Олигопептид пен полипептидтің негізгі айырмашылығы - олигопептидтерде аминқышқылдарының аз қалдықтары, ал полипептидтерде аминқышқылдарының қалдықтары көп.
Олигопептидтер және полипептидтер терминдері белоктар санатына жатады. Пептидтер – аминқышқылдарының қысқа тізбегі. Аминқышқылдары бір-бірімен пептидтік байланыс арқылы байланысады. Сондықтан біз бұл пептидтерді осы пептидтердегі аминқышқылдарының санына қарай жіктей аламыз. Мысалы, дипептидтер, трипептидтер, тетрапептидтер, олигопептидтер және полипептидтер.
Олигопептид дегеніміз не?
Олигопептид – бір молекулада аздаған аминқышқылдары бар аминқышқылдарының тізбегі. Біз бұл молекулаларды жалпы термин ретінде «пептидтер» деп атаймыз. Бұл пептидтік молекулалардағы аминқышқылдарының қалдықтарының саны екіден жиырмаға дейін аминқышқылдары болуы мүмкін. Олигопептидтер сонымен қатар дипептидтер, трипептидтер және т.б. сияқты кейбір шағын пептидтік формаларды қамтуы мүмкін. Табиғи түрде кездесетін олигопептидтердің кейбір жалпы мысалдарына микровиридин, цианопептолиндер, микроцистиндер және т.б. жатады.
01-сурет: трипептидтің құрылымы
Бұл олигопептидтер рибосомалық емес пептидтер синтазалары немесе NRPS арқылы өндіріледі. Бірақ кейбір ерекшеліктер бар. Мысалы, цикламидтер мен микровиридин рибосомалық жолдар арқылы синтезделеді. Олигопептидтерді оқшаулау процесі олигопептидті байытуды, тазартуды және идентификацияны қамтиды. Идентификация процесі үшін гель хроматографиясын, HPLC, HPLC-масс-спектроскопияны, ион алмасу хроматографиясын және т.б.
Полипептид дегеніміз не
Полипептид – құрамында аминқышқылдарының көп мөлшері бар аминқышқылдарының қалдықтарының тізбегі. Ақуызда бір немесе бірнеше полипептидтік тізбектер бар. Бұл полипептидтік тізбектерде аминқышқылдары бір-бірімен ковалентті химиялық байланыстардың бір түрі болып табылатын пептидтік байланыстар арқылы байланысады. Әрбір полипептидтік тізбек екі терминалдан тұрады: N-терминал және С-терминал. N-терминал бос амин тобымен аяқталатын амин-терминал, ал С-терминал бос карбоксил тобымен аяқталатын карбоксил-терминал. Пептидтегі аминқышқылдарының тізбегі үлгі тізбегін аудару арқылы полипептидті немесе ақуызды өндіруге қатысатын мРНҚ-дағы кодондармен анықталады.
Белоктағы полипептидтердің саны мен орналасуына сәйкес белок құрылымдарының төмендегідей төрт негізгі түрі бар:
- Негізгі құрылым – ақуыздың бастапқы құрылымында бір тізбектегі кейбір амин қышқылдары арасында дисульфидті көпірлері бар жалғыз полипептид тізбегі бар, ол бүктелген құрылымды жасайды.
- Қосымша құрылым – Ақуыздың қайталама құрылымының екі негізгі формасы бар: альфа-спираль құрылымы және бета-парақ құрылымы.
02-сурет: Альфа спираль құрылымы
- Үшінші құрылым – Бұл жоғары бүктелген желі құрылымы. Бұл құрылым өте маңызды, себебі ол ақуыздың қызметін анықтайды.
- Төрттік құрылым – бұл бір-бірімен байланысқан екі немесе үш полипептидтік тізбектердің өте күрделі құрылымы.
Олигопептид пен полипептидтің айырмашылығы неде?
Олигопептидтер мен полипептидтер белоктардың екі түрлі санаты. Олар бір-бірінен белок молекулаларындағы аминқышқылдарының қалдықтарының санына байланысты ерекшеленеді. Сондықтан олигопептид пен полипептидтің негізгі айырмашылығы олигопептидтердің құрамында аминқышқылдарының аздығы, ал полипептидтердің құрамында аминқышқылдарының қалдықтары көп болуы.
Төмендегі инфографика олигопептид пен полипептид арасындағы айырмашылықты қорытындылайды.
Қорытынды – Олигопептид пен полипептид
Олигопептидтер мен полипептидтер белоктардың екі түрлі санаты. Бұл ақуыз молекулаларында болатын аминқышқылдарының қалдықтарының санына байланысты олар бір-бірінен ерекшеленеді. Яғни, олигопептид пен полипептидтің негізгі айырмашылығы олигопептидтерде аминқышқылдарының аз қалдықтары бар, ал полипептидтерде аминқышқылдарының қалдықтары көп.
