жасау үшін бүкіл метаболоманы зерттеу. Метаболомика ғалымдарға жасушаның немесе ағзаның нақты физиологиялық күйін өлшеуге мүмкіндік береді. Метабономика - патофизиологиялық ынталандыруларға және генетикалық модификацияларға тірі жүйелердің көппараметрлі метаболикалық жауаптары туралы ақпаратты шығаруға арналған метаболомика бөлігі. Метабономика метаболомика сияқты жеке метаболикалық профильдеуге ғана қатысты емес; ол метаболикалық профильдерді қоршаған ортаның күйзелістері, аурулар, токсиндер және т.б. сияқты басқа факторларға қатысты салыстырады. Метаболомика да, метабономика да жасушалардың нақты физиологиялық күйін өлшеу үшін организмдердің метаболиттерін зерттеуді қамтиды. Демек, кейде бұл екеуі метаболомика мен метабономика арасындағы айырмашылықты ескермей, синонимдер ретінде қарастырылады.
