Сақталған және консенсус тізбегі арасындағы негізгі айырмашылық мынада: консервіленген реттілік нуклеин қышқылдарының немесе аминқышқылдарының әртүрлі немесе бірдей түрлерде ұрпақтар бойына болатын ұқсас тізбегіне жатады, ал консенсус тізбегі жиі кездесетін нуклеотидтер тізбегі немесе табылған аминқышқылдарының тізбегі болып табылады. ДНҚ немесе РНҚ немесе ақуыздың жоғары сақталған аймағында.
Ағзалар ұқсас және әртүрлі сипаттармен бөліседі. Организмдер арасындағы қарым-қатынастарды зерттеп, оларды классификациялағанда организмдердің геномы немесе генетикалық құрылымы өте маңызды. Әртүрлі организмдер арасында кең таралған кейбір нуклеотидтер немесе аминқышқылдарының тізбегі бар. Консервіленген реттілік - түрлер арасында сәйкес келетін нуклеин қышқылы немесе аминқышқылдарының тізбегі. Сондықтан олар филогенетикалық ағаштарды тудырғанда филогенетикалық маңызды. Консервіленген тізбектерде жиірек кездесетін арнайы нуклеотидтер тізбегі бар. Олар консенсус тізбегі ретінде белгілі.
Сақталған реттілік дегеніміз не?
Сақталған реттілік - түрлер арасында ұқсас нуклеин қышқылының тізбегі немесе аминқышқылдарының тізбегі. Сондықтан ол эволюцияның барлық түрлерінде сәйкес келеді. Әдетте, бұл тізбектер табиғи сұрыптау арқылы сақталады. Олар филогенетикалық ағаштың артындағы өзгеріссіз қалады. Демек, сақталған тізбектер филогенетикалық ағаштарды құруда маңызды. Жоғары сақталған тізбектер жиі маңызды функционалдық мәнге ие болады деп есептеледі. Олар генетикалық ауруларды анықтауда да пайдалы. Дегенмен, сақталған тізбектер кодталатын немесе кодталмаған нуклеин қышқылының тізбектері болуы мүмкін. Сонымен қатар, сақталған тізбектер мутацияның баяу жылдамдығын көрсетеді. Демек, олар өздерінің құрамында өте аз өзгерістерді көрсетеді; кейде олар ұрпақ бойына өзгерістерді көрсетпейді.
01-сурет: Сақталған реттілік
Рибосомалардың РНҚ компоненттері өмірдің барлық салаларында бар, эукариоттардағы гомеобокс тізбегі және бактериялардағы tmRNA жоғары сақталған тізбектердің бірнеше мысалы болып табылады. Сақталған тізбектерді анықтау биоинформатика тәсілдерін, әсіресе ретті туралау құралын пайдаланған кезде оңай. Сонымен қатар, бірнеше ретті туралау сақталған реттіліктердің визуализациясын жеңілдетеді.
Консенсус тізбегі дегеніміз не?
Консенсус тізбегі – бұл ДНҚ немесе РНҚ-ның белгілі бір сақталған аймағында жиі кездесетін реттілік. Бұл өте ерекше нуклеотидтер тізбегі. Мысал ретінде, E. coli промоторларында TATAAT (Pribnow қорабы) ретінде -10-да консенсус тізбегі бар, олар жоғары сақталған тізбектер болып табылады. Сол сияқты, тағы бір консенсус тізбегі бар: E. coli промоторларында TTGACA -35-те. Консенсус тізбегі "қораптар" ретінде де белгілі.
02-сурет: консенсус тізбегі
ДНҚ мен РНҚ-дан басқа, ақуыздарда аминқышқылдарының консенсус тізбегі де болады. Ақуыздарды байланыстыру орындары жиі консенсус тізбегі арқылы ұсынылған. Шектеу ферменттерінің де консенсус тізбегі болады. Сонымен қатар, қосылыс орындары да консенсус тізбегі болып табылады. Сақталған тізбектерге ұқсас, консенсус реттілігін биоинформатика құралдары арқылы есептеуге және көруге болады.
Сақталған және консенсус реттілігінің қандай ұқсастықтары бар?
- Сақталған және консенсус тізбегі түрлерде жиі кездесетін нуклеин қышқылы немесе аминқышқылдарының тізбегі.
- Сақталған және консенсус реттілігін биоинформатика құралдары арқылы көруге болады.
- Олар молекулалық биологияда кеңінен қолданылады.
Сақталған және консенсус реттілігінің айырмашылығы неде?
Сақталған тізбек - бұл түрлер арасында сәйкес келетін нуклеин қышқылы немесе аминқышқылдарының тізбегі, ал консенсус тізбегі өте ерекше және белгілі бір сақталған аймақта жиі кездесетін негіздер немесе аминқышқылдары. Сонымен, бұл сақталған және консенсус тізбегі арасындағы негізгі айырмашылық. Сонымен қатар, консервіленген және консенсус тізбегі арасындағы тағы бір айырмашылық консервленген тізбектердің филогенетикалық маңыздылығы болып табылады, ал консенсус тізбегі көбінесе ақуыздарды байланыстыру орындары, түйісу орындары, шектеу ферменттерін кесу орындары және т.б. болады.
Қорытынды – Сақталған және консенсус тізбегі
Сақталған тізбектер - тірі түрлер арасында ұқсас нуклеин қышқылдарының немесе ақуыздардың тізбегі. Промотор, рибосоманы байланыстыру орны, репликацияның шығу тегі және гистон протеинінің аминқышқылдарының тізбегі сақталған тізбектердің бірнеше мысалы болып табылады. Керісінше, консенсус тізбегі белгілі бір сақталған тізбекте жиі кездесетін ерекше негіздер немесе аминқышқылдары болып табылады. -10 қорап, -35 қорап E. coli промоторы, ақуызды байланыстыру орындары, қосылыс орындары және тораптарды танитын шектеу ферменттері консенсус реттілігінің бірнеше мысалдары болып табылады. Осылайша, бұл сақталған және консенсус тізбегі арасындағы айырмашылықтың қысқаша мазмұны.
